annotate test-data/I.vcf @ 2:aea952be68cb draft

"planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit cd8f633245d53cf47eaf860a4e0ae8d806c34419"

##fileformat=VCFv4.2
##FILTER=<ID=PASS,Description="All filters passed">
##reference=hg38
##source=varscan.py
##contig=<ID=chr1,length=248956422>
##contig=<ID=chr10,length=133797422>
##contig=<ID=chr11,length=135086622>
##contig=<ID=chr12,length=133275309>
##contig=<ID=chr13,length=114364328>
##contig=<ID=chr14,length=107043718>
##contig=<ID=chr15,length=101991189>
##contig=<ID=chr16,length=90338345>
##contig=<ID=chr17,length=83257441>
##contig=<ID=chr18,length=80373285>
##contig=<ID=chr19,length=58617616>
##contig=<ID=chr2,length=242193529>
##contig=<ID=chr20,length=64444167>
##contig=<ID=chr21,length=46709983>
##contig=<ID=chr22,length=50818468>
##contig=<ID=chr3,length=198295559>
##contig=<ID=chr4,length=190214555>
##contig=<ID=chr5,length=181538259>
##contig=<ID=chr6,length=170805979>
##contig=<ID=chr7,length=159345973>
##contig=<ID=chr8,length=145138636>
##contig=<ID=chr9,length=138394717>
##contig=<ID=chrM,length=16569>
##contig=<ID=chrX,length=156040895>
##contig=<ID=chrY,length=57227415>
##filter="SOMATIC"
##INFO=<ID=INDEL,Number=0,Type=Flag,Description="Indicates that the variant is an INDEL">
##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Total depth of quality bases">
##INFO=<ID=SOMATIC,Number=0,Type=Flag,Description="Indicates if record is a somatic mutation">
##INFO=<ID=SS,Number=1,Type=String,Description="Somatic status of variant (0=Reference,1=Germline,2=Somatic,3=LOH, or 5=Unknown)">
##INFO=<ID=SSC,Number=1,Type=String,Description="Somatic score in Phred scale (0-255) derived from somatic p-value">
##INFO=<ID=GPV,Number=1,Type=Float,Description="Fisher's Exact Test P-value of tumor+normal versus no variant for Germline calls">
##INFO=<ID=SPV,Number=1,Type=Float,Description="Fisher's Exact Test P-value of tumor versus normal for Somatic/LOH calls">
##FILTER=<ID=str10,Description="Less than 10% or more than 90% of variant supporting reads on one strand">
##FILTER=<ID=indelError,Description="Likely artifact due to indel reads at this position">
##FILTER=<ID=VarCount,Description="Fewer than 4 variant-supporting reads">
##FILTER=<ID=VarFreq,Description="Variant allele frequency below 0.05">
##FILTER=<ID=VarAvgRL,Description="Average clipped length of variant-supporting reads < 90">
##FILTER=<ID=VarReadPos,Description="Relative average read position < 0.1">
##FILTER=<ID=VarDist3,Description="Average distance to effective 3' end < 0.1">
##FILTER=<ID=VarMMQS,Description="Average mismatch quality sum for variant reads > 100">
##FILTER=<ID=VarMapQual,Description="Average mapping quality of variant reads < 15">
##FILTER=<ID=VarBaseQual,Description="Average base quality of variant reads < 15">
##FILTER=<ID=Strand,Description="Strand representation of variant reads < 0.01">
##FILTER=<ID=RefAvgRL,Description="Average clipped length of ref-supporting reads < 90">
##FILTER=<ID=RefReadPos,Description="Relative average read position < 0.1">
##FILTER=<ID=RefDist3,Description="Average distance to effective 3' end < 0.1">
##FILTER=<ID=RefMapQual,Description="Average mapping quality of reference reads < 15">
##FILTER=<ID=RefBaseQual,Description="Average base quality of ref-supporting reads < 15">
##FILTER=<ID=RefMMQS,Description="Average mismatch quality sum for ref-supporting reads > 100">
##FILTER=<ID=MMQSdiff,Description="Mismatch quality sum difference (var - ref) > 50">
##FILTER=<ID=MinMMQSdiff,Description="Mismatch quality sum difference (var - ref) < 50">
##FILTER=<ID=MapQualDiff,Description="Mapping quality difference (ref - var) > 50">
##FILTER=<ID=MaxBAQdiff,Description="Average base quality difference (ref - var) > 50">
##FILTER=<ID=ReadLenDiff,Description="Average supporting read length difference (ref - var) > 0.25">
##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype code">
##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype quality">
##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read depth">
##FORMAT=<ID=AD,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele">
##FORMAT=<ID=ADF,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele on the forward strand">
##FORMAT=<ID=ADR,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele on the reverse strand">
#CHROM	POS	ID	REF	ALT	QUAL	FILTER	INFO	FORMAT	TUMOR
chr1	269731	.	G	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.016586;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:9,2:16,5
chr1	271443	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0016182;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,11:15,4:12,7
chr1	1248267	.	A	AC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.14221;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:6,1:17,3
chr1	2020828	.	A	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00080797;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:13,4:12,7
chr1	2085733	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.012493;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:16,2:18,5
chr1	2348700	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0026931;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:5,6:9,5
chr1	2366985	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.034197;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:13,3:13,3
chr1	2658795	.	A	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:9,4:0,0
chr1	2672087	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.11845;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:12,3:17,2
chr1	3668055	.	C	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00031346;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:10,5:9,8
chr1	4066911	.	A	ACT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.037185;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:5,3:4,3
chr1	4111429	.	A	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0011142;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:14,6:10,2
chr1	4206589	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.00094617;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:33,15:17,7:16,8
chr1	6498731	.	TACGGG	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00022147;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:13,4:12,6
chr1	8327243	.	C	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=7.8465e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:11,10:13,4
chr1	8556639	.	A	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.000154;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:10,3:10,6
chr1	9108397	.	G	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.025922;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:14,2:9,2
chr1	10758330	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.081016;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,7:14,4:3,3
chr1	10791081	.	C	CA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.034636;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:14,2:6,3
chr1	10964151	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00022074;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:13,7:10,6
chr1	11877601	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0019011;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:10,3:14,6
chr1	12888921	.	T	TCC	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.041789;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:8,3:6,2
chr1	12938147	.	C	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.049083;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:15,1:16,8
chr1	13070264	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.12114;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:8,2:14,2
chr1	13369246	.	T	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.045787;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:12,5:15,4
chr1	13597732	.	G	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0010783;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:14,6:7,5
chr1	14557666	.	G	GTGTGGT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.10745;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,4:14,2:13,2
chr1	14883334	.	G	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:2,2:3,1
chr1	15206627	.	T	TGTGTTTAGGAATCGGGTGAGTTTA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0062786;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:5,6:14,4
chr1	16180433	.	A	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.27778;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:3,2:2,1:1,1
chr1	16356168	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.035315;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:11,2:4,6
chr1	16408869	.	CAAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.010143;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,8:7,7:1,1
chr1	16509718	.	T	A	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.026634;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:60,17:33,8:27,9
chr1	16509719	.	C	A	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.039535;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:59,17:32,8:27,9
chr1	16512994	.	A	G	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.0097219;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:46,17:19,8:27,9
chr1	16513547	.	G	A	0	PASS	DP=216;GPV=1;SPV=0.044761;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:130:114,16:61,7:53,9
chr1	16513636	.	C	T	0	PASS	DP=178;GPV=1;SPV=0.010031;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:80,22:43,10:37,12
chr1	16564382	.	G	C	0	PASS	DP=264;GPV=1;SPV=0.037792;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:156:134,22:85,12:49,10
chr1	16601216	.	C	A	0	PASS	DP=226;GPV=1;SPV=0.018555;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:129:103,26:39,14:64,12
chr1	16725350	.	C	T	0	PASS	DP=273;GPV=1;SPV=0.0084694;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:157:130,27:60,9:70,18
chr1	16934842	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.34103;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:17,4:9,3:8,1
chr1	16947468	.	C	CAAT	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.041416;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:41,9:17,4:24,5
chr1	17357944	.	A	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.071318;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:13,1:7,3
chr1	17444539	.	T	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.036825;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:4,6:8,2
chr1	17524364	.	T	TACAC	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.049774;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,6:3,5:3,1
chr1	18060769	.	T	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.034015;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:11,8:7,4
chr1	18273462	.	C	CTCTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.040038;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,6:2,5:7,1
chr1	18474502	.	G	GTC	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.14244;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:39,5:16,3:23,2
chr1	20011131	.	C	CA	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.015316;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:9,8:16,2
chr1	20035496	.	A	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00017262;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:12,7:13,6
chr1	20668564	.	C	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=5.9655e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:9,8:14,6
chr1	21214809	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.00085614;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,15:5,11:4,4
chr1	22069170	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0081269;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,5:2,2:2,3
chr1	23142700	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:1,2:0,1:1,1
chr1	23992096	.	T	TTTC	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0016669;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,13:5,7:9,6
chr1	24017891	.	T	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:3,3:5,1
chr1	24196544	.	A	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:19:0,2:0,2:0,0
chr1	24553122	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.021038;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,2:7,2
chr1	27489252	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.039732;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,5:2,4:4,1
chr1	27666312	.	A	AAT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
chr1	28658736	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.022713;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:13,5:11,2
chr1	30487019	.	C	CAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,9:5,7:4,2
chr1	31251996	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.090497;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:3,4:20,1
chr1	31552470	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00017822;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:19,10:8,2
chr1	32093399	.	CT	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:1,2:4,2
chr1	32753269	.	G	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0057147;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,16:11,11:2,5
chr1	32976485	.	A	AACACACACAC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.019565;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,5:6,2:2,3
chr1	33052839	.	T	TG	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.064526;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:21,3:6,1
chr1	33052861	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.041383;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:16,4:7,3
chr1	33826414	.	G	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.001327;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:8,7:9,8
chr1	35015945	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,11:6,9:5,2
chr1	36129412	.	T	TA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.043842;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:8,4:4,2
chr1	37078450	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:2,5:1,4:1,1
chr1	39941007	.	C	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00031349;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:33,11:19,3:14,8
chr1	41301699	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.014318;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:8,6:5,3
chr1	41506602	.	T	TG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:1,2:0,1:1,1
chr1	42335809	.	T	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:2,2:0,1:2,1
chr1	42750999	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.099099;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:10,3:8,1
chr1	43141270	.	C	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00068429;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:10,7:13,4
chr1	43670556	.	A	ATTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10577;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,5:3,1:3,4
chr1	44844402	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.016858;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,5:6,2:3,3
chr1	44913110	.	A	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,4:6,1:3,3
chr1	45750823	.	G	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0014366;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:11,5:25,6
chr1	46241374	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:4,2:12,2
chr1	46501126	.	C	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.02037;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:2,3:7,2
chr1	47880999	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00072376;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:27,16:20,8:7,8
chr1	48083307	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.062714;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:5,4:7,2
chr1	48383028	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.14022;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:6,1:16,4
chr1	50527811	.	G	GTCTCTC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.091143;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,6:9,4:8,2
chr1	51721990	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0011981;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:16,10:15,2
chr1	53100726	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.077195;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,5:9,3:9,2
chr1	54235448	.	ATTT	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:5,3:4,2
chr1	54539667	.	CTA	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.021052;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:11,3:15,4
chr1	55252557	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=3.545e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:9,6:9,8
chr1	55420073	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:10,3:5,1
chr1	56118818	.	CAAATAAAATA	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.014795;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:11,3:11,6
chr1	57153623	.	GT	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.077619;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:23,1:16,4
chr1	58373169	.	C	CTTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13025;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:9,3:4,2
chr1	58375665	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.036825;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:8,5:4,3
chr1	58713853	.	A	AG	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.21475;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,4:12,2:9,2
chr1	60146729	.	G	GT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.038921;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,5:4,4:3,1
chr1	60858389	.	GGTGTGTGTGTGT	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.04735;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,12:8,10:2,2
chr1	62125264	.	C	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.041958;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,5:2,4:2,1
chr1	62324554	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.057396;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:20,3:3,2
chr1	62465482	.	A	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.27273;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:4,2:1,1:3,1
chr1	64016839	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.040129;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:11,8:9,7
chr1	65472411	.	A	AACACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.12189;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:6,1:14,4
chr1	66130826	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0063293;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:13,5:10,4
chr1	66675541	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0024902;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,8:2,2:1,6
chr1	66892898	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.084757;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:17,2:11,2
chr1	67205911	.	C	CTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.19154;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,4:5,1:16,3
chr1	67299917	.	C	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.087902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:21,3:10,1
chr1	67337901	.	T	TA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.030984;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:9,1:9,4
chr1	67446182	.	C	CA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,3:7,1
chr1	68038858	.	T	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.014127;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:11,4:9,5
chr1	68705885	.	C	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.11622;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:13,2:14,2
chr1	68705887	.	G	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.10931;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:16,2:14,2
chr1	69778971	.	T	TACACACAC	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:8,2:4,2
chr1	70264475	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.015535;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:3,8:5,1
chr1	70770214	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00023235;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:11,6:7,5
chr1	70981320	.	CTTCTTTCT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.015561;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,8:0,1:9,7
chr1	71570644	.	C	CTTATTA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.011427;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:7,3:10,6
chr1	72831384	.	A	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00046753;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:11,4:14,7
chr1	73957635	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.010972;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:35,10:30,7:5,3
chr1	75795181	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,4:5,3:4,1
chr1	75840369	.	GGGACATGGATGAAATT	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.037594;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:7,3:11,1
chr1	75878828	.	GAA	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0020556;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,14:5,8:9,6
chr1	76123819	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.00039496;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,16:3,10:3,6
chr1	76202268	.	A	ATGTGTGTG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.070566;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,6:11,2:9,4
chr1	76936953	.	G	GGCGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.014907;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:6,4:1,1
chr1	77423219	.	T	TAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.018778;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,7:2,6:3,1
chr1	78025354	.	GA	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0013772;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,15:6,12:3,3
chr1	78400057	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.072018;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:8,5:5,1
chr1	79093208	.	C	CTGTG	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.23663;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,4:9,3:7,1
chr1	79919640	.	A	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.010374;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:5,3:4,6
chr1	80114791	.	A	AT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.01018;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:13,6:5,5
chr1	81343072	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.057118;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:4,5:9,1
chr1	81557460	.	A	AAAGAAAG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.046752;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,7:7,4:6,3
chr1	82163900	.	CAATA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.008557;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:6,7:8,5
chr1	83122032	.	TTGTGTG	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.045217;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:7,4:3,2
chr1	83892925	.	AAAG	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,4:5,3:10,1
chr1	84508565	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.044393;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:18,5:12,2
chr1	85084250	.	GTATA	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:3,10:1,8:2,2
chr1	85996536	.	T	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.008646;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:4,4:9,4
chr1	88539041	.	ATGTGTG	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.02381;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:1,4:1,4:0,0
chr1	90378989	.	AC	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.049659;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:12,1:13,4
chr1	90522609	.	G	GATAA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0008665;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,11:10,8:11,3
chr1	90826152	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.036825;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:12,13:4,9:8,4
chr1	90826155	.	T	TACAC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.029565;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,9:4,6:6,3
chr1	90891794	.	C	CG	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:0,4:4,1
chr1	91929065	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.25989;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:10,2:15,2
chr1	91958214	.	C	CTTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.03148;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,9:5,5:11,4
chr1	92586588	.	G	GTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,8:2,4:2,4
chr1	96450604	.	CAA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.12042;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,7:12,3:4,4
chr1	97342390	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00051949;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:13,4:8,5
chr1	97735685	.	CATAA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.040656;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:8,5:7,1
chr1	98255236	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=7.2707e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:24,15:10,6:14,9
chr1	98492648	.	A	AT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.045397;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:12,6:7,2
chr1	98973303	.	GGTAAATGTAGGGATTGACAGTAGGAAGAGAATACC	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.036957;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:9,4:11,3
chr1	100843450	.	T	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:2,1:4,1
chr1	101521631	.	C	CGT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.019341;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,9:9,7:2,2
chr1	101814986	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.002513;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:12,4:12,6
chr1	102494919	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.027663;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:13,3:19,3
chr1	102839949	.	GC	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=5.174e-05;SS=2;SSC=42;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:9,6:16,7
chr1	103125344	.	A	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.029259;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:11,3:8,4
chr1	104209755	.	A	AT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.015718;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:1,4:4,3
chr1	105484294	.	GT	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00063127;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:5,4:10,6
chr1	106356046	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0089499;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:13,3:15,5
chr1	107319867	.	A	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.029166;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:13,4:11,2
chr1	107813967	.	AGT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0070965;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,8:5,4:2,4
chr1	108970973	.	T	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.035079;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:17,1:13,5
chr1	109654189	.	AG	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:10,4:1,0
chr1	109654217	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.024318;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:11,7:0,1
chr1	110568000	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0016408;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:17,5:8,4
chr1	110800558	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00069928;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:10,4:11,7
chr1	111065378	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.00095261;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:2,9:0,7:2,2
chr1	111760000	.	T	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.29181;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:5,2:10,3
chr1	112446195	.	T	TG	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0095299;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:10,10:6,3
chr1	112839632	.	CA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0064568;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:6,5:4,4
chr1	112887304	.	G	GT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0012521;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:10,18:3,9:7,9
chr1	113329679	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0084152;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:13,4:15,5
chr1	113416037	.	TA	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.12491;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:8,3:13,1
chr1	113416042	.	A	ATG	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.099968;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:8,3:13,2
chr1	113826659	.	AT	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0069323;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:2,3:2,5
chr1	114023627	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0027946;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:7,3:11,6
chr1	114711520	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0018005;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:11,6:8,7
chr1	115973951	.	A	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:1,2:0,1:1,1
chr1	116760187	.	A	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0003213;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:8,3:8,6
chr1	118165645	.	C	CT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:1,3:6,1
chr1	118318922	.	ATAACATAGATATTATATATATAAC	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.020516;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:24,11:14,3:10,8
chr1	118318948	.	T	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.026312;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:21,11:13,3:8,8
chr1	119480464	.	G	GGAAT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.016957;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:6,5:2,1
chr1	120133006	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.026923;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:11,6:15,5
chr1	120214625	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.041254;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:8,3:10,3
chr1	120223626	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.03602;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:7,5:4,1
chr1	120449349	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.042184;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:14,1:17,4
chr1	120516328	.	CTCGAACACCTGACCTCAGG	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00055646;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:5,4:8,8
chr1	120677169	.	T	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.034767;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:7,6:6,2
chr1	120808134	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.096745;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:12,2:14,4
chr1	120813144	.	G	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:11,3:9,1
chr1	120933113	.	G	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:7,2:5,2
chr1	120999034	.	T	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.075059;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:11,2:6,4
chr1	121014916	.	A	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.021449;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,12:7,10:0,2
chr1	121142206	.	G	GTGTTGCATCTAATGCA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.027219;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:11,6:3,1
chr1	121300216	.	C	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:7,1:4,3
chr1	121313677	.	T	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.015942;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,3:4,2
chr1	121632493	.	G	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.046332;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:9,3:5,1
chr1	121633993	.	C	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.061867;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:22,3:22,3
chr1	121724458	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0047006;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:16,6:1,1
chr1	121746508	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.025099;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:5,1:26,4
chr1	121765204	.	T	C	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.021678;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:44,13:19,4:25,9
chr1	121825757	.	T	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.023715;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:0,0:6,4
chr1	122055311	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.016999;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:5,4:2,2
chr1	122126906	.	T	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
chr1	122130766	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.035683;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:0,2:32,6
chr1	122382551	.	T	G	0	PASS	DP=146;GPV=1;SPV=0.024134;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:77,10:45,7:32,3
chr1	122382585	.	C	G	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.012337;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:68,20:37,12:31,8
chr1	124517001	.	C	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.082831;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:1,0:22,4
chr1	124704660	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.07564;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:3,2:10,2
chr1	124803933	.	A	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.049719;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:18,4:14,2
chr1	124815480	.	G	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.024163;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,7:4,6:6,1
chr1	124819793	.	A	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.25578;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:17,1:15,3
chr1	124824574	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.062015;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:26,4:6,1
chr1	124829879	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.17496;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:2,0:23,4
chr1	124836421	.	A	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:5,1:7,4
chr1	124864443	.	T	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.034057;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:35,8:31,3:4,5
chr1	124872309	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.057743;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,5:4,3:10,2
chr1	125105666	.	G	C	0	PASS	DP=194;GPV=1;SPV=0.027872;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:122:103,19:65,12:38,7
chr1	125115225	.	A	G	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.037748;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:60,7:43,6:17,1
chr1	125115420	.	A	AC	0	PASS	DP=143;GPV=1;SPV=0.013226;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:70,10:27,4:43,6
chr1	125115460	.	G	A	0	PASS	DP=145;GPV=1;SPV=0.016349;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:69,9:27,3:42,6
chr1	125145353	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.14384;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:15,2:21,2
chr1	125183528	.	T	C	0	PASS	DP=13535;GPV=1;SPV=0.00028913;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:7135:6347,761:6156,122:191,639
chr1	143186576	.	G	T	0	PASS	DP=306;GPV=1;SPV=0.022409;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:178:159,19:107,15:52,4
chr1	143186698	.	G	C	0	PASS	DP=380;GPV=1;SPV=0.016502;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:221:195,26:35,6:160,20
chr1	143199058	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.05461;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:6,3:14,1
chr1	143354257	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:5,1:8,3
chr1	143507941	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.075102;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:4,1:21,3
chr1	143691034	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.20161;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:22,2:6,2
chr1	143749592	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0020871;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:7,4:17,6
chr1	143896059	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.039302;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:12,4:18,1
chr1	143899302	.	C	CAA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.056683;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:18,1:10,4
chr1	144322435	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:9,4:1,0
chr1	144907343	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0012456;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:13,7:8,3
chr1	145563251	.	CATGGTGTA	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.034945;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:14,6:14,2
chr1	145697763	.	ATTTTTTT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:5,3:5,1
chr1	145731539	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0035718;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:13,3:11,5
chr1	146008839	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,7:5,5:2,2
chr1	146397037	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.03942;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:7,6:9,2
chr1	146969025	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.049127;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:13,1:13,3
chr1	147096496	.	A	AATGTGTGTGTGTGTCTGTGT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.13473;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:7,3:9,1
chr1	147548979	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.060606;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:2,6:1,2:1,4
chr1	148239973	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.027099;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:9,3:7,5
chr1	148268790	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:0,5:0,2:0,3
chr1	148444677	.	C	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
chr1	148651160	.	AAAAT	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.021701;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:9,6:7,3
chr1	148651164	.	T	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:3,3:0,2:3,1
chr1	148884876	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.18176;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:8,3:14,1
chr1	148952338	.	C	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.06683;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:43,5:19,3:24,2
chr1	149080805	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0098611;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:7,6:5,4
chr1	149110135	.	C	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:3,5:2,2
chr1	149142076	.	TAC	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.033332;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,7:18,6:12,1
chr1	149158930	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.040741;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,1:5,3
chr1	149215311	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.086845;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:5,3:8,1
chr1	149309405	.	T	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.16556;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,4:13,1:18,3
chr1	149874716	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.021894;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:12,4:9,7
chr1	150136771	.	T	TA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0061864;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:9,5:6,4
chr1	150781906	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.094071;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:6,3:6,2
chr1	150905062	.	CCA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.02253;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:5,14:3,10:2,4
chr1	151660825	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.001135;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:43,16:22,6:21,10
chr1	151780257	.	ATACTATCTATACAACCAGTCCTCAATTACTTTATATACAACCTCAGT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.073823;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:7,2:12,3
chr1	152156625	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.18237;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:12,1:9,5
chr1	152274875	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.079329;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,6:4,5:6,1
chr1	153785086	.	A	AT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.030558;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,14:13,9:8,5
chr1	154309581	.	CATAT	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.097251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,4:12,1:2,3
chr1	154322489	.	C	CTTCTTCTTCTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.023839;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,8:2,7:4,1
chr1	154937273	.	A	G	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.003727;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:52,10:19,5:33,5
chr1	156640418	.	T	TC	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:7,6:2,4:5,2
chr1	157274150	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.057118;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,6:9,1:4,5
chr1	157300470	.	CAT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:8,3:8,1
chr1	157760686	.	A	AGAAAGAAGGAAG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.12919;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:13,3:7,1
chr1	159011398	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.25968;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:20,4:9,1:11,3
chr1	159021939	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:6,3:3,2
chr1	159256266	.	A	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=1.1925e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:25,22:10,9:15,13
chr1	160270143	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0096618;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:3,6:6,1
chr1	160984465	.	AAT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.030104;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:2,2:7,2
chr1	161423696	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0041082;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:18,12:5,5
chr1	161559730	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.012728;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:44,16:27,9:17,7
chr1	162108902	.	C	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.040006;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:38,8:22,4:16,4
chr1	162519003	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0041602;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:10,8:4,4:6,4
chr1	162825846	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00044723;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:13,5:10,8
chr1	163059160	.	T	TTATATATA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.013867;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:7,7:2,1
chr1	163547125	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:6,3:6,2
chr1	163758208	.	C	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.13498;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:16,1:20,3
chr1	164079940	.	A	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.020864;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:19,4:20,4
chr1	164563555	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0028166;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:12,7:19,2
chr1	164773241	.	G	GCACACACACACA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.049992;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:19,5:10,1
chr1	165139680	.	C	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.0077332;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,9:18,7:19,2
chr1	166038371	.	G	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0014163;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:21,4:10,7
chr1	166318281	.	AT	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.15773;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:18,4:9,1:9,3
chr1	166327704	.	GGTCAGAGAACCT	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=5.6653e-05;SS=2;SSC=42;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:25,17:12,7:13,10
chr1	166384348	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=5.3344e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:28,15:15,8:13,7
chr1	166464009	.	TTA	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.035929;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,12:14,6:9,6
chr1	166598336	.	TA	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0044141;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,12:18,8:16,4
chr1	166887954	.	CAA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.032647;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,8:3,6:5,2
chr1	167044460	.	C	CTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.038102;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:11,2:11,3
chr1	167177215	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.065982;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:1,0:13,4
chr1	167208546	.	G	GTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.014666;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:4,14:3,12:1,2
chr1	167773894	.	TA	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.18687;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:15,1:19,3
chr1	168100235	.	G	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0070433;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:3,6:2,4
chr1	168306397	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=6.3626e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:25,18:13,12:12,6
chr1	169172356	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.052643;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:14,6:5,2:9,4
chr1	171658179	.	G	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,4:5,2:5,2
chr1	171658181	.	G	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.020047;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,9:5,6:5,3
chr1	174349693	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.077327;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:9,1:12,4
chr1	174350131	.	G	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.047147;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:13,3:9,2
chr1	175087657	.	T	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0038636;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:40,14:18,6:22,8
chr1	175091559	.	TTTTA	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.17881;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:13,2:18,2
chr1	175426880	.	TAAAATATA	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:3,3:2,3
chr1	176049178	.	CAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.026877;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,10:8,7:3,3
chr1	176174007	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,4:9,3:5,1
chr1	176275360	.	CAAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0040248;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,9:2,8:3,1
chr1	177867086	.	A	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.27357;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,5:9,4:5,1
chr1	178661607	.	C	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.024305;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:16,8:8,3:8,5
chr1	178673275	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00051119;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:15,18:3,7:12,11
chr1	179541677	.	TA	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.032155;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:7,5:13,4
chr1	180234012	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00055105;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:11,17:2,6:9,11
chr1	180473446	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0053012;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,12:8,9:4,3
chr1	181034063	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.047407;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:11,1:17,4
chr1	181188527	.	A	AAAATAAATAAAT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.016242;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:12,10:4,5:8,5
chr1	181590418	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:7,5:3,3:4,2
chr1	182075278	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.02381;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:15:0,5:0,4:0,1
chr1	182295503	.	GA	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.070174;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:16,1:11,4
chr1	182295508	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.10837;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:18,1:13,4
chr1	182299870	.	G	GGA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.010097;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,12:14,8:2,4
chr1	182476052	.	T	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.11505;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:15,3:16,1
chr1	182936130	.	GT	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.043687;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,10:13,6:6,4
chr1	182946992	.	T	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.065169;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:16,2:17,4
chr1	183236390	.	A	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:1,3:0,0:1,3
chr1	183446701	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=3.0659e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:21,19:10,10:11,9
chr1	183776141	.	AT	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.051203;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:14,3:6,3
chr1	184936021	.	G	GA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.033449;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:16,12:10,9:6,3
chr1	185431986	.	G	GTCC	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.096637;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:24,4:9,3:15,1
chr1	186064809	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0127;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,8:8,6:7,2
chr1	187432871	.	T	TGTATATATATATACAC	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.033054;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,8:5,3:4,5
chr1	189093126	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0278;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:21,2:11,5
chr1	189818494	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.064615;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,2:3,1:2,1
chr1	190317171	.	C	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,4:8,1:1,3
chr1	190848998	.	T	TATAGAG	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.03741;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:2,13:1,6:1,7
chr1	191373158	.	CT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.29545;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,7:7,4:5,3
chr1	191597193	.	TTA	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.19365;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:19,2:14,2
chr1	191597196	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.1253;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,5:20,2:12,3
chr1	192098485	.	G	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0098951;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,15:3,4:4,11
chr1	193564297	.	T	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.35726;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:18,4:7,2:11,2
chr1	194191688	.	CTGTGTG	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.045605;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:13,8:8,7
chr1	195143152	.	G	GA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.059981;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:18,3:2,3
chr1	195286373	.	C	CTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.2092;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:6,2:21,3
chr1	196050116	.	T	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.078917;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:29,5:15,1
chr1	196692708	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.046254;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:10,1:12,5
chr1	196692716	.	C	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.048435;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:8,2:14,5
chr1	196759125	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.057896;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:14,4:4,2
chr1	196759861	.	TTA	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.023189;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:42,15:18,3:24,12
chr1	196773670	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.32052;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:16,3:18,1
chr1	197305904	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:3,2:2,1:1,1
chr1	201702677	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.086046;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,8:8,4:10,4
chr1	202125153	.	CAAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.031702;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:13,6:2,1
chr1	202205825	.	AC	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.002614;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:15,19:13,13:2,6
chr1	202205968	.	CA	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.12149;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:20,2:15,2
chr1	202799657	.	C	CA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.003703;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:6,9:13,9
chr1	203544823	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.053755;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:9,5:2,1
chr1	203794717	.	CTTT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.029563;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,13:7,9:2,4
chr1	203815379	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,8:7,7:6,1
chr1	204308691	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.027191;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:1,2:8,4
chr1	204699211	.	T	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.20807;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:12,4:23,1
chr1	205115043	.	T	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0027236;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:13,5:22,6
chr1	205766586	.	AC	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:14,3:9,1
chr1	206249005	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.023333;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:10,5:13,1
chr1	206612949	.	TA	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.20158;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,5:9,4:4,1
chr1	207657873	.	G	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00033391;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:17,6:9,5
chr1	208407255	.	C	CAAA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.013932;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:2,13:2,6:0,7
chr1	210191145	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00022928;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:10,7:11,6
chr1	210217114	.	AAG	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.10706;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:15,3:14,2
chr1	210243093	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.010716;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:7,7:2,1
chr1	211222740	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0040715;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:8,4:18,5
chr1	211535165	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.15033;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:8,3:11,1
chr1	211906826	.	A	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.37028;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:11,1:22,3
chr1	212365429	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.055341;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:5,5:3,1
chr1	212796547	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0037474;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:13,7:7,4
chr1	213046176	.	ATTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,11:4,8:4,3
chr1	213063260	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=4.6521e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,15:9,5:10,10
chr1	213363749	.	CTCTT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:1,1:6,4
chr1	213363813	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:4,1:9,3
chr1	213363815	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.013285;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,6:4,1:5,5
chr1	213440593	.	T	TAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0065417;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:8,6:1,2
chr1	213651244	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0040715;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:17,5:9,4
chr1	215133964	.	A	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0026644;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,17:6,7:11,10
chr1	215192766	.	T	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.017844;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:13,4:18,6
chr1	215391843	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=4.6905e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:21,29:13,14:8,15
chr1	216135134	.	ACTCT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.087179;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,5:9,2:4,3
chr1	216169734	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0028525;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:34,11:19,3:15,8
chr1	216439725	.	CT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:4,3:3,2
chr1	218145450	.	G	GTGTATATATATA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.13866;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,4:3,3:4,1
chr1	219170348	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.13055;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:15,5:7,1:8,4
chr1	219470415	.	T	TCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTAC	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.030303;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:2,6:1,4:1,2
chr1	219749979	.	C	CTT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.020362;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,5:4,4:0,1
chr1	219927681	.	A	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.017327;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,8:7,1
chr1	221766455	.	T	TGTGA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.010098;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,6:8,3:6,3
chr1	221918739	.	ATATATATAT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,2:2,1:1,1
chr1	222488773	.	CG	C	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.022703;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:56,7:46,4:10,3
chr1	223117579	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.19365;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:12,2:21,2
chr1	223937919	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.046518;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:8,4:3,3
chr1	223986360	.	C	CTAACTAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.19246;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:14,3:11,1
chr1	224128983	.	C	CAA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:8,8:7,7:1,1
chr1	224276911	.	TTGACACATAAAACTAGTTTTA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.094902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:10,3:12,2
chr1	224913826	.	A	ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.24176;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,4:3,1:4,3
chr1	225440291	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.018626;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:6,6:3,1
chr1	226169715	.	AC	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.16972;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:14,2:14,2
chr1	227709976	.	G	GT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:2,2:4,2
chr1	227959215	.	A	AT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.031702;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,7:5,5:10,2
chr1	229215269	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=7.167e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,13:5,8:8,5
chr1	229421349	.	CTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.011166;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,12:5,7:3,5
chr1	230354076	.	T	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0089367;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:19,3:20,8
chr1	230580340	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.36477;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,4:11,1:4,3
chr1	230830594	.	T	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.035088;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,4:4,3:2,1
chr1	233729238	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0013699;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:9,3:7,5
chr1	234334671	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.015152;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:29:1,4:0,1:1,3
chr1	234342591	.	T	TTAGATAGA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.037288;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:11,5:7,4
chr1	234699282	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.31818;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,2:1,1:4,1
chr1	234789878	.	A	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.01554;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:19,9:20,4
chr1	234995623	.	ATG	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.028928;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:15,6:16,1
chr1	234995802	.	TGTATATATAG	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.02651;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:10,2:17,5
chr1	235788804	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0022122;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:12,4:15,4
chr1	236669073	.	T	TTTCCTTCC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.10613;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,9:5,5:8,4
chr1	237077437	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.010714;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:11,6:13,3
chr1	237180692	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.28876;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,4:10,3:15,1
chr1	237208940	.	A	G	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.21429;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,2:2,2:0,0
chr1	237451972	.	GTGTGTGTA	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.035087;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:6,5:12,5
chr1	237584647	.	C	CTGTTTTT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:3,3:4,2
chr1	238337592	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.054281;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:8,1:11,5
chr1	238837481	.	G	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.060295;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:14,2:13,2
chr1	239959448	.	G	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:7,2:2,2
chr1	241483294	.	A	AT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.023323;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:7,5:7,6
chr1	242385979	.	C	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0035067;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:14,5:6,3
chr1	242475277	.	G	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=1.0723e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:23,21:12,10:11,11
chr1	242996654	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.024218;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:14,3:7,5
chr1	243039650	.	T	TAA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.16219;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:17,1:17,3
chr1	243275856	.	GT	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.14404;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:11,3:3,2
chr1	244876110	.	CA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.016999;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:6,5:1,1
chr1	246288062	.	CTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.057692;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,6:3,5:2,1
chr1	246787147	.	A	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.010741;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:8,3:9,4
chr1	247439061	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.035086;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:15,5:7,1
chr1	248005651	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.025917;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:14,3:10,2
chr1	248084006	.	A	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.045183;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:39,9:22,7:17,2
chr10	479328	.	C	CTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.045113;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:6,3:1,1
chr10	1672704	.	C	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.037811;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:7,5:8,6
chr10	2723863	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.011827;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:15,3:13,5
chr10	3458378	.	A	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.029563;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:3,6:6,1
chr10	3466719	.	G	GTA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.016109;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,12:11,8:7,4
chr10	3957167	.	T	TTTATTATTA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.010479;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:8,6:4,5
chr10	4308075	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.092437;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,6:4,4:3,2
chr10	4802231	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.012987;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:35:1,5:1,1:0,4
chr10	5047200	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.008739;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:19,2:5,4
chr10	5957593	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10134;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:9,5:7,1
chr10	6392542	.	C	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0035931;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:13,2:5,5
chr10	6707263	.	T	TATCC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.00037514;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,11:3,6:2,5
chr10	7817849	.	GTTT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.057471;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:7,3:4,1
chr10	7994977	.	GA	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.040741;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,4:6,3:3,1
chr10	8007562	.	TTATATATATATA	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,4:3,2:1,2
chr10	8335904	.	C	CAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,4:8,3:4,1
chr10	9656343	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.044512;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:14,2:12,4
chr10	10005606	.	C	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.16912;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:8,3:11,1
chr10	10747900	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.010322;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:4,8:10,3
chr10	11446557	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0060788;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:7,4:8,8
chr10	11876574	.	T	TTGTGTG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0060349;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:1,7:10,1
chr10	12330746	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.003663;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:1,10:1,7:0,3
chr10	12408848	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.069881;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:8,5:3,1
chr10	12413570	.	T	TTGC	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.14404;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,5:6,2:8,3
chr10	12538885	.	C	CA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.01049;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,6:2,4:1,2
chr10	12801333	.	C	CT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.088935;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:8,1:10,3
chr10	12889075	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.049052;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:15,4:13,4
chr10	12929264	.	A	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.46667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:5,2:1,1:4,1
chr10	13908164	.	T	TA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.017149;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:3,8:3,2
chr10	14373925	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:8,11:3,2:5,9
chr10	15644122	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0040413;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:9,5:13,2
chr10	16533321	.	A	AT	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00075779;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,9:17,6:6,3
chr10	17102252	.	C	CTTAT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.014064;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:8,5:9,3
chr10	17774798	.	T	TTCTCTCTC	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,7:2,3:0,4
chr10	19563250	.	A	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.021448;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:10,3:8,1
chr10	19748703	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=3.8037e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:14,5:7,9
chr10	20140405	.	A	AAATATCTATCTATC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,8:4,6:3,2
chr10	20721458	.	G	GT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0053523;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,8:8,5:4,3
chr10	21048697	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0017392;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:11,5:13,5
chr10	21325974	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.14737;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:4,1:2,1
chr10	21325977	.	TA	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:4,3:3,1
chr10	21405648	.	C	CA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.052629;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,5:19,2:3,3
chr10	21871118	.	C	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00038475;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:12,4:11,7
chr10	21883251	.	A	AACACAC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.031121;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:8,9:5,5:3,4
chr10	23064079	.	G	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0013903;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:18,5:10,5
chr10	23527144	.	C	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=9.1723e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,16:12,8:13,8
chr10	23824646	.	A	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.00065258;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:4,4:2,3
chr10	23943175	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0041352;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:10,5:9,3
chr10	23943176	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.012535;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:11,4:7,2
chr10	26473999	.	CA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.023692;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:6,7:5,3
chr10	26727342	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.072149;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,5:2,1:11,4
chr10	27443463	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.007525;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:8,4:9,10
chr10	27630080	.	C	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0035533;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,14:4,8:8,6
chr10	28310020	.	T	TTTTTTTA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.01497;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,9:7,5:3,4
chr10	29258674	.	AG	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.065982;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:12,3:2,1
chr10	29907575	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.17679;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:4,2:12,2
chr10	30167116	.	CATTT	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0015096;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:8,15:4,11:4,4
chr10	30706505	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.044477;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:1,0:11,4
chr10	30715886	.	A	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.014757;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,7:4,2:2,5
chr10	30824000	.	G	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=3.4893e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:7,10:15,5
chr10	32946749	.	TG	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.024476;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,5:1,4:1,1
chr10	33043272	.	T	TATATACA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.027972;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,5:2,1:1,4
chr10	33071607	.	T	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.066077;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:8,3:14,2
chr10	37040798	.	G	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0023764;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:15,5:9,3
chr10	37556436	.	G	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00033391;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:12,3:14,8
chr10	37632113	.	GA	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00024945;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:12,18:7,10:5,8
chr10	37748973	.	A	ATCTCTCTC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.037466;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,7:7,5:5,2
chr10	38180750	.	A	ATTT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.094639;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,5:10,1:7,4
chr10	38438433	.	TAA	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.072845;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:20,2:9,3
chr10	38528669	.	T	C	0	PASS	DP=475;GPV=1;SPV=0.0039538;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:263:218,45:100,21:118,24
chr10	38652470	.	T	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.12656;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:17,1:16,3
chr10	38665946	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.040315;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:46,6:30,2:16,4
chr10	38744008	.	AAAT	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.013242;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:10,5:6,2
chr10	38745303	.	AATG	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.088935;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:14,1:4,3
chr10	38745316	.	AATG	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.17641;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:17,1:10,3
chr10	38807919	.	G	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.13316;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:12,3:13,1
chr10	38807930	.	ATTTGG	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.1121;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:12,2:13,2
chr10	38949903	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.039588;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:12,4:17,1
chr10	38966360	.	C	T	0	PASS	DP=256;GPV=1;SPV=0.001569;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:144:118,26:60,7:58,19
chr10	39156498	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0039777;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:20,4:7,5
chr10	40065992	.	G	T	0	PASS	DP=677;GPV=1;SPV=0.0071518;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:361:312,37:167,19:145,18
chr10	40073709	.	C	A	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.03677;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:77,10:11,2:66,8
chr10	40371463	.	T	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.015851;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:2,1:5,4
chr10	40588767	.	TC	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.056683;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:26,2:2,3
chr10	40799584	.	C	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.021615;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:7,2:7,5
chr10	40935692	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.19386;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:0,0:35,4
chr10	41509751	.	G	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.021605;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:50,10:27,8:23,2
chr10	41531607	.	A	C	0	PASS	DP=256;GPV=1;SPV=0.04229;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:131:116,15:51,2:65,13
chr10	41542758	.	T	C	0	PASS	DP=243;GPV=1;SPV=0.032351;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:127:114,13:22,2:92,11
chr10	41567788	.	C	T	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.008043;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:49,16:20,14:29,2
chr10	41579978	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.030781;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:15,8:6,1
chr10	41583893	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.085739;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:13,3:3,2
chr10	41589469	.	G	C	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.013577;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:62,17:48,12:14,5
chr10	41730415	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0046915;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:24,18:12,9:12,9
chr10	41879225	.	A	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0035252;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:7,3:14,5
chr10	41904222	.	A	T	0	PASS	DP=177;GPV=1;SPV=0.040458;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:99:86,12:59,4:27,8
chr10	41915238	.	A	G	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.019547;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:61,7:33,3:28,4
chr10	42071375	.	A	T	0	PASS	DP=1234;GPV=1;SPV=0.015828;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:715:629,77:2,2:627,75
chr10	42130656	.	A	T	0	PASS	DP=155;GPV=1;SPV=0.036978;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:68,17:37,9:31,8
chr10	42841410	.	G	GA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.013124;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:3,6:4,2
chr10	43107564	.	C	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.064915;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:12,2:10,2
chr10	43167921	.	AGT	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.018608;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:15,3:15,4
chr10	43167929	.	A	ATAATAAT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.11839;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:16,2:17,2
chr10	44720733	.	GA	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0018191;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:7,4:6,5
chr10	45341228	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.004732;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:6,8:14,6
chr10	45617591	.	GA	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.066403;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:10,4:1,1
chr10	45710864	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0025336;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:24,19:12,11:12,8
chr10	45749836	.	A	AAAAAAAAATATATAT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.069231;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,4:4,2:1,2
chr10	45775938	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.091143;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:9,3:8,3
chr10	45836143	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.043423;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,3:5,2
chr10	45849479	.	T	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.060665;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:14,1:11,4
chr10	45890429	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,1:6,3
chr10	45960209	.	A	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0077158;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:10,9:4,1
chr10	46337370	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.064086;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:14,2:24,3
chr10	47280793	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.06993;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:2,1:2,3
chr10	47296068	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.13742;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:10,2:14,2
chr10	49599548	.	C	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0012065;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:11,4:13,5
chr10	50186806	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.019737;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:4,1:6,7
chr10	50722818	.	C	CTTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.034045;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:7,5:4,3
chr10	51349472	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.086656;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:16,1:10,3
chr10	51480004	.	C	CA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0094816;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:26,19:13,8:13,11
chr10	51542814	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0053553;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,11:18,7:14,4
chr10	52166827	.	ATG	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12093;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:12,1:6,4
chr10	52244854	.	T	TAA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.064826;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:17,2:6,2
chr10	52287706	.	A	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12458;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:13,3:8,1:5,2
chr10	54006161	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0070897;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:8,7:8,6
chr10	54389144	.	GGAAAAA	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.033333;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:20:0,3:0,2:0,1
chr10	54558235	.	C	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00052875;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:12,7:12,3
chr10	54853440	.	CATAT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.039138;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:15,2:4,3
chr10	56175689	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,3:3,2:3,1
chr10	57693902	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.096892;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:14,2:5,2
chr10	58139554	.	T	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.084902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:15,1:6,3
chr10	58723476	.	A	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00074243;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,12:17,5:12,7
chr10	60469287	.	G	GTATA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:0,2:0,1:0,1
chr10	60469371	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.041809;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,6:4,1:7,5
chr10	61938883	.	GA	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.023045;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:5,6:2,3
chr10	63433586	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.26429;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,4:28,3:5,1
chr10	63486152	.	AAAAAAAAAAAAAAAAAC	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.024337;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:7,8:5,1
chr10	64746619	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.034438;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:5,6:9,2
chr10	65077424	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:33:0,2:0,2:0,0
chr10	65372411	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.024972;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:12,3:14,3
chr10	65391347	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.020875;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:4,4:5,5
chr10	66024085	.	A	ATTTTTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.32967;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,4:4,3:3,1
chr10	66845708	.	A	AAAAAAAAAAAC	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0047847;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,4:3,4:0,0
chr10	66996649	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,4:7,3:4,1
chr10	67219498	.	T	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0017936;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:11,3:17,5
chr10	67854315	.	A	AAAAAAAT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.040043;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:1,5:0,4:1,1
chr10	68203710	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.2738;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:29,3:12,2
chr10	68760880	.	A	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.10714;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:1,2:0,0:1,2
chr10	69283124	.	C	CA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16176;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,4:3,3:5,1
chr10	69632457	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.062714;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,9:4,6:8,3
chr10	70133098	.	AAGAGAGAGAGAG	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.011374;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,10:2,7:3,3
chr10	70369605	.	CAA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.044272;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,6:5,5:2,1
chr10	70813920	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.015549;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:12,5:6,5
chr10	73006205	.	T	TAA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.057692;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,5:3,4:2,1
chr10	74347106	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.032647;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,10:1,8:7,2
chr10	74695615	.	GT	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.24484;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:20,1:6,3
chr10	76616929	.	CAT	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:3,3:1,1
chr10	76617080	.	A	ATAT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0051869;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:4,3:2,6
chr10	78221462	.	A	ATGTGTGTG	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.014414;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:8,3:12,8
chr10	78814818	.	G	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.055991;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:29,6:13,2:16,4
chr10	79322195	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0081036;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:14,3:11,3
chr10	79806583	.	T	TTATATATATA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:4,8:4,6:0,2
chr10	79879029	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00031521;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:11,9:14,5
chr10	82132479	.	GAT	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.034045;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:3,5:8,3
chr10	82694055	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00029546;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:12,5:13,5
chr10	82856756	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.023788;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:8,7:1,1
chr10	83255151	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0023885;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:11,17:7,12:4,5
chr10	83635957	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0031185;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:7,5:11,2
chr10	83774421	.	A	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0058487;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:14,5:16,3
chr10	84180135	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.14912;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:14,1:18,3
chr10	85502876	.	C	CTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,4:2,3:4,1
chr10	85930264	.	A	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0099148;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:9,5:8,3
chr10	86491136	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.010195;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:5,9:3,1
chr10	86645884	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.036089;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:4,3:3,2
chr10	86924514	.	A	AT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.060727;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:16,3:13,2
chr10	88187197	.	A	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,4:2,1:4,3
chr10	89997858	.	C	CTATCTATT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00011008;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,13:11,8:8,5
chr10	90422967	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00016659;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:12,2:8,9
chr10	90614158	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0079418;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:11,4:9,2
chr10	92001971	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.46154;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,2:1,1:6,1
chr10	92331889	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.2419;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,4:8,1:6,3
chr10	92721325	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.011867;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:9,1:15,7
chr10	93831288	.	G	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.14141;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:4,4:1,3:3,1
chr10	95066119	.	T	TGA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0059881;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,9:7,7:4,2
chr10	95563605	.	CA	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.027592;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:6,5:15,1
chr10	96742764	.	CCGTA	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0001697;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:19,6:8,7
chr10	97125533	.	C	CAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.036146;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,10:7,7:6,3
chr10	98397877	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:7,3:4,1
chr10	98961345	.	G	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.07478;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:9,2:5,2
chr10	98997112	.	C	CTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.12566;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,6:11,5:5,1
chr10	99356580	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.12114;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:19,1:3,3
chr10	99953819	.	A	AAAAAAAAAAAAAAAG	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.042547;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:6,2:7,3
chr10	100822227	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00081542;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:8,2:8,7
chr10	101265768	.	ATATTTTT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.26923;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,2:0,1:5,1
chr10	103129579	.	T	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.087179;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:9,3:4,2
chr10	103909400	.	ATATATATG	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.29139;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:17,1:11,3
chr10	104438348	.	G	GT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,4:7,3:5,1
chr10	105561145	.	CG	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.070228;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,1:13,3
chr10	106277597	.	T	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0016612;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:9,3:18,6
chr10	107044512	.	T	TA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.014832;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:7,7:1,3
chr10	108848099	.	A	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0030923;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:34,9:13,5:21,4
chr10	109675736	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=7.3489e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:13,22:8,10:5,12
chr10	110165018	.	C	CTAAA	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0013413;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:13,3:15,10
chr10	110284804	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.10571;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:22,2:14,2
chr10	111368317	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.047147;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,5:12,1:10,4
chr10	111407403	.	C	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.10049;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:16,2:17,4
chr10	111666783	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=1.1241e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:20,19:8,12:12,7
chr10	112265690	.	T	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=5.5695e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:7,6:10,4
chr10	112300319	.	G	GAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.22206;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:20,3:6,1
chr10	112546777	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.018613;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:17,4:5,4
chr10	114638622	.	TACACACACACAC	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.097397;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:18,4:6,2
chr10	115389500	.	C	CA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.014079;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,8:7,4:3,4
chr10	117191994	.	C	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.03514;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:10,3:7,2
chr10	117945508	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.065325;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:8,2:7,3
chr10	118716605	.	C	CTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.031249;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:7,6:9,2
chr10	118798641	.	A	ATT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:2,2:2,2
chr10	119101623	.	CTCCA	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.036962;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:16,4:11,4
chr10	119101673	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.022365;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:20,4:8,3
chr10	120354643	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0025519;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,10:3,9:1,1
chr10	121090620	.	CAAA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,9:3,6:1,3
chr10	121781176	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.10714;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:1,2:1,2:0,0
chr10	122634430	.	TTCTCTCTCTC	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.092308;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,4:4,1:1,3
chr10	123072479	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.087179;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:13,5:9,4:4,1
chr10	124932281	.	AT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.092437;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,5:4,4:3,1
chr10	125352979	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00019486;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:12,7:13,7
chr10	125894156	.	C	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.023456;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:46,10:16,2:30,8
chr10	126216045	.	C	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0011799;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:15,4:15,6
chr10	126221389	.	CAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:9,7:2,3
chr10	126251605	.	GATGGATGC	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.19313;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:12,3:17,1
chr10	126649667	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00086088;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:10,4:13,6
chr10	128924414	.	A	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.053114;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:11,1:17,3
chr10	128924425	.	C	CATCT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.043835;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,4:7,2:15,2
chr10	130222537	.	A	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0013769;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:16,5:13,5
chr10	130226463	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0015113;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:5,5:17,3
chr10	130790561	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.13721;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:14,2:22,3
chr10	130815854	.	C	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.020691;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:14,3:9,3
chr10	133644072	.	G	GA	0	PASS	DP=145;GPV=1;SPV=0.0019294;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:64,19:31,6:33,13
chr10	133657666	.	G	A	0	PASS	DP=290;GPV=1;SPV=0.025772;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:151:124,27:52,11:72,16
chr10	133660260	.	G	A	0	PASS	DP=136;GPV=1;SPV=0.039804;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:64,12:31,10:33,2
chr10	133770603	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.19154;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:13,2:8,2
chr10	133770626	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.23659;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:13,4:11,1
chr11	131580	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.028495;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:7,4:11,5
chr11	172718	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.059999;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:11,1:14,5
chr11	897146	.	C	CA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:12,4:0,0
chr11	2018276	.	T	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00055309;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:13,4:16,7
chr11	2233897	.	A	AT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.041466;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:4,1:6,5
chr11	2233901	.	T	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.057471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:5,1:6,3
chr11	2285949	.	A	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=3.1411e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:10,6:8,7
chr11	2749591	.	C	CCT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.048755;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:12,2:6,4
chr11	2878233	.	C	CCTTT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.049774;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:3,5:3,1
chr11	3094552	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.017945;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:12,4:14,5
chr11	5202019	.	A	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=2.4825e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:6,4:12,9
chr11	6435147	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00065175;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:17,5:8,8
chr11	6774952	.	G	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:2,2:2,2
chr11	8149017	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.021743;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:11,4:8,2
chr11	8330531	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:5,3:7,2
chr11	9880116	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.010716;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:3,3:6,5
chr11	10310625	.	C	CAG	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.13105;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:11,2:10,3
chr11	10310678	.	A	AGAGAGAGC	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.10613;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:11,1:2,4
chr11	10562946	.	C	CT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:5,4:0,0
chr11	11086280	.	G	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=3.274e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,15:10,5:9,10
chr11	11923048	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.016783;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:3,6:1,2:2,4
chr11	12564523	.	T	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,9:3,3:3,6
chr11	15530642	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0092761;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:11,4:8,1
chr11	15639211	.	A	AAG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.43134;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:24,2:12,2
chr11	16479708	.	AAACT	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.048259;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:15,1:9,3
chr11	16479713	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.073744;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:16,1:12,3
chr11	16906224	.	T	TAGGA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.046139;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,6:13,4:6,2
chr11	18247346	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0016408;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:6,3:19,6
chr11	18251982	.	T	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.50909;SS=2;SSC=2;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,2:1,1:5,1
chr11	19351976	.	A	AGT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.020223;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:10,5:6,6
chr11	20798970	.	GATAAATACGGACAAAATTAAACCTAATGATAAACGTCATGGAAGAAA	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:6,1:7,3
chr11	21192060	.	C	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00034257;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:11,6:10,9
chr11	21358565	.	A	ATTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.12308;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,7:2,6:3,1
chr11	21403606	.	CAA	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0015106;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,15:9,4:4,11
chr11	21403609	.	A	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0027281;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:9,4:6,10
chr11	22269501	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,4:7,3:5,1
chr11	22641298	.	ATATC	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.03942;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:6,5:10,3
chr11	24079271	.	AAG	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.12152;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,6:8,1:10,5
chr11	24388535	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.021839;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:4,1:8,9
chr11	24388935	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.15679;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,2:13,2
chr11	24455988	.	C	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00027241;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:6,4:10,6
chr11	24984719	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0024374;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:8,8:11,2
chr11	25804733	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=1.7307e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,15:2,5:12,10
chr11	26016983	.	GAA	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.023031;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:10,8:4,3
chr11	27436375	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.20294;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:16,1:4,3
chr11	27439901	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0063246;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,8:5,5:0,3
chr11	27731810	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0025244;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:11,4:17,5
chr11	28181258	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.092258;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,4:16,3:11,1
chr11	28312566	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:34:0,2:0,0:0,2
chr11	28455216	.	CTTT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:2,5:2,2
chr11	28799096	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0065944;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:16,3:17,7
chr11	29145810	.	A	AAAAAAAAAAAAAAAGG	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.027053;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:6,3:4,3
chr11	29504566	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.015152;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:0,6:0,2:0,4
chr11	30945750	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.094902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:4,2:18,3
chr11	31518494	.	A	AT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.029832;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:6,4:5,4
chr11	32498387	.	G	GTCTTTCTT	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.038499;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:12,3:16,5
chr11	33118747	.	TA	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.006003;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:25,24:10,12:15,12
chr11	33154486	.	ACTTT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:11,3:6,1
chr11	34194702	.	G	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0063293;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:8,4:15,5
chr11	34520476	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,8:2,3:5,5
chr11	35002384	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,7:2,5:4,2
chr11	35419998	.	G	C	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=3.7727e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:28,18:13,13:15,5
chr11	35827781	.	T	TAATAATAATAATAATAAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.20553;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,3:9,2:2,1
chr11	36128154	.	ATTAAAC	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.035568;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:8,4:7,1
chr11	37099828	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.035088;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:2,1:4,3
chr11	37099830	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.10577;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,5:3,1:3,4
chr11	37190545	.	AAGAGAGAG	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11404;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:8,4:2,1
chr11	37348286	.	A	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.017591;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:4,4:4,3
chr11	37534487	.	GTT	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:7,1:4,3
chr11	39574939	.	GTA	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.034924;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:10,2:5,3
chr11	39612074	.	CA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.00072552;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:8,7:2,5
chr11	40381954	.	G	GTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:10,3:3,1
chr11	41093927	.	C	CA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:9,4:1,0
chr11	41938402	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.014707;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:13,4:12,2
chr11	41959443	.	A	ATATATATCTATCTATC	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0025738;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,6:9,3:7,3
chr11	42383876	.	TA	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.11505;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:17,2:14,2
chr11	43705751	.	CCT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0037594;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,8:2,5:1,3
chr11	44065496	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.022999;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:3,5:4,1
chr11	44663344	.	G	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.083396;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,6:8,1:12,5
chr11	44700701	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.16912;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,4:8,2:11,2
chr11	44943603	.	C	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=4.2642e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:29,15:14,13:15,2
chr11	46169560	.	AAAAGAAAG	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.03274;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:12,9:2,3
chr11	46328664	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,4:3,2:6,2
chr11	47250805	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=2.0361e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:13,8:7,7
chr11	47488306	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.069354;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:12,4:12,1
chr11	47765374	.	A	AAAAAGAAAAGAAAAG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.037185;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,6:3,1:6,5
chr11	48571931	.	C	CT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.082251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,4:12,2:4,2
chr11	49406779	.	GTATATATATATATATATATATCTGTA	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.25455;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,4:4,2:1,2
chr11	49803343	.	CTTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.017534;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:2,9:1,7:1,2
chr11	49859015	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0063246;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,8:3,7:2,1
chr11	49885040	.	A	ATTTCTTTC	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.1143;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,4:1,2:16,2
chr11	51157750	.	A	C	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.011806;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:41,10:17,4:24,6
chr11	51248292	.	C	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.016425;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:15,7:14,4
chr11	51911615	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.092258;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:8,1:19,3
chr11	52146099	.	C	A	0	PASS	DP=178;GPV=1;SPV=0.017156;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:90,16:75,14:15,2
chr11	52284240	.	T	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.15679;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:7,1:16,3
chr11	52341887	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.022999;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:6,5:1,1
chr11	52495354	.	C	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.048152;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:27,1:6,4
chr11	52739176	.	A	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.098889;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:21,3:11,1
chr11	53141533	.	G	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.028921;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:2,2:8,4
chr11	53563809	.	A	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.060214;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:21,1:5,3
chr11	54269194	.	T	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:11,4:0,0
chr11	54371781	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.031264;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:12,5:0,1
chr11	54401653	.	C	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.2538;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:9,1:13,3
chr11	54410525	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:5,1:9,3
chr11	54412246	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0057488;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:15,11:1,1
chr11	54414499	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.02311;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:17,4:11,5
chr11	55403395	.	A	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:1,6:1,3:0,3
chr11	55403571	.	C	CTTTGCTTACTTTGACA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.032805;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:3,8:8,2
chr11	55403572	.	C	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.023692;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,10:3,9:8,1
chr11	55639158	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0063358;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:10,2:13,4
chr11	55765156	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.019042;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:8,8:6,2
chr11	56497195	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.012401;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:38,8:24,2:14,6
chr11	56756712	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.34286;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:7,2:7,2:0,0
chr11	56759810	.	A	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.025141;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:13,8:12,1
chr11	57515518	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.00035161;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:40,16:19,8:21,8
chr11	57558174	.	G	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.020953;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:38,9:24,8:14,1
chr11	57918856	.	A	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.011037;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,6:4,3:1,3
chr11	57996477	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.042491;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:9,6:10,1
chr11	58008340	.	G	GT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,1:5,3
chr11	58677727	.	TCATC	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.15441;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,2:2,1:3,1
chr11	59195438	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:34:0,2:0,1:0,1
chr11	60950325	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0011003;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:17,5:18,6
chr11	61601275	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0017165;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:38,12:16,4:22,8
chr11	63177856	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:0,2:0,2:0,0
chr11	63177859	.	TATATA	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:1,2:1,2:0,0
chr11	63382288	.	T	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00078184;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:7,4:9,8
chr11	63500547	.	G	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00026014;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:8,5:14,5
chr11	63860485	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00031973;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:8,8:12,6
chr11	64582170	.	CTCA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.057471;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:3,1:8,3
chr11	65843220	.	CAA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,12:5,9:2,3
chr11	68000043	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0040978;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:15,3:12,5
chr11	68870443	.	AAG	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,3:3,1
chr11	69351971	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.04647;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:16,3:18,3
chr11	71135483	.	T	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.25455;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,3:3,2:2,1
chr11	72079109	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00040558;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:16,9:13,5
chr11	75318174	.	T	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:5,2:7,3
chr11	75821122	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=5.2903e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:12,5:7,8
chr11	76103537	.	G	GT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.026092;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:13,4:8,3
chr11	76602194	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0025828;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:16,6:13,5
chr11	77479602	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:7,3:2,2
chr11	77617367	.	C	CAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.43846;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,6:7,5:10,1
chr11	77646783	.	A	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.030474;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:9,5:8,4
chr11	78160253	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.058905;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:11,2:5,2
chr11	79150786	.	G	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=1.7558e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:10,3:6,10
chr11	79164083	.	T	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:2,3:8,2
chr11	79337046	.	A	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0061819;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:7,5:25,4
chr11	80400038	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0007584;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:17,19:11,7:6,12
chr11	82380028	.	G	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.014488;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:5,3:15,3
chr11	84408706	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.014243;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:15,4:12,4
chr11	84434118	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.019899;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,6:9,5:5,1
chr11	85500561	.	T	TAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:3,2:3,2:0,0
chr11	85862285	.	G	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00051706;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:12,7:11,3
chr11	86139968	.	C	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00019835;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:10,6:10,4
chr11	86307577	.	C	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.041764;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:37,13:15,8:22,5
chr11	86496410	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:7,2:2,1:5,1
chr11	87189112	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.17137;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:11,1:10,3
chr11	87690200	.	T	TA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.27778;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,2:0,1:3,1
chr11	87690207	.	A	AAT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,3:1,2:2,1
chr11	88251411	.	G	GTA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.027067;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,14:12,7:6,7
chr11	89778365	.	A	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.010773;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:35,19:17,4:18,15
chr11	90096787	.	C	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.019162;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:4,5:8,2
chr11	90495498	.	T	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.015535;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,11:2,2:6,9
chr11	90855626	.	A	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.14737;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,2:5,1:1,1
chr11	91278918	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=1.2971e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,18:13,7:7,11
chr11	91651351	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.013929;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:17,5:10,2
chr11	91821128	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0021435;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:8,5:15,5
chr11	96978545	.	GTCTGTCTA	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00010656;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,14:4,8:8,6
chr11	97056518	.	G	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0006295;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:30,13:16,8:14,5
chr11	98285550	.	GAAA	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0021323;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:4,8:2,2
chr11	98917076	.	A	AAAAGG	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.025795;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,8:5,4:8,4
chr11	99433372	.	T	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.17641;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:12,3:15,1
chr11	99747460	.	C	CTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.30914;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:9,3:12,1
chr11	99966592	.	C	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00027813;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:11,7:12,6
chr11	100610603	.	T	TAAA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0022326;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,14:6,8:7,6
chr11	100802424	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.091659;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:7,5:6,1
chr11	100891439	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:4,9:2,5:2,4
chr11	101100605	.	C	CCACA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.006848;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:9,5:7,5
chr11	102512185	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.12587;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:5,4:3,2:2,2
chr11	102919535	.	C	CT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.014884;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,8:1,7:2,1
chr11	103568084	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.027878;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:11,4:8,5
chr11	103875221	.	C	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.025087;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:15,4:8,4
chr11	105540750	.	G	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.011697;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:13,2:18,5
chr11	106418553	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0018599;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:11,5:9,7
chr11	106698539	.	A	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0040737;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:33,15:24,7:9,8
chr11	107816288	.	C	CT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.12919;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:15,3:5,1
chr11	110307048	.	C	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.046286;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:36,7:12,4:24,3
chr11	110388783	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0042329;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:6,4:18,3
chr11	112871174	.	C	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.1958;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:5,5:2,4:3,1
chr11	113980141	.	C	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0015657;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:33,11:20,7:13,4
chr11	114330231	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0077158;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:6,7:8,3
chr11	114786893	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00024383;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:29,13:14,7:15,6
chr11	114948253	.	GT	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.001548;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,7:2,5:1,2
chr11	115053884	.	A	AATGG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0014606;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,14:4,10:8,4
chr11	115694770	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0017887;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:30,13:15,8:15,5
chr11	116434916	.	C	CTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.017609;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,7:7,6:5,1
chr11	116673394	.	T	TATTTA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.1143;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,4:9,2:8,2
chr11	117473268	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00032976;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:12,8:13,5
chr11	117515713	.	C	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0027092;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:4,5:10,3
chr11	118246585	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.12566;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:8,5:8,1
chr11	118888521	.	G	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.01745;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:12,3:14,5
chr11	118975509	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:5,2:3,1:2,1
chr11	119805179	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0041454;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:6,2:12,4
chr11	119848761	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,4:9,3:8,1
chr11	121865084	.	A	ATT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.02043;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:10,3:5,4
chr11	122837751	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.3193;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,6:7,3:4,3
chr11	124885580	.	G	GTTT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.025685;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,9:7,5:7,4
chr11	125346787	.	C	CAGGAAGGGAGGA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.01594;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:10,7:10,5
chr11	125726507	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0023569;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,10:1,9:6,1
chr11	126551652	.	C	CT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0079902;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,14:8,10:4,4
chr11	129485119	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=3.7374e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:24,19:13,7:11,12
chr11	129518147	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0092505;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:4,4:6,1
chr11	130091211	.	C	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.012389;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:10,5:13,3
chr11	130091323	.	A	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.15365;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:9,1:17,3
chr11	130501444	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00025408;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:11,9:12,3
chr11	131337917	.	G	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=8.8691e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:9,4:7,8
chr11	131566736	.	C	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0004313;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:13,4:10,5
chr11	131873625	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.020047;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:4,3:6,6
chr11	132275701	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.040348;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:5,3:10,3
chr11	132867624	.	C	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.021382;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:9,2:9,5
chr11	133021718	.	G	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.070228;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,1:13,3
chr11	133231910	.	AAATGGACACATGATGTAAAAGGCTTAGGATCCTACAAGGAAGGGC	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.12928;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:14,2:9,2
chr11	133538191	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.072018;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:9,4:4,2
chr11	134344730	.	C	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.038105;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:48,9:26,6:22,3
chr11	134454134	.	G	GT	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.076397;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:12,3:21,1
chr12	11409	.	G	T	0	PASS	DP=166;GPV=1;SPV=0.028618;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:75,16:26,3:49,13
chr12	13514	.	C	T	0	PASS	DP=225;GPV=1;SPV=0.036054;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:116:99,17:49,11:50,6
chr12	187635	.	A	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.02028;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:2,7:1,2:1,5
chr12	580598	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.20342;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:18,4:10,2:8,2
chr12	964966	.	C	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.087068;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:9,2:23,3
chr12	1121638	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.024893;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:6,1:8,9
chr12	1259506	.	C	CTCTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.23663;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:10,2:6,2
chr12	1484165	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0095299;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,14:9,9:7,5
chr12	1958016	.	A	AAT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.07564;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,2:6,2
chr12	2790464	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0025828;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:17,5:12,6
chr12	2835159	.	A	ATGTG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.013095;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,8:12,5:3,3
chr12	2842204	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0012781;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,13:4,5:3,8
chr12	2883511	.	ATTTTTTTT	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.016317;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:15:1,7:1,2:0,5
chr12	3023790	.	C	CAA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.12406;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:8,10:3,9:5,1
chr12	4482205	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.21888;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:13,2:17,2
chr12	4835134	.	A	AT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0046097;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,13:4,11:11,2
chr12	5923185	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.022869;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,8:8,6:6,2
chr12	6379933	.	CAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.030455;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:8,4:3,3
chr12	7300160	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0071032;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,10:4,5:3,5
chr12	8184805	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.018137;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:18,10:8,2
chr12	8310981	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.038906;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:19,3:11,3
chr12	8397545	.	G	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.03877;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:38,14:17,9:21,5
chr12	8983395	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.023045;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:1,8:6,1
chr12	9295114	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.039095;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:16,2:8,4
chr12	9296551	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.039229;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:38,8:9,7:29,1
chr12	9311675	.	C	CGTT	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.049696;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,6:17,1:14,5
chr12	9429685	.	C	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.087152;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:56,7:31,4:25,3
chr12	11957489	.	AAAAC	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.10493;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,4:9,2:11,2
chr12	13469811	.	C	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0012661;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:5,4:14,6
chr12	13999732	.	C	CT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,4:4,3:1,1
chr12	14321198	.	A	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0029872;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:13,6:7,2
chr12	14745345	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0024472;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,7:7,4:1,3
chr12	16204381	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0012775;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:7,4:11,6
chr12	16341133	.	CAT	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.1228;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:15,2:13,2
chr12	17063515	.	TTTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0084291;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:3,1:6,5
chr12	17346228	.	CA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,7:2,6:1,1
chr12	17506656	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0017392;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:16,4:8,6
chr12	19197676	.	CTG	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.042556;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,7:6,5:6,2
chr12	20112787	.	G	GT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.012665;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:10,4:9,2
chr12	20400379	.	GTTTTTTTTTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.055478;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:10,5:6,1
chr12	21933091	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.040876;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:8,7:7,1
chr12	23068157	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,5:2,3:3,2
chr12	23086073	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:1,3:1,2:0,1
chr12	23807642	.	A	ATT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.021659;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,10:15,7:1,3
chr12	23971530	.	A	AATATAT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0065711;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:7,9:6,3
chr12	24811355	.	C	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0022392;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:13,5:8,3
chr12	24955965	.	C	CTTTTTTTTT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:1,6:1,5:0,1
chr12	25015163	.	T	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:4,1:3,3
chr12	25174553	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.047937;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,10:13,2:5,8
chr12	25487810	.	G	GCT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:8,3:7,1
chr12	25591811	.	C	CAGAGAG	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.034547;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:9,6:5,1
chr12	26308736	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.015698;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:7,3:4,2
chr12	28758041	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.082705;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:16,3:12,2
chr12	29253263	.	A	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.15731;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,3:18,2:7,1
chr12	29960382	.	GT	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.023174;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:12,3:8,4
chr12	31094748	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.088975;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:11,2:23,3
chr12	31606167	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.014699;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:12,10:10,5
chr12	32033307	.	C	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.092532;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,4:7,1:9,3
chr12	32393794	.	CA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.022489;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,7:6,6:2,1
chr12	32407121	.	ATT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.00091984;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,11:6,8:1,3
chr12	32432051	.	ATTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.013369;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:2,6:2,1:0,5
chr12	33886040	.	T	TATA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,3:5,1
chr12	33996063	.	T	C	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.038868;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:41,10:26,5:15,5
chr12	33996090	.	T	C	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.0015714;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:37,16:23,9:14,7
chr12	34343706	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.00055843;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:17,9:14,5
chr12	34896723	.	G	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.09755;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:2,0:31,4
chr12	34907276	.	A	AC	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.054264;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,4:0,3:19,1
chr12	34946259	.	C	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.054545;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:14,1:20,3
chr12	34993583	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.085668;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:0,0:27,4
chr12	35105084	.	G	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.034045;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:6,1:5,7
chr12	35171982	.	C	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.047637;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:19,9:12,2
chr12	35235849	.	C	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0432;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:2,0:19,4
chr12	35286257	.	G	T	0	PASS	DP=158;GPV=1;SPV=0.027638;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:69,13:53,11:16,2
chr12	35560028	.	G	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.13663;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:8,2:19,2
chr12	35577468	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.052006;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:35,4:0,0
chr12	35655158	.	C	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.029808;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:4,2:29,4
chr12	35682353	.	T	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0031482;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:36,7:22,5:14,2
chr12	35759260	.	C	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.10755;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:21,4:2,0
chr12	35801570	.	C	G	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.043079;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:45,12:6,2:39,10
chr12	35964280	.	C	T	0	PASS	DP=168;GPV=1;SPV=0.02841;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:73,17:62,13:11,4
chr12	36080780	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0015009;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:6,1:13,8
chr12	36151977	.	G	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.23248;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:9,3:9,1
chr12	36469140	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.12656;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:1,0:32,4
chr12	36469188	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.1713;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:0,0:30,4
chr12	36518398	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.011574;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:2,2:9,5
chr12	36674609	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.071318;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:13,3:7,1
chr12	36674944	.	C	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.1016;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:1,0:16,4
chr12	36959746	.	G	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.052652;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:7,1:18,5
chr12	37014517	.	A	T	0	PASS	DP=167;GPV=1;SPV=0.049161;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:92,12:66,4:26,8
chr12	37239948	.	GA	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.01632;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:17,4:9,2
chr12	37455881	.	C	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.044228;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:15,7:16,1
chr12	37656089	.	C	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.036872;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:15,2:12,3
chr12	37784945	.	AC	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.062963;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,2:5,3
chr12	38058859	.	CTTTCTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,4:2,2:12,2
chr12	38453032	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00032936;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,15:12,10:13,5
chr12	38538884	.	GTGA	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.027067;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:10,8:8,3
chr12	38538890	.	C	CATATAAAGAAGTTAAGAAG	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0080824;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,11:9,8:9,3
chr12	38636228	.	A	AT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0063848;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,16:11,11:6,5
chr12	38973727	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0078484;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:8,3:18,6
chr12	39398849	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=1.4853e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:12,7:7,9
chr12	40707247	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.037638;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:4,2:12,7
chr12	40999697	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.041917;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:8,7:4,2
chr12	42499725	.	A	AATTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.011728;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:8,4:5,6
chr12	42635112	.	CAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:4,3:4,1
chr12	42966839	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.037397;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:13,7:7,2:6,5
chr12	43419885	.	A	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00043872;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:12,3:11,7
chr12	44311831	.	G	GTA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0072523;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:8,6:16,3
chr12	44488909	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0033344;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:6,7:2,3
chr12	45899695	.	TTA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.018691;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:2,2:5,4
chr12	46089197	.	C	CTTCTTTCT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.012102;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:5,3:6,4
chr12	47261948	.	TG	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.055233;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:21,3:13,2
chr12	48172711	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.17135;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:10,3:6,2
chr12	50643045	.	A	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.086656;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:9,3:17,1
chr12	50643405	.	CTGTG	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,11:4,9:7,2
chr12	50872835	.	AT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.068288;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:16,3:10,2:6,1
chr12	51248436	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11905;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:2,4:0,3:2,1
chr12	51522310	.	T	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.033568;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:11,6:17,4
chr12	52002135	.	C	CA	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,4:0,0
chr12	55266757	.	A	AT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.041136;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:16,6:13,1
chr12	55930357	.	G	GT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:6,3:3,2
chr12	56640232	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0098129;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:12,4:10,5
chr12	56776304	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0019317;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,12:5,7:1,5
chr12	57711038	.	CAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0093911;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,8:1,7:5,1
chr12	57795072	.	C	CATAT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.022117;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,9:8,5:10,4
chr12	61106700	.	C	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0022245;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:34,8:22,3:12,5
chr12	62938722	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0084281;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,4:5,4:0,0
chr12	63438244	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0090318;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:13,4:4,3
chr12	63464165	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.012394;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:8,2:9,4
chr12	63949081	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0045492;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:12,6:10,3
chr12	64356180	.	A	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.10901;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:17,4:14,3
chr12	64540990	.	AT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0059157;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:0,1:11,6
chr12	64955122	.	G	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=4.5066e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:8,4:7,9
chr12	64983618	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:1,2:7,2
chr12	66227761	.	CA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.034547;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:12,5:2,2
chr12	68111401	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.041126;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:13,3:2,2
chr12	68331423	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=3.4893e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:10,6:12,9
chr12	68616438	.	ATT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.063892;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,7:12,6:7,1
chr12	69595688	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.013514;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:11,6:4,1
chr12	69817653	.	T	TACACAC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.042236;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,10:5,7:4,3
chr12	71193861	.	TA	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=3.8197e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,13:11,10:11,3
chr12	71877499	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.15909;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,3:3,1:1,2
chr12	72716379	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00031881;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:10,7:9,3
chr12	73715082	.	A	AAAAAAAATATAT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,7:2,4:1,3
chr12	73883284	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0016051;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:9,3:11,4
chr12	74714924	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.021859;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:3,3:5,6
chr12	75507756	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0001004;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:6,4:15,7
chr12	75905157	.	A	ATT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.10134;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:13,5:3,1
chr12	75993190	.	A	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.15872;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:18,4:15,1
chr12	75999073	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:6,6:5,3
chr12	76499350	.	C	CT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.030957;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,5:5,2:12,3
chr12	76953803	.	C	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.023923;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:2,16:2,13:0,3
chr12	79392798	.	C	CT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.021672;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,5:2,3:3,2
chr12	79410506	.	CA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.041958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,5:1,4:3,1
chr12	80462715	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.031485;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:17,1:14,9
chr12	80514402	.	A	ACACACACACTCTCT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.037397;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:6,4:7,3
chr12	82538752	.	A	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.091614;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:9,3:13,1
chr12	83337241	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.22807;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,4:5,2:6,2
chr12	83506267	.	A	AT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0038562;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:8,7:6,2
chr12	83518298	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0011889;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:10,2:9,5
chr12	83749058	.	A	AACACACACACAC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.038306;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,6:10,4:6,2
chr12	83964438	.	A	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0048152;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:12,3:9,3
chr12	84185099	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0074047;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:13,2:11,6
chr12	84301493	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=4.0736e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:12,18:6,9:6,9
chr12	84393961	.	C	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:1,1:5,3
chr12	84615985	.	TAC	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:5,2:5,2
chr12	86441639	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0051557;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:18,4:7,6
chr12	87007903	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.028995;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:13,4:15,3
chr12	87774931	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0028652;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:11,5:14,8
chr12	88365088	.	G	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.020419;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:10,7:10,3
chr12	88992260	.	ATAT	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.043711;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:13,4:10,4
chr12	89324028	.	T	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.093231;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:16,7:9,2:7,5
chr12	91106690	.	T	TAAA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0023454;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:2,6:1,4:1,2
chr12	91851986	.	T	TGATAG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.036036;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:4,2:9,2
chr12	93017161	.	CTT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.16725;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:8,3:2,1
chr12	93729785	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.022983;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,14:11,9:6,5
chr12	94759340	.	ATT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,9:2,2:2,7
chr12	95813784	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:4,3:4,1
chr12	96199480	.	C	CTG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0025584;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,10:8,7:0,3
chr12	98327081	.	A	AGTGTGTGT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0068111;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,7:4,6:1,1
chr12	98475036	.	GACACACACACACACACACAC	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,6:3,3:0,3
chr12	98555416	.	C	CTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,7:2,6:1,1
chr12	99730324	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:20,4:8,2:12,2
chr12	99897852	.	TA	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.05062;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:15,2:6,2
chr12	101451303	.	G	GTTTTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:1,6:1,4:0,2
chr12	101591855	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.11761;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:6,1:21,4
chr12	102996453	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0082367;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:7,5:13,3
chr12	103385770	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.001027;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:9,4:8,5
chr12	103460284	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,2:3,1:2,1
chr12	103716625	.	A	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00076721;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,12:12,5:16,7
chr12	105186673	.	TG	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.18481;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,4:10,1:18,3
chr12	105186676	.	T	TCG	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.20137;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:11,1:19,3
chr12	105876519	.	TAAAA	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,6:5,5:1,1
chr12	105991252	.	CTT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0079365;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:15:0,5:0,2:0,3
chr12	106103144	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=8.1008e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:11,6:8,6
chr12	106125324	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.004688;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:14,7:12,1
chr12	106770243	.	C	CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.15775;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,5:11,1:4,4
chr12	107452202	.	A	AT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.049827;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:10,7:9,2
chr12	107524073	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0074047;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:13,1:11,7
chr12	108954113	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.026877;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:7,5:4,2
chr12	109123180	.	C	CA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.018165;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:6,6:9,3
chr12	109140280	.	T	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:8,1:7,3
chr12	109979272	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.029565;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:6,5:4,2
chr12	111143813	.	T	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=9.7753e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:30,15:14,4:16,11
chr12	112797944	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0011747;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:30,14:15,10:15,4
chr12	112915265	.	G	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.01745;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:11,6:15,2
chr12	113354067	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.026006;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:2,3:3,1
chr12	113496258	.	G	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.11275;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,5:11,2:8,3
chr12	113496259	.	A	ATCTATC	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.13093;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,5:11,2:8,3
chr12	114384744	.	CA	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.040224;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:14,2:13,3
chr12	114556511	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0027454;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:20,6:10,6
chr12	114803944	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0077151;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:14,4:11,3
chr12	115416653	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.083817;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:10,2:12,2
chr12	115441810	.	CTCTCTCTCTCTATATATA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.056191;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,7:4,2:6,5
chr12	116697288	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.02039;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,7:5,6:6,1
chr12	117133313	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.094721;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,4:11,3:4,1
chr12	117265151	.	A	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=4.3702e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:30,17:15,7:15,10
chr12	117678102	.	AT	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.017137;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:11,8:10,6
chr12	118823821	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.12587;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:5,5:4,2:1,3
chr12	119189302	.	GGTGT	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0065417;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:9,17:5,11:4,6
chr12	120174789	.	C	CA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.32536;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:9,3:4,1
chr12	120876808	.	T	TAC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.016242;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:9,7:3,3
chr12	120899888	.	C	CAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.045571;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,7:12,6:4,1
chr12	120926962	.	ATATATATTATATAATATGTAT	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.175;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:2,1:3,1
chr12	121219615	.	GGATA	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0052134;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:14,11:6,6:8,5
chr12	121219623	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.030805;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:12,16:6,7:6,9
chr12	121494999	.	C	CTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.028934;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,9:11,8:5,1
chr12	121582304	.	CT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.03989;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:2,5:2,1
chr12	121604441	.	CA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.028534;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:11,7:2,1
chr12	122267207	.	C	CT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.062937;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,5:1,4:3,1
chr12	123246709	.	ATTTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:4,2:4,2
chr12	123414932	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.014654;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,10:9,8:5,2
chr12	124022613	.	G	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.046953;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,4:2,2:0,2
chr12	124230450	.	G	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0040457;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:13,8:13,2
chr12	124258456	.	C	CAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,8:3,7:2,1
chr12	124260258	.	C	CACCAGGGGCTGGGGCGAAG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.049781;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:9,6:11,8
chr12	124367275	.	GGCACACACAGAGGCCCA	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.020935;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:10,8:13,5
chr12	124922325	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.12114;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:11,2:11,2
chr12	125368947	.	G	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0083551;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:7,4:9,6
chr12	126008544	.	AT	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.047759;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:6,2:9,3
chr12	126224220	.	A	AATTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0264;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:6,4:10,5
chr12	126612633	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.017866;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:10,3:9,7
chr12	127341339	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0066425;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:5,4:17,7
chr12	128113723	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0063642;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:8,7:8,2
chr12	128242360	.	T	TCA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.18293;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:22,3:2,1
chr12	128775465	.	TG	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.096637;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:14,1:10,3
chr12	128874124	.	C	CTTTCTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.010836;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,5:0,3:4,2
chr12	129030702	.	CA	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.018421;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:20,4:6,3
chr12	129140839	.	C	CAA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.029963;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:10,9:5,4
chr12	129506555	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.01088;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:12,7:9,3
chr12	129623698	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0089009;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,5:6,4:7,1
chr12	129654467	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00037701;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:30,15:18,8:12,7
chr12	129942879	.	T	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=2.4555e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,14:17,5:5,9
chr12	129958612	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0015169;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:13,4:13,4
chr12	130905153	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.24625;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:14,3:5,1
chr12	131255918	.	T	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.09062;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:2,1:15,3
chr12	131414147	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:9,1:11,3
chr12	131451477	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.014757;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,8:3,7:3,1
chr12	131574660	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.058443;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:8,1:10,4
chr12	131925532	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:3,1:7,3
chr12	132460047	.	CT	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00019001;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:3,16:1,10:2,6
chr12	132618228	.	A	AAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,4:6,2:7,2
chr12	132965125	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,5:8,3:2,2
chr12	132981089	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:7,4:5,1:2,3
chr12	133223445	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.062192;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:15,5:2,1
chr13	18176119	.	ATTGT	A	0	PASS	DP=349;GPV=1;SPV=0.049953;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:181:129,19:57,11:72,8
chr13	18196357	.	G	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.013484;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:49,7:25,3:24,4
chr13	18242421	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00038112;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:11,6:13,6
chr13	18349087	.	TTC	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.067038;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:14,1:4,4
chr13	18460379	.	T	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.14853;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:7,5:11,1
chr13	20290669	.	T	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0015113;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:10,3:12,5
chr13	20937932	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0033344;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,10:3,7:5,3
chr13	21702976	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.10931;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:10,1:20,3
chr13	22184374	.	C	CTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.10288;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:6,5:8,1
chr13	22770497	.	C	CA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.013164;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:13,22:10,15:3,7
chr13	23055101	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.024318;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:9,6:2,2
chr13	23930675	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.083916;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,5:2,4:3,1
chr13	24664442	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.037397;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:13,16:10,12:3,4
chr13	24871958	.	C	CT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0088578;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:1,6:1,4:0,2
chr13	25101116	.	A	ATGTGTGTG	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.067079;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,6:4,5:5,1
chr13	25159298	.	G	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.046962;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,2:4,3
chr13	25310206	.	ATT	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.038747;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:7,4:6,8
chr13	25510222	.	G	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0061587;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:7,7:2,4:5,3
chr13	25560700	.	CA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.046407;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:2,5:5,1
chr13	26472514	.	ATATAT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.15441;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:5,2:4,1:1,1
chr13	26683494	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.076923;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:2,2:1,1:1,1
chr13	27051795	.	G	GATAT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.032508;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,4:2,2:3,2
chr13	28326520	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.031623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:2,4:5,2
chr13	28358395	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00056171;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:14,4:14,9
chr13	28737317	.	TTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,5:1,2:4,3
chr13	28772119	.	GAGCAGTGGTTTGTAGTTCTCCTTGA	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0015605;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:15,5:16,5
chr13	29081781	.	TTTTG	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.090553;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:14,2:9,4
chr13	29195540	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.018182;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:21:0,8:0,6:0,2
chr13	29978615	.	AAT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:4,4:4,3
chr13	30101349	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.00086221;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:20:4,16:2,12:2,4
chr13	30474759	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.037267;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:3,3:4,1
chr13	30674886	.	AT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.098383;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,5:6,2:3,3
chr13	31657376	.	CAA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.013867;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:3,7:6,1
chr13	31730519	.	TTGTGTGTG	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0077803;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,9:4,6:4,3
chr13	31860415	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0014516;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:4,7:4,2
chr13	32096802	.	C	CA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.030702;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,4:3,4:0,0
chr13	32571160	.	CT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.00052721;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,15:7,6:3,9
chr13	32631118	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0075758;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:30:1,5:1,2:0,3
chr13	33499606	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.34286;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,2:0,0:7,2
chr13	34586081	.	GAAAGAA	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.029515;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:7,6:0,1
chr13	34624031	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.048379;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:11,4:0,3
chr13	34752795	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=1.7354e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:10,19:5,12:5,7
chr13	34760342	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=2.9244e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,18:8,9:10,9
chr13	35298213	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:19:1,4:1,2:0,2
chr13	36376549	.	C	CT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.027569;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:2,3:0,2:2,1
chr13	37309075	.	CT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.037112;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,7:3,6:1,1
chr13	37320734	.	A	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.040224;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:15,4:12,1
chr13	37830561	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.030612;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:14,5:10,2
chr13	39542096	.	T	TATAATAATA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.023788;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,8:2,3:7,5
chr13	39581532	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0070393;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,9:5,7:4,2
chr13	40176928	.	AAG	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.03876;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:10,1:10,4
chr13	40368888	.	A	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.083011;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:8,5:5,2:3,3
chr13	40867524	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.023188;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:3,3:4,3
chr13	40867542	.	AT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0046977;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:3,4:3,4
chr13	41596788	.	T	TACAC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.01391;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:7,6:4,1
chr13	41758415	.	T	TGGA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.027972;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,5:2,1:1,4
chr13	41758421	.	T	TGGA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:8,1:2,4
chr13	41863360	.	TTA	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.011229;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:2,4:7,5
chr13	42109651	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0023411;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:3,4:1,1:2,3
chr13	42420881	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00011169;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:11,3:10,10
chr13	42735776	.	CGTGT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.046518;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:11,13:6,8:5,5
chr13	43003290	.	T	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00043872;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:14,5:9,5
chr13	43940611	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0084069;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:11,13:1,7:10,6
chr13	44595734	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.00020063;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:10,9:21,2
chr13	44914001	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:11:0,2:0,2:0,0
chr13	45191215	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.026054;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,6:6,5:5,1
chr13	45367313	.	TAAA	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.026533;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:6,5:3,3:3,2
chr13	45438626	.	A	AC	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.048951;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,4:1,3:2,1
chr13	45958653	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.03735;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:8,5:4,1
chr13	47126806	.	TAC	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.043255;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,14:5,10:2,4
chr13	47223657	.	C	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.031056;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:2,3:5,1
chr13	47638039	.	T	TA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.01726;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,10:5,8:6,2
chr13	48316719	.	TCACACACA	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.082213;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:9,4:2,1
chr13	50100936	.	CA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.017385;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:3,9:1,8:2,1
chr13	50298168	.	T	TTTG	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:6,1:4,3
chr13	50939361	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.20468;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:8,1:6,3
chr13	51173109	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.019857;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:20,6:12,2
chr13	51173229	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.04213;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:42,14:19,9:23,5
chr13	52260651	.	C	CAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,7:4,6:2,1
chr13	52269146	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00024273;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,12:5,6:3,6
chr13	52273946	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.012694;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:3,5:4,2
chr13	52294613	.	A	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.01473;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:7,5:4,4
chr13	53138999	.	C	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00019282;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:13,5:11,6
chr13	53306335	.	C	CAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0051869;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,9:4,4:2,5
chr13	53506715	.	TTATA	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.00090577;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,15:4,10:4,5
chr13	54937574	.	G	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.037267;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:5,2:2,2
chr13	55469091	.	CA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0051869;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:5,8:1,1
chr13	55470460	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0088503;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:10,3:11,4
chr13	55789913	.	T	TTC	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.056428;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,6:3,4:18,2
chr13	56330838	.	T	TCACACA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.01174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,10:9,7:2,3
chr13	56885075	.	TTA	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.021672;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,9:3,7:2,2
chr13	56972897	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.11618;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:19,2:15,2
chr13	57819712	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0016513;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:15,2:11,7
chr13	58487075	.	C	CA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,8:4,6:5,2
chr13	58874014	.	T	TACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,7:2,2:1,5
chr13	60136954	.	T	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:7,4:4,1:3,3
chr13	60274479	.	C	CG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.00068595;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:25:5,19:1,11:4,8
chr13	60654876	.	TATCTTC	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0012868;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:4,5:2,5
chr13	61352315	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0031242;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,11:5,2:3,9
chr13	62171594	.	CA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0070393;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:7,8:2,1
chr13	63379882	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0019465;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:32,14:11,7:21,7
chr13	63470281	.	C	CTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.041455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:5,1:9,3
chr13	63624958	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:7,4:2,1
chr13	63802967	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0087567;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:5,7:1,1
chr13	63822620	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0065876;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:1,1:3,3
chr13	63932648	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0071887;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:15,1:9,5
chr13	63932654	.	CACAT	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.050247;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:16,1:13,3
chr13	64375072	.	C	CA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0028686;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,11:5,9:0,2
chr13	64408293	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.092234;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,6:5,5:4,1
chr13	64571486	.	T	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,5:3,3:3,2
chr13	64789649	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,10:11,7:0,3
chr13	64960992	.	TCCC	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.01205;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,7:3,1:6,6
chr13	65857034	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00021022;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:11,5:10,5
chr13	66196318	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.092279;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:9,4:11,1
chr13	66196322	.	GTA	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.077195;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:8,4:10,1
chr13	66408050	.	C	CTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0010668;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,11:4,9:4,2
chr13	67380412	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,4:4,4:0,0
chr13	67650889	.	GTATATATATATATA	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.031623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,8:3,4:4,4
chr13	69719209	.	TGAGAGA	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.026515;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:2,5:2,1:0,4
chr13	70336794	.	GAGAGTTGCA	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.013477;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:17,4:11,2
chr13	70366060	.	G	GTGTGTGTGTGTGTA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.001026;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:4,12:1,9:3,3
chr13	71412339	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=4.7337e-05;SS=2;SSC=43;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,14:3,10:3,4
chr13	71748962	.	TTC	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.00022277;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,15:5,3:4,12
chr13	72603496	.	AAGAAAGAAAAAG	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.020232;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:15,6:3,6
chr13	73040203	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0068111;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:4,6:1,1
chr13	73094185	.	CAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.11832;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,9:12,8:2,1
chr13	74166087	.	C	CT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0053554;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:7,15:3,11:4,4
chr13	74287349	.	T	TGAGAGAGAGAGAGAGA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,9:6,7:5,2
chr13	74545816	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.019341;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:11,9:10,8:1,1
chr13	74547840	.	ATAT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.1958;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,3:4,1:1,2
chr13	75544926	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,8:5,7:4,1
chr13	75915955	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.018691;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,15:5,10:2,5
chr13	76715899	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.26667;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:6,2:3,1:3,1
chr13	77360844	.	C	CTT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0007326;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:0,11:0,8:0,3
chr13	78558913	.	C	CT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.035714;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,7:8,1:16,6
chr13	79706055	.	T	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.060184;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,8:9,5:27,3
chr13	80095207	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.045809;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:1,2:15,10
chr13	80728695	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.021073;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:10,5:6,2:4,3
chr13	80771699	.	CA	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0058774;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:12,15:9,13:3,2
chr13	81039678	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.0051535;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:43,11:19,5:24,6
chr13	81457537	.	T	TTATATATATATATATA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.06993;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,4:2,2:2,2
chr13	81666746	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.052719;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:13,4:14,1
chr13	81717309	.	G	GTATATATATA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,4:3,1:1,3
chr13	82246369	.	ATG	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.24135;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:18,2:10,2
chr13	82667206	.	AT	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:7,1:1,3
chr13	83096328	.	GAA	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.28142;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:17,2:2,2
chr13	85051181	.	GT	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.021739;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,6:5,5:4,1
chr13	85437381	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.031686;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:8,8:10,1
chr13	85744942	.	T	TTA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.22636;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,4:11,1:11,3
chr13	86281340	.	A	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.087004;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:14,1:18,3
chr13	86303868	.	T	TTATTATATTA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.13793;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:13,14:7,5:6,9
chr13	86551900	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00025277;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:8,23:6,19:2,4
chr13	86847055	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.099672;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:16,2:22,3
chr13	87679835	.	AGTATATATATAGTATATATAGTATATAT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.021743;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:10,3:9,3
chr13	87679863	.	T	TATA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0032306;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:5,7:2,2:3,5
chr13	87807205	.	C	CATATATATATAT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.03028;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:8,2:0,3
chr13	87961529	.	T	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,3:4,1:2,2
chr13	88130374	.	TAAAC	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0091533;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:6,6:2,3:4,3
chr13	88700035	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0019186;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,13:5,11:4,2
chr13	88870847	.	C	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0024264;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:4,6:2,3
chr13	89520126	.	T	TAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.035545;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,8:8,4:5,4
chr13	89774044	.	A	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.011071;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:7,9:4,5:3,4
chr13	89782008	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.23683;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,5:21,4:9,1
chr13	90158149	.	GT	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.047472;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:4,4:1,1:3,3
chr13	90467158	.	T	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00059141;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:36,15:16,7:20,8
chr13	90654924	.	A	AT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00129;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:25:0,4:0,1:0,3
chr13	90715022	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.030397;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:12,4:16,4
chr13	90795124	.	CTT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.25496;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:11,1:16,3
chr13	92109061	.	G	GT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.019341;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,9:6,6:5,3
chr13	92264878	.	C	CTGTG	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.021691;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:11,16:6,10:5,6
chr13	92513552	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:6,3:1,1:5,2
chr13	92513554	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:6,3:1,1:5,2
chr13	92965085	.	T	TA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.013985;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,11:6,7:3,4
chr13	93003909	.	T	TA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.27368;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,7:4,5:7,2
chr13	93300166	.	G	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.01564;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:47,10:22,5:25,5
chr13	93324613	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.001548;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:4,8:3,6:1,2
chr13	93495730	.	A	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=3.4001e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:8,18:3,12:5,6
chr13	93596614	.	T	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.03028;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:8,5:6,3:2,2
chr13	94742090	.	A	AT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.048122;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,8:3,4:4,4
chr13	95264864	.	CT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.038406;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:8,13:5,9:3,4
chr13	95296135	.	A	AAC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0055603;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:15,15:13,12:2,3
chr13	95679199	.	C	CT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=1.9163e-05;SS=2;SSC=47;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:9,22:5,15:4,7
chr13	97069725	.	C	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.00052251;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:38,20:17,9:21,11
chr13	97856273	.	G	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0025106;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:37,12:13,6:24,6
chr13	97869478	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.00024683;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:36,14:15,10:21,4
chr13	98419483	.	T	TACACACAC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00056896;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:11,20:6,15:5,5
chr13	98647913	.	A	ATGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.025586;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,12:3,9:8,3
chr13	98781281	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=4.0454e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:25:6,19:3,10:3,9
chr13	100043996	.	A	AT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.028886;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:3,3:6,6
chr13	100577456	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.14744;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:17,1:18,3
chr13	100817236	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0066141;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,6:0,2:3,4
chr13	101035623	.	T	TTG	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.043618;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:16,18:10,10:6,8
chr13	101280880	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.00010594;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:7,18:6,16:1,2
chr13	101332397	.	C	CAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,11:9,10:2,1
chr13	101360230	.	CCT	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0768;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:16,4:14,4
chr13	101439208	.	C	CTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,8:4,5:3,3
chr13	101557807	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.002945;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:16,7:11,2
chr13	101847630	.	C	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.00010236;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:39,18:22,9:17,9
chr13	101973120	.	T	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=6.4484e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:50:2,12:1,6:1,6
chr13	102096003	.	A	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0052174;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:6,6:4,4:2,2
chr13	102378627	.	C	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.017534;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:2,5:1,4:1,1
chr13	102452868	.	A	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0047061;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:44,10:22,4:22,6
chr13	102534693	.	TAA	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00012397;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:14,28:7,16:7,12
chr13	103040587	.	T	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0013445;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:37,13:14,5:23,8
chr13	103349821	.	T	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.010634;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:45,11:29,6:16,5
chr13	103458657	.	GAT	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0062769;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,13:11,7:11,6
chr13	104632370	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,2:6,2
chr13	105065149	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.030617;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,7:24,3:17,4
chr13	106474855	.	T	C	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.035139;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:55,9:34,8:21,1
chr13	107021828	.	A	AG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.021691;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,5:3,4:8,1
chr13	108636367	.	T	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.063509;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,7:13,1:8,6
chr13	108795574	.	G	C	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.029243;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:57,7:28,4:29,3
chr13	109095234	.	G	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=1.5926e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:30,22:14,15:16,7
chr13	111491494	.	C	CTCTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.037267;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,12:1,8:6,4
chr13	111859141	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0091533;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:6,11:1,4:5,7
chr13	112192625	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.19619;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:20,2:16,3
chr13	112196519	.	GTCCCCTGGTTTCCTGGT	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.28142;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:4,3:15,1
chr13	112197128	.	T	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.01549;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:14,4:5,5
chr13	112238982	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.21542;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:7,1:29,4
chr13	112241832	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.014654;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,10:5,5:9,5
chr13	112296774	.	G	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.021694;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:39,18:27,4:12,14
chr13	112440897	.	G	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=4.4228e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:0,12:0,8:0,4
chr13	112598998	.	C	CA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.037909;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:17,3:16,4
chr13	113089460	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.035813;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:37,6:23,3:14,3
chr13	113142386	.	A	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0021645;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:37:0,5:0,2:0,3
chr13	113152420	.	A	G	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0077782;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:50,11:21,6:29,5
chr13	113876048	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.16049;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:17,3:14,2
chr13	114020180	.	T	TAGC	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0021876;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,16:7,15:0,1
chr13	114028253	.	C	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.048875;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:4,5:11,3
chr13	114032815	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
chr13	114032822	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
chr14	18245579	.	A	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.048379;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:2,1:9,6
chr14	18245622	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.040398;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:1,3:11,7
chr14	18275569	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.049732;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:19,1:7,6
chr14	18312423	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.20399;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:8,3:8,1
chr14	18321677	.	T	A	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.003305;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:56,9:25,5:31,4
chr14	18605999	.	C	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0035942;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:37,10:22,4:15,6
chr14	18611398	.	G	T	0	PASS	DP=135;GPV=1;SPV=0.0091195;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:60,12:22,2:38,10
chr14	18616363	.	T	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.062963;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,2:5,3
chr14	18625668	.	T	C	0	PASS	DP=177;GPV=1;SPV=0.014869;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:110:95,15:47,8:48,7
chr14	18679857	.	TA	T	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.029181;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:58,14:24,9:34,5
chr14	18695892	.	A	G	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.028161;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:45,8:16,7:29,1
chr14	18876682	.	A	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.017984;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:39,9:16,4:23,5
chr14	18882906	.	T	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.11302;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:0,0:21,4
chr14	18886836	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.080744;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:10,3:10,2
chr14	18889655	.	C	T	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.0079997;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:68,10:37,7:31,3
chr14	18953973	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.035087;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:4,3:14,7
chr14	18977294	.	C	T	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.039232;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:55,9:12,3:43,6
chr14	18979413	.	G	T	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
chr14	19060893	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:8,2:2,2
chr14	19073256	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:10,3:2,1
chr14	19120520	.	C	A	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=0.041668;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:68,11:32,6:36,5
chr14	19121026	.	T	G	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.045497;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:55,13:30,8:25,5
chr14	19201477	.	C	T	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.0075608;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:50,20:21,17:29,3
chr14	19284994	.	T	A	0	PASS	DP=224;GPV=1;SPV=0.04268;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:122:107,15:71,10:36,5
chr14	19292460	.	G	A	0	PASS	DP=206;GPV=1;SPV=0.011417;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:125:105,20:46,13:59,7
chr14	19338757	.	G	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.022851;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:23,5:4,4
chr14	19366231	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.058162;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:0,0:13,4
chr14	19399403	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.099968;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:16,2:5,3
chr14	19420974	.	A	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.015138;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:43,12:1,1:42,11
chr14	19432749	.	A	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.086656;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:19,3:7,1
chr14	19466921	.	C	CACA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.013932;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:3,3:0,2
chr14	19480483	.	G	A	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.0081832;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:55,16:28,11:27,5
chr14	19681182	.	C	CA	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.015845;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:55,12:36,7:19,5
chr14	21666700	.	GTT	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0045608;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:15,17:5,10:10,7
chr14	22058785	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.10123;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:16,2:10,2
chr14	22817138	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.062277;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:11,3:13,2
chr14	23109669	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=5.5231e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:12,7:8,4
chr14	24670987	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0053737;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:21,5:13,5
chr14	24719516	.	ATGTG	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0054348;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:5,6:3,1
chr14	25124162	.	C	CAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.010217;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:5,8:3,7:2,1
chr14	25570574	.	A	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0002055;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:11,5:11,7
chr14	26041553	.	AACAC	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.053922;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,7:2,6:4,1
chr14	26204430	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.49123;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,4:5,3:8,1
chr14	26734958	.	C	CA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.010225;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:9,6:4,5
chr14	26771706	.	A	ATT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0046784;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,11:4,5:2,6
chr14	27101424	.	C	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=6.057e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:35,16:17,7:18,9
chr14	27387169	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.12308;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:5,3:2,1:3,2
chr14	27827512	.	C	CTTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.041509;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:12,8:5,5
chr14	28593149	.	G	GTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.3064;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:9,3:6,1
chr14	29171225	.	A	ATTT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.16205;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,6:15,2:7,4
chr14	30193259	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.028362;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:11,3:13,2
chr14	31124809	.	AT	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.014776;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:9,10:9,2
chr14	33024172	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.077206;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:15,5:21,1
chr14	33981523	.	AAC	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.024242;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:31:1,3:0,2:1,1
chr14	34463652	.	CAG	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.001388;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,17:4,6:13,11
chr14	34876605	.	A	AT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0032683;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:4,6:9,5
chr14	35131533	.	T	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.3956;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:7,2:5,1:2,1
chr14	35557098	.	A	ATGTGTG	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,6:5,5:2,1
chr14	35727310	.	CATAT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=5.3843e-05;SS=2;SSC=42;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:3,10:2,5:1,5
chr14	36083488	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0032051;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:3,2:7,9
chr14	36824460	.	T	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0014372;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:6,4:11,4
chr14	39761386	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.10738;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:18,2:13,2
chr14	40247215	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.035377;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:35,10:16,3:19,7
chr14	41023865	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.015886;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:11,4:20,4
chr14	41044383	.	A	AAAGAAG	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.044901;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,5:9,2:9,3
chr14	41079335	.	CAAAAAA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0032765;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:4,7:1,5:3,2
chr14	41405734	.	T	TA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.091388;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:11,5:4,1
chr14	41886019	.	C	CAAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,5:9,4:0,1
chr14	44191188	.	ATGTG	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.009628;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,10:7,7:3,3
chr14	47827124	.	C	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00077059;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:30,13:16,6:14,7
chr14	49009544	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0095989;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:15,2:14,5
chr14	49603511	.	T	TTTC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.043382;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:3,2:8,2
chr14	50023209	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,4:7,2:2,2
chr14	50344469	.	T	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.10613;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,5:6,4:7,1
chr14	50945542	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.040458;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:6,6:4,1
chr14	50957320	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.030556;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:10,5:6,4:4,1
chr14	50964037	.	C	CAAA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.17217;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,5:5,4:4,1
chr14	51324352	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0027568;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:9,5:10,4
chr14	51932246	.	C	CA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0040134;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:4,5:2,1
chr14	52104297	.	G	GGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0020744;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,11:6,9:7,2
chr14	52625481	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.065801;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:7,1:8,3
chr14	52807896	.	C	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,4:5,2:7,2
chr14	53213985	.	T	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0032284;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:13,6:8,3
chr14	54085541	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.046953;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:2,8:2,6:0,2
chr14	54614462	.	G	GA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=6.3368e-05;SS=2;SSC=41;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:10,8:7,5
chr14	54683675	.	A	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.015088;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:12,4:17,3
chr14	54684619	.	C	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.014142;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:1,1:4,5
chr14	55109888	.	CA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0088413;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:4,5:0,1
chr14	55281255	.	T	TAAA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.074661;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,6:2,3:4,3
chr14	55295533	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.019947;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:14,4:13,2
chr14	56031544	.	C	CTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.25463;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,5:9,4:4,1
chr14	59048006	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=8.0194e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:15,24:9,10:6,14
chr14	60008136	.	T	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0040978;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:16,4:11,4
chr14	60695300	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.016495;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:7,5:13,3
chr14	61341395	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0055492;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:15,2:12,5
chr14	62242991	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.010153;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:17,5:12,6
chr14	62599975	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.040363;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:13,6:9,2
chr14	64014929	.	TTATATATATATA	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,4:5,2:1,2
chr14	64358998	.	T	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.071698;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:13,3:10,2
chr14	64359307	.	T	TG	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.048122;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:1,4:6,4
chr14	64518904	.	G	GTATATA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.026006;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:5,4:0,0
chr14	65307895	.	GT	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0029526;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:16,16:7,10:9,6
chr14	66048070	.	T	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.01095;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,10:5,7:4,3
chr14	67506487	.	T	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00067152;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:7,5:9,4
chr14	69180568	.	T	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0006809;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:13,5:18,5
chr14	69249069	.	A	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:1,2:1,1:0,1
chr14	69533808	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.057437;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:15,2:16,4
chr14	72113100	.	A	ATG	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.11505;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:16,3:15,1
chr14	72148129	.	TAA	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.002173;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:3,9:1,6:2,3
chr14	72664643	.	T	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.020413;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:4,1:15,6
chr14	72915303	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0033813;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:14,3:1,5
chr14	73095606	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.013111;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:6,8:10,5
chr14	74477088	.	A	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:5,1:7,3
chr14	75494381	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0026122;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,14:8,6:3,8
chr14	75636481	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0047469;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:13,4:10,6
chr14	77645594	.	T	TAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0058007;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:3,9:1,6:2,3
chr14	77678087	.	C	CAAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,4:3,3:3,1
chr14	78225972	.	TTG	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.057853;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:12,3:10,4
chr14	78225986	.	T	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.098394;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,1:13,3
chr14	79119795	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00013352;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:16,19:8,7:8,12
chr14	79427830	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.021798;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,7:7,5:6,2
chr14	79515195	.	A	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0004233;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:17,6:13,6
chr14	79624800	.	TTTG	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0091926;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,16:5,7:10,9
chr14	79629839	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.088935;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,4:9,2:9,2
chr14	81226099	.	T	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:8,2:4,2
chr14	81807963	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.23248;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:8,3:10,1
chr14	82950356	.	C	CAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1839;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,5:7,4:5,1
chr14	83686764	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00063544;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:16,6:5,6
chr14	83855476	.	C	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.011145;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:7,3:12,3
chr14	84276774	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.091248;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:4,2:11,3
chr14	84695017	.	T	TACACACAC	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.040508;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:11,6:5,2
chr14	85595251	.	A	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.012894;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:8,3:13,3
chr14	85927893	.	T	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.046683;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:6,2:10,3
chr14	89392637	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.048872;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:5,4:3,1
chr14	89772721	.	T	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.27277;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:1,0:20,4
chr14	90352446	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:9,3:3,1
chr14	91365168	.	T	TCCCTCAC	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0094957;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:19,6:12,6
chr14	91988633	.	T	TA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0087645;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:13,8:3,3
chr14	92167014	.	C	CTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.031857;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:1,7:0,6:1,1
chr14	94472507	.	G	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.028465;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:13,3:12,2
chr14	94737322	.	CA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.012829;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:12,5:5,2
chr14	95066559	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.046615;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:6,5:9,3
chr14	95066560	.	C	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.045954;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:8,5:9,3
chr14	95242261	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.020642;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:11,7:7,3
chr14	95479224	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,6:4,3:2,3
chr14	95558897	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.090194;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:14,1:9,3
chr14	96403114	.	T	TTAAATAAATAAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.048122;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,8:1,6:6,2
chr14	97903510	.	T	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.31818;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:5,2:4,1:1,1
chr14	97936171	.	T	TTTTTC	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:4,1:11,3
chr14	98204657	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0020369;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:4,5:19,3
chr14	98492110	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00030588;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,15:13,10:13,5
chr14	98744899	.	GT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.029563;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:7,5:2,2
chr14	98781380	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.035372;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:4,4:4,2
chr14	100621256	.	G	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.032567;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:16,5:9,6
chr14	102228700	.	A	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.3956;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:7,2:5,1:2,1
chr14	102315820	.	TACACACACACACACACACACACACAC	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.049017;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,6:8,4:1,2
chr14	103572787	.	A	AT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.17135;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,5:7,4:9,1
chr14	103952216	.	ATATATTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.12821;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,2:3,1:0,1
chr14	104499251	.	G	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.020919;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:15,5:7,1
chr14	104566594	.	C	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.0025995;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:17,4:17,6
chr14	104683291	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0067142;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,18:11,15:7,3
chr14	104685999	.	G	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,2:2,2:0,0
chr14	105327896	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0019162;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:39,12:26,7:13,5
chr14	105633937	.	T	A	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.036062;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:52,10:27,5:25,5
chr14	105639924	.	C	T	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.032003;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:56,9:36,7:20,2
chr14	105654804	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.16038;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:12,1:20,3
chr14	105699669	.	A	T	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=0.029471;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:58,15:35,9:23,6
chr14	106220507	.	TTC	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0023163;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,17:5,11:14,6
chr14	106626217	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.7288e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:24,15:10,9:14,6
chr15	18533186	.	T	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:9,4:1,0
chr15	19434997	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.077483;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,5:25,5:2,0
chr15	19859576	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0024274;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,12:1,10:7,2
chr15	19913009	.	A	AATGTGGTC	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.049607;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:47,8:20,2:27,6
chr15	20019797	.	C	T	0	PASS	DP=237;GPV=1;SPV=0.042489;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:101,17:60,8:41,9
chr15	20142002	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.015088;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:1,2:28,5
chr15	20142988	.	C	T	0	PASS	DP=225;GPV=1;SPV=0.021552;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:129:105,24:52,12:53,12
chr15	20166342	.	CA	C	0	PASS	DP=136;GPV=1;SPV=0.015443;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:57,8:37,6:20,2
chr15	20183018	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.24396;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:18,3:15,1
chr15	20273978	.	G	A	0	PASS	DP=416;GPV=1;SPV=0.0025103;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:223:196,27:120,18:76,9
chr15	20309395	.	G	A	0	PASS	DP=282;GPV=1;SPV=0.037602;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:161:100,12:57,8:43,4
chr15	20314793	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.016979;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:15,8:9,3
chr15	20669457	.	G	C	0	PASS	DP=481;GPV=1;SPV=0.040058;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:279:240,39:109,15:131,24
chr15	20686189	.	TA	T	0	PASS	DP=202;GPV=1;SPV=0.035492;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:112:91,21:55,14:36,7
chr15	20686218	.	C	T	0	PASS	DP=188;GPV=1;SPV=0.0019526;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:75,27:46,18:29,9
chr15	20733898	.	G	T	0	PASS	DP=262;GPV=1;SPV=0.048201;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:144:129,15:78,10:51,5
chr15	20738533	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.090639;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:0,0:34,4
chr15	20749113	.	C	T	0	PASS	DP=286;GPV=1;SPV=0.045336;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:121,19:68,8:53,11
chr15	20749323	.	G	A	0	PASS	DP=257;GPV=1;SPV=0.048639;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:144:125,19:38,6:87,13
chr15	20756584	.	G	A	0	PASS	DP=288;GPV=1;SPV=0.019754;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:158:129,29:84,18:45,11
chr15	20785986	.	G	C	0	PASS	DP=229;GPV=1;SPV=0.028546;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:136:115,21:53,10:62,11
chr15	20900873	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.059574;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:18,3:2,1
chr15	20940208	.	C	A	0	PASS	DP=345;GPV=1;SPV=0.01286;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:193:172,21:73,4:99,17
chr15	21024854	.	G	A	0	PASS	DP=307;GPV=1;SPV=0.033866;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:169:143,26:58,12:85,14
chr15	21061789	.	GA	G	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.030763;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:53,8:35,7:18,1
chr15	21069794	.	A	G	0	PASS	DP=205;GPV=1;SPV=0.037504;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:94,19:46,12:48,7
chr15	21122270	.	A	C	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.028316;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:50,9:32,5:18,4
chr15	21266784	.	C	T	0	PASS	DP=444;GPV=1;SPV=0.021614;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:261:222,39:100,18:122,21
chr15	21272114	.	C	T	0	PASS	DP=428;GPV=1;SPV=0.029006;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:235:210,25:119,18:91,7
chr15	21310653	.	G	A	0	PASS	DP=156;GPV=1;SPV=0.018842;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:57,9:20,1:37,8
chr15	21360144	.	G	A	0	PASS	DP=184;GPV=1;SPV=0.043197;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:83,12:47,7:36,5
chr15	21374563	.	C	T	0	PASS	DP=369;GPV=1;SPV=0.038401;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:218:192,26:104,14:88,12
chr15	21431840	.	G	C	0	PASS	DP=312;GPV=1;SPV=0.011137;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:182:161,21:76,7:85,14
chr15	21482389	.	C	T	0	PASS	DP=157;GPV=1;SPV=0.007533;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:73,13:47,8:26,5
chr15	21525853	.	CA	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.023519;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:37,7:15,3:22,4
chr15	21535775	.	T	TG	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.036691;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:22,3:22,2
chr15	21550026	.	C	T	0	PASS	DP=144;GPV=1;SPV=0.0026245;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:71,19:38,4:33,15
chr15	21562361	.	A	G	0	PASS	DP=166;GPV=1;SPV=0.016109;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:101:82,19:29,6:53,13
chr15	21586885	.	A	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.032319;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:22,9:1,1
chr15	21657253	.	C	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.012544;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:3,1:15,6
chr15	21755344	.	A	AT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0012236;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:3,5:5,3
chr15	22085514	.	A	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.048994;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,5:12,4:2,1
chr15	22250653	.	A	G	0	PASS	DP=211;GPV=1;SPV=0.011067;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:124:103,21:51,13:52,8
chr15	22253145	.	T	C	0	PASS	DP=286;GPV=1;SPV=0.007382;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:149:123,26:67,13:56,13
chr15	22266345	.	A	G	0	PASS	DP=256;GPV=1;SPV=0.023147;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:147:123,24:60,14:63,10
chr15	22295485	.	A	G	0	PASS	DP=224;GPV=1;SPV=0.04268;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:122:107,15:50,7:57,8
chr15	22424314	.	GC	G	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.02354;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:57,12:31,8:26,4
chr15	22436984	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.053073;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:24,3:9,3
chr15	24813200	.	G	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.030898;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:15,5:6,2
chr15	25261750	.	A	AAT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.039683;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:1,4:1,2:0,2
chr15	26060244	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0040413;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:9,6:13,1
chr15	26510669	.	T	TAC	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.021122;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:4,3:7,5
chr15	26709515	.	CTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0063246;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,8:2,6:3,2
chr15	27002763	.	AGG	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.076628;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:7,1:5,3
chr15	27002769	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.1016;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:9,1:8,3
chr15	27255740	.	C	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0011386;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:13,4:8,5
chr15	28513574	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.036642;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:6,1:10,5
chr15	28528140	.	T	TAC	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:0,0:8,4
chr15	29517443	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=6.2405e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:8,5:15,9
chr15	30095073	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00084999;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:11,2:10,8
chr15	30227814	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0026644;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,17:8,8:9,9
chr15	30443176	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0024454;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:8,8:7,3
chr15	30521653	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.029764;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:14,5:16,5
chr15	30929794	.	TATA	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.017385;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:1,4:2,2
chr15	31144918	.	G	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.025864;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:16,2:8,4
chr15	32187948	.	C	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.048263;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:16,3:18,7
chr15	32567664	.	G	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.078276;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:7,3:13,1
chr15	32573700	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.025704;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:15,5:14,5
chr15	32864382	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.022687;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:11,5:9,6
chr15	33664591	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.072018;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:8,3:5,3
chr15	36916095	.	G	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.012389;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:16,2:7,6
chr15	38094375	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.079729;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:11,4:18,2
chr15	39696870	.	CTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:3,3:1,1
chr15	39916855	.	G	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=2.3992e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:11,7:6,4
chr15	40143255	.	T	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.01192;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:5,6:2,2:3,4
chr15	40358260	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.012197;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:36,7:23,3:13,4
chr15	40861101	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0035182;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:14,3:11,7
chr15	40960264	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00071485;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:11,9:10,5
chr15	41271250	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.036896;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:5,7:5,2
chr15	41301970	.	TAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.02039;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,7:8,4:3,3
chr15	43510513	.	A	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.083134;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:15,2:15,2
chr15	43554620	.	T	TAC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.017609;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:10,5:2,2
chr15	43559845	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.013521;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:14,2:10,10
chr15	43875367	.	T	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:3,2:5,2
chr15	45724917	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0027092;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:8,3:6,5
chr15	47573209	.	A	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0050608;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:14,6:18,4
chr15	47820587	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.036036;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:10,3:3,1
chr15	50087356	.	T	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.055494;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:13,1:10,3
chr15	51177593	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.065489;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:9,1:8,3
chr15	51418432	.	A	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00014188;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:9,5:10,8
chr15	51584112	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:4,2:2,1
chr15	51747017	.	T	TA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.023024;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:11,4:2,4
chr15	51963897	.	C	CAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.22085;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,4:7,3:8,1
chr15	52801334	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=4.5156e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:11,8:11,7
chr15	53068572	.	TTG	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0072753;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:5,5:10,8
chr15	53317388	.	A	AT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.3107;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:16,1:11,3
chr15	56920920	.	T	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00049463;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:16,9:10,4
chr15	57688496	.	C	CTA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.023342;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,6:9,3:6,3
chr15	57723856	.	C	CAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.030435;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:7,4:2,1
chr15	58377542	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0071404;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:14,8:19,4
chr15	58573125	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.17679;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,4:8,3:8,1
chr15	59448526	.	A	AAGATAGATAGAT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.042122;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:2,4:14,4
chr15	59448587	.	G	GT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.036146;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:6,5:7,5
chr15	59518117	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0030715;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:29,13:14,8:15,5
chr15	59761668	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.1016;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:1,1:16,3
chr15	59761671	.	TCTC	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.087777;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:1,1:20,4
chr15	60060005	.	G	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.03809;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:16,4:2,3
chr15	60065017	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.035088;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:4,3:2,1
chr15	60624399	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.01971;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:6,5:4,4
chr15	61277734	.	T	TC	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.047386;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:3,4:1,1:2,3
chr15	61293976	.	G	GAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.024476;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:2,8:0,6:2,2
chr15	61304939	.	G	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.00010991;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:18,4:8,7
chr15	61716841	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.016244;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:17,10:9,5:8,5
chr15	61914878	.	TAAAAAAA	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.014884;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,8:3,6:0,2
chr15	62437754	.	T	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.022061;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:13,2:8,6
chr15	62693955	.	CTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.090909;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,6:2,3:1,3
chr15	62741750	.	T	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:1,2:4,2
chr15	63376598	.	CTT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.030729;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:4,4:8,1
chr15	63581459	.	C	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0044617;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,14:5,9:5,5
chr15	65400078	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0024549;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:16,7:8,6
chr15	65994017	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.028734;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:13,3:15,2
chr15	69127249	.	CAAA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030844;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:10,4:4,1
chr15	69330881	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0016174;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:17,6:6,3
chr15	69556773	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.05251;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:12,1:3,3
chr15	71391815	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.002405;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,12:13,7:16,5
chr15	71459160	.	CTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.015103;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:4,3:2,4
chr15	72665926	.	G	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.043774;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:38,12:30,10:8,2
chr15	74111138	.	T	TA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0066141;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,6:0,4:3,2
chr15	74818014	.	G	GA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.03685;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,6:10,5:3,1
chr15	74964463	.	C	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.017892;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:14,6:13,1
chr15	77458794	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00011945;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:30,17:17,6:13,11
chr15	77509555	.	CGTGTGT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.03028;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,5:4,3:4,2
chr15	80030913	.	TCCAA	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.037765;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:6,3:14,3
chr15	80031051	.	CAACCTATGCAAT	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.12627;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:20,1:10,3
chr15	82079195	.	A	ATTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.10613;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,5:5,3:8,2
chr15	82354580	.	C	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0069028;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:15,4:5,8
chr15	82363710	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.022366;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:10,8:4,1
chr15	82369924	.	CTG	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.009324;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,6:1,1:1,5
chr15	82580413	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.029893;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:19,3:4,3
chr15	83055658	.	C	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00096763;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,15:10,6:4,9
chr15	84181735	.	A	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.001132;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:28,15:16,8:12,7
chr15	84361182	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.01412;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:4,5:16,2
chr15	84563456	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.011374;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,10:3,7:2,3
chr15	84708205	.	C	CAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.04958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,6:8,5:1,1
chr15	84777695	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:3,8:2,5:1,3
chr15	85351617	.	CT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0047011;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,14:7,5:6,9
chr15	85896280	.	G	GTC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.018203;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:5,3:8,6
chr15	86143457	.	A	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0017947;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:12,4:10,3
chr15	88117084	.	C	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=1.6212e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:8,8:10,6
chr15	88944963	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.019346;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:6,6:7,5
chr15	90444281	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.02914;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:4,6:8,2
chr15	90517510	.	C	CTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.031264;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:7,5:5,1
chr15	90836843	.	A	AT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.006865;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:3,15:3,9:0,6
chr15	91417686	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00052;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:23,15:11,8:12,7
chr15	91631790	.	CTG	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0026899;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:11,13:4,9:7,4
chr15	92889476	.	CA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.019656;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:5,4:8,1
chr15	92889487	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0057971;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:2,4:5,2
chr15	95367844	.	T	TAC	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,3:3,2:0,1
chr15	95796674	.	AAAGAAAG	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:8,3:2,1
chr15	96327526	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.12945;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:17,2:18,2
chr15	97169140	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00021002;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:14,6:9,8
chr15	98497459	.	GTTT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.17677;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,5:11,2:3,3
chr15	98869434	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.038747;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:10,8:3,1
chr15	100620534	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.019346;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:10,3:3,5
chr15	100672746	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:4,1:3,4
chr15	101615634	.	TGCATGCACTGTGGATGTGGCCTGCCCTCTAAGTGCC	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.046824;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:38,9:18,6:20,3
chr15	101766901	.	T	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0031408;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,13:10,3:4,10
chr15	101870043	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10105;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:5,1:11,4
chr15	101892736	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.15775;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:3,3:12,2
chr16	12060	.	G	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0493;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:15,4:11,1
chr16	29811	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.023415;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:23,9:10,3
chr16	239457	.	CA	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00044356;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:14,18:11,14:3,4
chr16	382087	.	C	CG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.035545;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:6,4:7,4
chr16	661016	.	G	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.0067873;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,6:0,1:3,5
chr16	665325	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.072845;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:11,2:18,3
chr16	1267169	.	CA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.035545;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,14:9,9:4,5
chr16	1329545	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0013799;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:7,7:11,7
chr16	1604274	.	C	CGTGTGTGT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.023692;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:11,10:9,8:2,2
chr16	2263435	.	C	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=2.233e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,15:16,6:10,9
chr16	2861376	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.011419;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:14,3:15,5
chr16	3190749	.	T	TA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.068571;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,6:17,3:8,3
chr16	4181197	.	TA	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.023376;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:5,5:6,3
chr16	4197421	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:7,3:3,2
chr16	4262559	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=5.0036e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:10,8:14,6
chr16	4889232	.	G	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.11404;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:8,2:2,3
chr16	5010188	.	CAA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:7,4:0,0
chr16	5255342	.	A	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.029934;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:5,2:13,4
chr16	5825800	.	T	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.015558;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:12,4:7,8
chr16	6253673	.	GCA	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.23992;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:21,3:9,1:12,2
chr16	6398866	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.010118;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:42,8:23,6:19,2
chr16	6480050	.	G	GA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0079095;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,11:5,10:0,1
chr16	7557619	.	C	CA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0081269;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,5:3,4:1,1
chr16	7932626	.	CAT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.026014;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:5,3:10,1
chr16	9607235	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0015608;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,6:3,5:2,1
chr16	10802286	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.091659;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,6:5,5:8,1
chr16	11330221	.	ATT	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.014884;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,8:3,7:0,1
chr16	12019587	.	T	TATAG	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0045492;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:13,5:9,4
chr16	12075215	.	G	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0011386;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:10,4:11,5
chr16	12851012	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0737;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:7,4:8,2
chr16	13987297	.	CT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.010728;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:3,3:3,3
chr16	14329386	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.020376;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:4,5:7,2
chr16	14371882	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.15773;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:18,4:10,3:8,1
chr16	14834687	.	G	GT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,4:6,2:4,2
chr16	14938413	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.036143;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:38,10:19,2:19,8
chr16	14953358	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.075461;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:18,3:5,4
chr16	15127800	.	C	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0088777;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:47,12:24,5:23,7
chr16	15167877	.	C	CAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0014624;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:10,5:9,6
chr16	15302112	.	G	GAC	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.035771;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:47,12:25,2:22,10
chr16	15307890	.	T	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:0,0:7,4
chr16	15360843	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0065876;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:0,0:4,4
chr16	15472860	.	C	CT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.019258;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:12,9:4,2
chr16	16261241	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.060295;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:15,2:12,2
chr16	16374023	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.040223;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:13,1:13,8
chr16	16412983	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0045524;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:9,5:1,2
chr16	16422341	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.20553;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:11,3:5,1:6,2
chr16	16449463	.	GAGAGAGAGAGACAGAGAC	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.022357;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:14,4:4,4
chr16	16497319	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.054086;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:63,9:39,5:24,4
chr16	16599305	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0083426;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:5,5:4,3
chr16	16605268	.	C	CTTTCT	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.041446;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,10:14,2:22,8
chr16	16657672	.	TTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:1,2:5,2
chr16	16658443	.	C	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.012836;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,12:5,8:2,4
chr16	16779097	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.10294;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:1,1:5,2
chr16	17174040	.	T	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0012459;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:14,5:12,4
chr16	17226704	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0074013;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:15,6:16,4
chr16	17320482	.	C	CT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.002997;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:0,8:0,4:0,4
chr16	17571475	.	C	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0041203;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:11,5:11,3
chr16	17868664	.	A	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.18947;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:5,1:2,1
chr16	18103845	.	C	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.014881;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:9,4:4,1
chr16	18348559	.	A	G	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.036718;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:53,11:23,7:30,4
chr16	18702360	.	GTGGTGGCA	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:2,1:4,3
chr16	20146599	.	C	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.053471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:11,3:6,1
chr16	20541679	.	TTC	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.038747;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,12:8,7:5,5
chr16	21664982	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.16912;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,4:7,2:12,2
chr16	21851256	.	TGGGGA	T	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,4:0,0
chr16	23169118	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.22222;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,2:3,2:0,0
chr16	23867056	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.057743;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:4,1:10,4
chr16	23981588	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10493;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:5,1:15,3
chr16	24265449	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.26001;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:21,2:9,2
chr16	25904143	.	GATGGATGGATGA	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.044124;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:9,5:11,3
chr16	26341276	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.024469;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:14,3:15,4
chr16	26374868	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.040129;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:9,5:11,5
chr16	26766055	.	TA	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.003503;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:10,6:7,4
chr16	26770773	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.021659;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,10:9,7:7,3
chr16	26770775	.	TAAATGATA	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.026993;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,9:8,6:7,3
chr16	27855740	.	AG	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.029563;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,13:4,11:5,2
chr16	28225839	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.011625;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:3,3:1,3
chr16	28579203	.	G	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0088148;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:7,5:11,3
chr16	29343974	.	TTTTTTG	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.097251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,2:8,2
chr16	30219809	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.039921;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:6,2:9,5
chr16	30586575	.	G	GT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:4,3:3,1
chr16	31062783	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:5,1:2,1
chr16	31268395	.	C	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.00035646;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:22,8:8,4
chr16	31716997	.	GT	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.16725;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,4:6,3:4,1
chr16	31962146	.	T	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.026412;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:12,4:15,1
chr16	32069030	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.021726;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,4:7,5
chr16	32192091	.	G	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.01768;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:30,13:10,8:20,5
chr16	32303731	.	G	T	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=0.01064;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:53,17:25,5:28,12
chr16	32327877	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.086635;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:12,4:12,1
chr16	32626055	.	C	CTT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.040221;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:14,4:8,2
chr16	32883828	.	GCCACTGACTCGGGCC	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.031686;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:7,6:11,3
chr16	32925585	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.011252;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:37,10:21,5:16,5
chr16	33017866	.	A	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0089143;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:3,3:17,3
chr16	33018589	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.035086;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:9,2:13,4
chr16	33337144	.	C	T	0	PASS	DP=174;GPV=1;SPV=0.049179;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:87,18:40,10:47,8
chr16	33582391	.	G	GCAA	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.030653;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:42,16:22,9:20,7
chr16	33625825	.	T	C	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.038713;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:20,3:20,7
chr16	33727080	.	CTTT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,8:3,7:4,1
chr16	33733632	.	C	T	0	PASS	DP=294;GPV=1;SPV=0.014655;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:167:135,32:61,14:74,18
chr16	33918582	.	T	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.022734;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:30,13:14,2:16,11
chr16	34014924	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.028638;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,6:2,5:2,1
chr16	34165244	.	G	A	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.012235;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:52,7:32,6:20,1
chr16	34174419	.	C	CA	0	PASS	DP=173;GPV=1;SPV=0.038871;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:77,19:41,12:36,7
chr16	34716233	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.091036;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:19,2:9,2
chr16	35478339	.	C	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.00073344;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:19,4:21,6
chr16	36100822	.	CAT	C	0	PASS	DP=207;GPV=1;SPV=0.040003;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:114:92,22:50,12:42,10
chr16	36111053	.	C	T	0	PASS	DP=146;GPV=1;SPV=0.031943;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:64,13:27,3:37,10
chr16	36120992	.	GA	G	0	PASS	DP=247;GPV=1;SPV=0.0098825;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:139:113,15:41,8:72,7
chr16	37989067	.	G	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.044889;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:20,3:16,8
chr16	38130001	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:0,0:14,4
chr16	38166303	.	T	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
chr16	46743532	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.00034236;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:12,5:13,5
chr16	46780086	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00024776;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:13,6:8,4
chr16	47675519	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.046254;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:9,2:13,4
chr16	48416181	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:4,2:2,1:2,1
chr16	48772945	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
chr16	49099105	.	CAT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.089257;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:12,3:6,2
chr16	49873866	.	CTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.016957;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:2,4:6,2
chr16	51288370	.	AAAAGAAAGAAAG	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0091476;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,7:8,4:7,3
chr16	51644253	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.038709;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:21,4:2,2
chr16	53025955	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:3,3:2,2
chr16	53360790	.	AT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:9,4:1,1
chr16	54074919	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0401;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:10,8:6,3:4,5
chr16	54538394	.	G	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0014418;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:16,5:15,7
chr16	54980414	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.00041135;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:1,7:1,6:0,1
chr16	55027099	.	C	CAA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.014369;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,6:11,4:7,2
chr16	55920846	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0015295;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:13,4:6,8
chr16	56256698	.	C	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.062847;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:11,4:18,2
chr16	56540665	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.042146;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:2,1:8,3
chr16	56620729	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0051075;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:4,2:5,8
chr16	56620736	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.01828;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:4,2:6,6
chr16	56755268	.	G	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00076085;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:12,8:16,2
chr16	57311441	.	G	GGTGTGTGT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.020719;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,6:5,5:3,1
chr16	58171984	.	T	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:4,1:2,2
chr16	58758216	.	TTATATATATA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.016425;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:7,13:5,6:2,7
chr16	58831783	.	CTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTCCT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.2248;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:12,3:5,2:7,1
chr16	60475590	.	TACACAC	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.059571;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:14,6:3,3
chr16	60639011	.	T	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0022162;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:14,6:11,3
chr16	60991226	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0018974;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:7,5:16,4
chr16	61446059	.	A	AATATATATATATATAT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.11076;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,4:8,2:10,2
chr16	61726301	.	A	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0016045;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,12:13,8:16,4
chr16	61960085	.	ATATG	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.16193;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:16,3:9,2:7,1
chr16	62506719	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0012998;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:13,4:9,7
chr16	62890211	.	CT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.010225;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:4,7:9,4
chr16	62913519	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0029833;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:13,7:13,2
chr16	63084059	.	GTGTGTGTGTA	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0038562;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:9,8:6,2
chr16	63658223	.	C	CAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.053755;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,6:4,5:7,1
chr16	64058866	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00035192;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:7,7:16,6
chr16	64535517	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0029614;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,9:4,5:3,4
chr16	64738125	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.15584;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:3,1:4,1
chr16	65060356	.	G	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00042646;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,8:6,4:5,4
chr16	65537057	.	G	GTATA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,5:2,2:0,3
chr16	68456296	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0019324;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:5,5:1,2
chr16	68609146	.	CA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:4,3:3,1
chr16	68743351	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.023079;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,5:3,2:1,3
chr16	68793930	.	CA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0016018;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,11:3,8:3,3
chr16	69732501	.	C	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00040437;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:7,6:13,6
chr16	69738472	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0026128;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:7,6:6,4
chr16	72112803	.	G	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0001497;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:14,6:13,6
chr16	73099710	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.10911;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,10:13,9:6,1
chr16	73753986	.	A	ATGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.032072;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:9,8:7,1
chr16	75259850	.	T	TAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.010718;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,9:3,7:2,2
chr16	75586220	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.042772;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:14,6:8,3:6,3
chr16	76862808	.	T	TAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.033431;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:10,4:5,2
chr16	77311504	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00011008;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:9,6:10,7
chr16	78358866	.	C	CTTTTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.030556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:8,3:2,2
chr16	78481724	.	A	AGTGT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:6,4:2,1
chr16	79091779	.	G	GT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.021739;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:5,5:4,1
chr16	79673815	.	A	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0029415;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:14,6:16,5
chr16	80411036	.	A	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.008813;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:12,4:10,3
chr16	81033591	.	C	CTT	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.02381;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:1,4:0,1:1,3
chr16	81197668	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.027077;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:8,6:2,3
chr16	81304104	.	T	TAAA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.013049;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,11:8,5:7,6
chr16	82298353	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.12934;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:9,2:17,2
chr16	82953245	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0030549;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:20,2:6,9
chr16	83000574	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.021859;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:4,6:4,3
chr16	83286770	.	G	GTA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.037648;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:6,5:3,2
chr16	84050735	.	GC	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.016523;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:38,11:11,7:27,4
chr16	87434994	.	A	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.30769;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,2:4,1:2,1
chr16	88236683	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.04614;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:15,1:5,3
chr16	88558660	.	A	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:2,3:12,2
chr16	89093509	.	T	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00061107;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:16,5:7,5
chr17	425873	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.10277;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:8,4:3,1
chr17	884247	.	T	TA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.044511;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,8:8,6:5,2
chr17	942690	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.10134;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:9,5:7,1
chr17	1062786	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.051054;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:5,3:17,1
chr17	1098075	.	CT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0031524;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:6,7:4,4
chr17	2218028	.	CA	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0047709;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:6,6:11,7
chr17	3699052	.	G	GACACACACACACAC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.035819;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,5:7,2:7,3
chr17	4640699	.	A	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.014135;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:12,5:18,5
chr17	5226508	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.12318;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,4:10,2:5,2
chr17	5749632	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.15275;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:8,3:11,2
chr17	6296216	.	A	ATGTGTG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.026054;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,6:7,5:4,1
chr17	6300670	.	A	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00046907;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:12,5:12,7
chr17	7662623	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.029565;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:8,5:2,2
chr17	7754833	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=9.577e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:31,18:15,7:16,11
chr17	7793522	.	TTC	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.036676;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:5,1:12,3
chr17	7871493	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0035252;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:10,3:11,5
chr17	8087257	.	C	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.056596;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:16,2:12,2
chr17	8339237	.	GTT	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0033069;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,11:11,8:7,3
chr17	8343815	.	AGTGTGT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.043511;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:10,2:8,7
chr17	8363840	.	T	TC	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.22332;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:15,3:7,2:8,1
chr17	10005162	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.29013;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,5:9,3:13,2
chr17	11294120	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0030237;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:12,2:12,5
chr17	11350186	.	T	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.14555;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:12,1:13,3
chr17	11727047	.	CAAA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.10277;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:6,4:5,1
chr17	12197620	.	G	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0020908;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:17,7:14,3
chr17	12396663	.	AGT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,5:6,4:3,1
chr17	12398606	.	A	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=3.7651e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:6,8:14,4
chr17	12558857	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.002331;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:0,7:0,6:0,1
chr17	12989097	.	C	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.091304;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:5,2:6,2
chr17	13328022	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.092532;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:16,4:7,2:9,2
chr17	14544331	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.080042;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:12,2:6,2
chr17	15075577	.	T	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.15679;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,3:13,1
chr17	15543021	.	G	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.016944;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:31,13:14,11:17,2
chr17	15757702	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.26909;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:14,2:17,2
chr17	16476732	.	ATT	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.037112;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:3,5:1,2
chr17	16848058	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0087022;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:6,3:5,2
chr17	17297016	.	T	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.002945;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:15,5:12,4
chr17	17750551	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0014199;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:10,4:16,6
chr17	19820088	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00074174;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:8,5:6,4
chr17	20504029	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0006045;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:12,3:9,6
chr17	21839232	.	GC	G	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.020857;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:47,11:21,6:26,5
chr17	21841577	.	T	G	0	PASS	DP=184;GPV=1;SPV=0.0024614;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:82,14:45,2:37,12
chr17	21987800	.	GTGGAATGGAA	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.049244;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:20,4:12,4
chr17	22352507	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.003548;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:14,7:11,2
chr17	22392478	.	C	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.036308;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:27,7:4,1
chr17	22846601	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.083965;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:3,0:33,4
chr17	22882404	.	G	A	0	PASS	DP=180;GPV=1;SPV=0.004564;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:75,21:36,13:39,8
chr17	22927792	.	A	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.011166;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:6,4:2,5
chr17	22927816	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0055231;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:7,3:2,3
chr17	22963319	.	C	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.031592;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:44,13:17,5:27,8
chr17	23169314	.	T	A	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.0094581;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:46,9:38,6:8,3
chr17	23169339	.	G	C	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.0074015;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:52,10:41,6:11,4
chr17	23189772	.	A	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.02406;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:14,4:16,2
chr17	23209679	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.17496;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:0,0:25,4
chr17	26623519	.	A	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.099968;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:0,1:21,4
chr17	26624350	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.1143;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:12,2:5,2
chr17	26638376	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.10766;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:9,2:10,2
chr17	26771693	.	G	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.037516;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:47,9:19,3:28,6
chr17	27034281	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.010988;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:13,5:13,3
chr17	27981065	.	GGAA	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0972;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:15,3:9,2
chr17	28000235	.	G	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0086388;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:14,3:10,5
chr17	28001490	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0012831;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:9,2:9,6
chr17	28540780	.	A	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.23366;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:9,4:5,1:4,3
chr17	28754286	.	GT	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0033988;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:9,5:0,2
chr17	29072202	.	CTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0071032;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,11:6,7:1,4
chr17	29439864	.	TAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.027772;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:5,13:0,6:5,7
chr17	30221426	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.013095;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:6,2:2,3
chr17	32092192	.	CACAT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,1:6,3
chr17	32977656	.	G	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.016624;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:5,7:0,1
chr17	33657757	.	T	TAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.021615;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,7:8,6:6,1
chr17	34732698	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0017311;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:13,4:9,4
chr17	36462975	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.089257;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:12,4:6,1
chr17	37119589	.	A	AACACAC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.03771;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:6,3:5,2
chr17	37449619	.	ATT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:7,12:1,8:6,4
chr17	37453759	.	AT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.094071;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,5:9,3:3,2
chr17	37812533	.	TTTG	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,4:2,3:7,1
chr17	37840903	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0005812;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,11:11,8:3,3
chr17	37880005	.	T	TA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.03183;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:9,5:3,4
chr17	39314795	.	C	CTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.1671;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:9,4:9,1
chr17	40985156	.	C	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00019486;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:18,8:7,6
chr17	41110058	.	A	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0091119;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:20,6:16,5
chr17	41494407	.	GT	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.046045;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:17,4:20,1
chr17	41844550	.	T	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.3956;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:7,2:4,1:3,1
chr17	42096902	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0021297;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:8,3:5,5
chr17	42668821	.	G	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.12093;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:18,5:9,1:9,4
chr17	42905430	.	AT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.028751;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:10,7:8,4
chr17	42969401	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,9:3,7:2,2
chr17	42990874	.	G	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0024629;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:3,3:10,2
chr17	43657006	.	TTCTTTC	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.22036;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:5,2:23,2
chr17	43719734	.	G	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0063654;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:9,1:15,7
chr17	43835250	.	C	CA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:5,3:2,1
chr17	43931978	.	TTC	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.026941;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:13,1:9,5
chr17	44041277	.	AAAAAAAAAAAC	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.18447;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,4:6,3:3,1
chr17	44141903	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=1.9695e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:32,15:13,11:19,4
chr17	44160573	.	TA	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0010264;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:12,1:11,9
chr17	44312367	.	A	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00053327;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:9,2:8,8
chr17	44414145	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.13408;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:8,1:11,3
chr17	44657378	.	CTTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:5,4:5,1
chr17	44727864	.	AT	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.011706;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:7,3:11,7
chr17	44950763	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.032647;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:4,4:4,6
chr17	45662311	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0001093;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,18:10,12:13,6
chr17	46245030	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.018803;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:4,2:3,2
chr17	46688576	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.00041408;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:3,3:2,5
chr17	47653271	.	A	ATT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.018626;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,7:5,3:4,4
chr17	47794116	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.00066634;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:33,13:10,8:23,5
chr17	48069597	.	C	CA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.042556;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:5,6:7,1
chr17	49071922	.	CT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0076326;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:11,10:2,1
chr17	49268682	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.11923;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:21,2:15,2
chr17	50128482	.	TCA	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0019469;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,10:3,9:9,1
chr17	50530493	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.031065;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:9,3:7,5
chr17	51455573	.	G	GGTGTGT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0018565;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:8,7:9,5
chr17	52285783	.	CAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.019341;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:7,8:4,1
chr17	53560037	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0059126;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:12,5:9,1
chr17	54778400	.	G	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.087068;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:25,3:7,2
chr17	55128925	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:8,4:2,1
chr17	56495338	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.13316;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:11,3:14,1
chr17	56616510	.	A	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0052281;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:8,2:15,4
chr17	56881321	.	GTATATATATTTATATATAATATATGTATATATATATT	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.006865;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:4,3:2,3
chr17	57216321	.	C	CTGTGTG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,8:3,6:6,2
chr17	57632941	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.015393;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:39,7:27,3:12,4
chr17	57896767	.	C	CT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,3:3,1
chr17	58074121	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.20553;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:11,3:9,1:2,2
chr17	58482709	.	C	CAAA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:6,4:0,0
chr17	59015364	.	G	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.014023;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:5,4:10,6
chr17	59209081	.	C	CA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.028708;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,4:4,3:2,1
chr17	60102060	.	GTAAT	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0019854;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:6,6:9,1
chr17	60982795	.	T	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0020871;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:17,3:7,7
chr17	61609694	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.00050078;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,14:2,11:4,3
chr17	61613251	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.10395;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:16,2:17,2
chr17	62122094	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.029588;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:7,8:5,2
chr17	62356003	.	A	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00025079;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:8,6:11,3
chr17	62913422	.	A	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.047988;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:7,4:14,1
chr17	63942258	.	GGTGTGTGTGT	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.015475;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:4,3:7,6
chr17	65093583	.	C	CTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,5:7,4:5,1
chr17	65566160	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0034859;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:36,15:21,8:15,7
chr17	66000371	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00017604;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:11,6:11,9
chr17	66038110	.	A	AAAAAAAAAAAG	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.002331;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:0,6:0,3:0,3
chr17	66169282	.	C	CTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.025287;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:5,3:3,3
chr17	66411242	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.002451;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:1,10:0,6:1,4
chr17	66694480	.	CAAA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.20468;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:10,3:4,1
chr17	66965185	.	CATAT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.029934;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:9,4:9,2
chr17	68575791	.	T	TACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0067873;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,6:3,4:0,2
chr17	68880247	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0041203;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:11,2:11,6
chr17	68880248	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0018932;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:11,2:11,7
chr17	69966706	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.22222;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:3,2:1,1:2,1
chr17	70472124	.	T	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00059303;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:17,4:7,5
chr17	70629593	.	A	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.074772;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:14,3:20,4
chr17	71590803	.	G	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.014152;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:13,5:10,5
chr17	72809202	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.034636;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:7,1:13,4
chr17	73276046	.	AT	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,6:3,1:5,5
chr17	74012978	.	G	GGAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.015103;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,7:6,5:0,2
chr17	75696377	.	C	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.035545;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:6,2:7,6
chr17	75805810	.	A	ATGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.16912;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:6,2:13,2
chr17	76707291	.	CTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,5:3,3:6,2
chr17	77216407	.	T	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.03913;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:4,1:2,4
chr17	77630903	.	C	CTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.026515;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,5:1,4:1,1
chr17	78631456	.	CA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,3:4,2
chr17	79860195	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.043808;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:19,3:16,2
chr17	81426445	.	G	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:14,2:2,2
chr17	81613127	.	T	TAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0011057;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:2,11:2,5:0,6
chr17	81646679	.	C	CAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.016499;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:3,4:3,2
chr17	81950348	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.00089264;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,12:4,4:4,8
chr17	82198650	.	C	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0081305;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:8,3:7,2
chr17	82938894	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066403;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:7,2:4,3
chr18	893183	.	A	AAT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:0,2:0,2:0,0
chr18	897058	.	CTTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0005865;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:11:2,9:2,3:0,6
chr18	1962849	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.2164;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:13,1:6,3
chr18	2689852	.	TAAAA	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.03989;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,6:4,5:0,1
chr18	4034037	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.030075;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:3,2:4,3
chr18	5538995	.	A	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.060606;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:2,3:1,2:1,1
chr18	5779294	.	G	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.10777;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:18,3:10,2:8,1
chr18	6676936	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=2.9309e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,13:3,6:10,7
chr18	7160890	.	C	CA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.047431;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:5,4:0,0
chr18	7410240	.	C	CAA	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,4:0,0
chr18	7968241	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0084281;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:4,3:1,1
chr18	8855725	.	C	CAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0084306;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:7,8:2,1
chr18	10250784	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0046977;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,14:2,10:4,4
chr18	10733448	.	A	ATTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.012217;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:2,7:1,5:1,2
chr18	11849513	.	A	AG	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.17398;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:17,1:17,3
chr18	12285764	.	CTTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.064336;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:12,3:5,4
chr18	12319132	.	TCC	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,4:4,1:8,3
chr18	13743322	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:7,3:10,1
chr18	13880126	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.26692;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,4:9,2:9,2
chr18	14672212	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.22636;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:11,2:11,2
chr18	14689035	.	G	GTAAA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.016865;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:4,5:9,3
chr18	15317868	.	CTAAT	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.025917;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:14,1:10,4
chr18	15393025	.	T	TG	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.034393;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:45,13:20,4:25,9
chr18	15519095	.	A	C	0	PASS	DP=138;GPV=1;SPV=0.026373;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:76,11:15,2:61,9
chr18	15521441	.	A	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.004315;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:9,10:17,3
chr18	15530255	.	A	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:3,3:8,1
chr18	15540190	.	G	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.11076;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:17,4:1,0
chr18	15601295	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0006152;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:9,6:2,3
chr18	15662256	.	A	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.17679;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:15,4:1,0
chr18	15679441	.	T	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.017225;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:1,2:4,2
chr18	15691083	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.043486;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:2,1:18,4
chr18	15709768	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.16867;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:1,0:34,4
chr18	15875759	.	A	C	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=0.025693;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:56,11:22,3:34,8
chr18	17777501	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.24484;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:24,4:2,0
chr18	19275617	.	C	G	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.03903;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:53,11:32,7:21,4
chr18	21434499	.	ATG	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.011679;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:6,3:5,5
chr18	21525014	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.011224;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:7,4:3,4
chr18	21815198	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0089978;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,16:8,11:5,5
chr18	22095497	.	C	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.000471;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:8,6:20,5
chr18	22232784	.	CCATA	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.12627;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,4:18,1:12,3
chr18	22882407	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=2.2133e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,16:11,13:6,3
chr18	23429287	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.012731;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:10,3:15,4
chr18	24460380	.	A	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.015039;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:16,8:9,4:7,4
chr18	24460381	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.044901;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,5:9,4:9,1
chr18	25113764	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.096892;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:13,2:6,2
chr18	25113765	.	C	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1025;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:15,2:6,2
chr18	25806054	.	T	TC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.2201;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,7:8,2:13,5
chr18	25989683	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.07699;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:10,4:5,1
chr18	26027701	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:2,2:7,3
chr18	26208457	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00053327;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:12,6:5,4
chr18	26677728	.	AAAG	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.054106;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,5:6,4:5,1
chr18	29103921	.	T	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.083134;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:17,1:13,3
chr18	29997088	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0060788;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:2,5:13,7
chr18	29997109	.	A	ATGCTGACAGTGATATAAACAATGAAGTCCAGGC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.016716;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:1,4:12,2
chr18	31960484	.	TG	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13025;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:3,3:10,2
chr18	32586426	.	C	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.011884;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:8,3:8,2
chr18	32782481	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,2:0,0:4,2
chr18	32841833	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00085567;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:15,5:7,5
chr18	33193264	.	CAA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.12771;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,4:5,3:3,1
chr18	33379173	.	A	AAT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.051948;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:8,1:6,3
chr18	33403489	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.029259;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,7:13,5:6,2
chr18	34095251	.	A	ATGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.050426;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,5:6,4:7,1
chr18	34839177	.	A	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=2.655e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:8,3:15,10
chr18	35957482	.	G	GAGAGAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.011174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,6:7,4:4,2
chr18	37186564	.	CAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,9:5,7:2,2
chr18	37391026	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00068948;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:12,5:12,8
chr18	38275952	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0062765;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:12,2:13,8
chr18	40365027	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00020252;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:10,5:10,6
chr18	40381060	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0059034;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:12,5:10,2
chr18	40765834	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.023838;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:3,3:7,4
chr18	42154251	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.31818;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:5,2:1,1:4,1
chr18	42357665	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.25826;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,4:4,1:6,3
chr18	43077102	.	CAAA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.040458;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:5,6:5,1
chr18	44744769	.	T	TA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0017575;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,14:6,6:11,8
chr18	45935610	.	G	GC	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.23248;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,4:9,2:9,2
chr18	46112884	.	GTA	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.094721;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:6,1:9,3
chr18	48149805	.	C	CT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:4,10:1,9:3,1
chr18	48318214	.	C	CA	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0002648;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:17,9:8,4
chr18	48514634	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.011726;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:9,3:9,2
chr18	48891502	.	CAATAAAATAAAATAAAATAA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.087179;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,5:5,2:8,3
chr18	49202916	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.038324;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:2,1:9,7
chr18	49945762	.	GA	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.02545;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:7,5:5,2
chr18	50325085	.	TCTCCTTCCTCCTCCTTCCTC	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:1,2:6,6
chr18	50670756	.	C	CA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:5,3:5,1
chr18	50689404	.	TA	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.072018;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:8,2:5,4
chr18	50786538	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.20705;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:10,4:6,1
chr18	50956895	.	G	GA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.035509;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,10:12,9:4,1
chr18	51508914	.	C	CAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.024318;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,8:10,7:1,1
chr18	51614342	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0017532;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:10,3:15,8
chr18	52226373	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.031062;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:5,2:17,3
chr18	53393914	.	C	CCTCTCTCTCTCTCT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0025253;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,10:3,5:5,5
chr18	53546311	.	C	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=1.9941e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:7,5:10,9
chr18	56053026	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.27778;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:3,2:3,1:0,1
chr18	57850556	.	T	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.080441;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:9,3:14,2
chr18	57899019	.	TGA	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.011302;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:7,2:13,7
chr18	58403774	.	G	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=3.1184e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:5,6:11,5
chr18	58629563	.	T	TCACACACACA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.011312;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:4,6:3,3:1,3
chr18	58630618	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0395;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,7:9,1:11,6
chr18	58767872	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:15,4:8,1:7,3
chr18	58936654	.	A	AT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.006961;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:13,6:14,2
chr18	58940923	.	T	TACACAC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.069881;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,8:8,6:3,2
chr18	60393218	.	T	TG	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.020644;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,9:6,5:7,4
chr18	60405026	.	G	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0090805;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:10,3:16,3
chr18	61924367	.	C	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.039556;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:6,2:12,3
chr18	61971234	.	T	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.024751;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:10,3:2,4
chr18	62063292	.	G	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:8,1:9,3
chr18	62502260	.	GA	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:4,4:5,1
chr18	62727227	.	CA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0087495;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:5,6:2,2
chr18	63431086	.	TGC	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.030521;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:15,4:12,2
chr18	63431089	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.044908;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:16,4:16,2
chr18	63431090	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.079987;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:14,4:15,1
chr18	63756804	.	T	TTG	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0040786;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:6,17:4,9:2,8
chr18	66361535	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.11275;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:13,3:6,2
chr18	67081282	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00016784;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:11,5:9,5
chr18	67515903	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.50909;SS=2;SSC=2;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:6,2:2,1:4,1
chr18	68469761	.	G	GGAGAAGAGAAGAGAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.29371;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,4:6,4:0,0
chr18	69335023	.	T	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00099736;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:30,15:14,10:16,5
chr18	70444986	.	GTTTTT	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:7,3:4,1
chr18	71000492	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0048426;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:10,4:11,4
chr18	71399982	.	G	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0011743;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,11:18,8:14,3
chr18	71568486	.	A	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.072331;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,4:19,1:13,3
chr18	72630564	.	C	CAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.090728;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:9,4:12,2
chr18	73093799	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.016081;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:7,2:14,5
chr18	73206219	.	G	GACACAC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,7:4,4:1,3
chr18	73912644	.	A	ATATATATATATATATACACATATG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.15197;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,6:9,2:12,4
chr18	74843635	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0025391;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:12,7:10,4
chr18	76611781	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.15;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:1,2:5,1
chr18	77690391	.	GTCTC	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.098889;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:11,1:21,3
chr18	79016934	.	G	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.096892;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:12,2:7,2
chr18	79356880	.	A	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.016999;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:3,1:4,5
chr18	79610227	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.064666;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:11,3:14,1
chr18	79815441	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,8:4,7:3,1
chr19	304172	.	A	ACAC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.07564;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,3:5,1
chr19	395904	.	C	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,1:0,1
chr19	411240	.	C	A	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.031091;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:43,10:18,4:25,6
chr19	650009	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.21475;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:7,3:14,1
chr19	744061	.	G	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00010641;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:10,5:9,9
chr19	1194866	.	CTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:3,3:6,1
chr19	1339033	.	C	CA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.021468;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:18,9:2,1
chr19	1727735	.	T	TAAAAAAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.025265;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,9:6,6:7,3
chr19	1832914	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.082251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:9,3:7,1
chr19	2817957	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.13077;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:8,2:9,3
chr19	2928844	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:6,3:4,1
chr19	3595078	.	T	TA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.032243;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,10:10,8:12,2
chr19	3648530	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.13255;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,4:18,1:13,3
chr19	3885109	.	T	TAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.1088;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:9,4:6,1
chr19	4104265	.	T	TA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.013127;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,7:5,6:3,1
chr19	4899765	.	A	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,4:3,3:6,1
chr19	5518924	.	A	AG	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.048122;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:1,6:6,2
chr19	6082293	.	CA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.01497;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:5,8:5,1
chr19	7231304	.	T	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.034112;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:15,2:12,4
chr19	7772054	.	C	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.15773;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,4:9,2:9,2
chr19	7925704	.	C	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=5.5134e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:35,17:10,5:25,12
chr19	8781507	.	G	A	0	PASS	DP=259;GPV=1;SPV=0.01982;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:150:127,23:36,8:91,15
chr19	8901307	.	TAATAAAATAAAATAAAATAA	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.020884;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:9,5:7,4
chr19	9058423	.	C	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=6.6761e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:13,6:15,7
chr19	9169265	.	T	TATATATATATA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.2066;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:9,1:1,3
chr19	10301479	.	G	GTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.018648;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,7:1,5:2,2
chr19	10319259	.	A	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=6.2544e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:12,9:12,5
chr19	10676260	.	GTTTGTTTTTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.037648;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:4,3:5,4
chr19	11293076	.	AT	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.002331;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:1,7:1,4:0,3
chr19	11414323	.	TCATA	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,4:6,1:3,3
chr19	13340426	.	T	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0625;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:4,3:3,2:1,1
chr19	13486366	.	G	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.069922;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:15,3:9,1
chr19	14080097	.	T	TATAATAATA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.081016;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,7:11,2:6,5
chr19	14551950	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.29371;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,4:0,2:6,2
chr19	14611371	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.014757;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:3,3:3,4
chr19	15228503	.	ATTTTT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:10,3:4,2
chr19	15650835	.	T	TC	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.2164;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:9,1:10,3
chr19	15812665	.	CAGGA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:10,4:1,0
chr19	16063886	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0030216;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:7,2:14,6
chr19	17147672	.	AT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.016499;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:1,3:5,3
chr19	17896824	.	A	ATT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.01246;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,7:4,4:6,3
chr19	17967502	.	C	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.081098;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:22,3:11,1
chr19	18111530	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.017609;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:7,8:4,2
chr19	20397289	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.047956;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:9,2:4,3
chr19	20528117	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0004496;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:9,8:11,3
chr19	21051790	.	A	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00057029;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:11,3:17,7
chr19	23184370	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00089447;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:13,5:11,7
chr19	23753601	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.011254;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:16,2:9,7
chr19	24369075	.	AAC	A	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.012591;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:45,15:24,8:21,7
chr19	24386451	.	G	T	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.024137;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:57,7:33,5:24,2
chr19	24441846	.	C	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.081913;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:13,3:21,2
chr19	25010777	.	A	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:6,3:0,0
chr19	26422867	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.081081;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:17,4:0,0
chr19	26813246	.	G	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
chr19	27127720	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.097906;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:26,4:2,0
chr19	27374600	.	T	A	0	PASS	DP=186;GPV=1;SPV=0.043887;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:85,19:46,10:39,9
chr19	28625367	.	C	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00078261;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:9,4:15,5
chr19	29434503	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0014364;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:9,5:16,5
chr19	33095770	.	GTCAAA	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0084701;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:7,3:11,3
chr19	33131273	.	G	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.019439;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:9,4:7,2
chr19	33133196	.	T	TAGAG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.023235;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,8:9,6:10,2
chr19	33146482	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.021073;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,5:2,4:8,1
chr19	33887997	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.087004;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:19,1:13,3
chr19	34314746	.	G	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0046499;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:38,9:13,6:25,3
chr19	35226147	.	TC	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.006186;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:15,5:12,2
chr19	35359770	.	T	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.044605;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:41,14:14,3:27,11
chr19	35444428	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.03285;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:8,4:3,2
chr19	35983551	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=8.4921e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,15:7,8:11,7
chr19	36316392	.	A	AG	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.041513;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:9,4:8,3
chr19	36365959	.	C	CAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.036129;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:10,3:4,6
chr19	37035408	.	A	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.075302;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:20,2:11,3
chr19	37214962	.	T	TA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.008837;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:8,5:2,1
chr19	37268475	.	C	CT	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.02165;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:11,4:18,2
chr19	38116538	.	A	AAAAAG	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0031609;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,7:4,3:4,4
chr19	38317561	.	G	GT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0035224;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:8,5:9,9
chr19	38351607	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0051998;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,15:2,8:8,7
chr19	38736467	.	TTTGACCAAGCCCCAGGGCAGG	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.058442;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:1,1:13,3
chr19	39893575	.	G	C	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.00090425;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:45,13:22,4:23,9
chr19	41365708	.	T	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,3:5,2:1,1
chr19	42309064	.	C	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00030325;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:15,8:13,5
chr19	42326740	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:4,2:4,1:0,1
chr19	42826320	.	A	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00068948;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:10,4:14,9
chr19	43057377	.	G	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00015269;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:27,17:7,10:20,7
chr19	43516623	.	C	CTT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0048821;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,7:1,6:1,1
chr19	46060873	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00011238;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,13:11,5:11,8
chr19	46846442	.	T	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,2:6,1:1,1
chr19	47816529	.	A	AT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.097916;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:8,4:6,1
chr19	47884804	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.091659;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:7,5:6,1
chr19	47921144	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.037062;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:14,2:14,4
chr19	47924231	.	G	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.031623;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:0,1:7,5
chr19	48101126	.	A	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.092308;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,6:3,3:2,3
chr19	49025212	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.037233;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:18,3:13,5
chr19	49318868	.	A	ATTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.041789;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:9,3:5,2
chr19	49758152	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0089139;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:14,8:13,4
chr19	50136384	.	G	T	0	PASS	DP=377;GPV=1;SPV=0.049534;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:211:186,24:99,15:87,9
chr19	50170961	.	CA	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.016084;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:19,9:6,2
chr19	50623613	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.013985;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,10:7,8:2,2
chr19	50993513	.	CAAA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.023045;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:4,7:3,2
chr19	51090116	.	C	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0002546;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,12:13,5:15,7
chr19	51120845	.	C	CT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.04669;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:15,6:3,1
chr19	53060604	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=9.3193e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:14,5:11,8
chr19	53914273	.	C	CAAAAAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.056718;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,5:16,4:3,1
chr19	54914841	.	G	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0005758;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:13,7:7,3
chr19	55082948	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.011603;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:15,4:7,2
chr19	57179200	.	TTC	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.039973;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:10,5:11,3
chr19	58171286	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.027191;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,6:7,1:2,5
chr19	58349648	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0077494;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:5,6:3,2
chr19	58405212	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.042236;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:3,1:6,7
chr19	58427348	.	TC	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.070707;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,4:0,2:3,2
chr2	686134	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=4.6765e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:8,6:8,7
chr2	823560	.	T	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00011829;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:4,5:13,7
chr2	868396	.	C	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:1,2:8,3
chr2	2773501	.	A	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00024707;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:11,7:9,4
chr2	3510143	.	CA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.040398;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:8,9:4,1
chr2	3530344	.	T	TGG	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.030303;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,4:0,2:2,2
chr2	3892603	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00082439;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:12,7:14,5
chr2	3923534	.	T	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00053926;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:10,5:3,3
chr2	4622211	.	G	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00044128;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:14,5:15,5
chr2	4871563	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0002055;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:9,5:13,7
chr2	5573348	.	AAAT	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.040398;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:6,4:6,6
chr2	6016362	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.094071;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,5:9,2:3,3
chr2	6217503	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0029154;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:15,3:15,7
chr2	6504952	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,2:4,1:1,1
chr2	7085270	.	C	CTTTTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.046146;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:4,3:5,3
chr2	7315365	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.095104;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:13,2:17,2
chr2	9079486	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00083483;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:11,5:12,6
chr2	9514674	.	C	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:9,6:2,3
chr2	9721949	.	T	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.002188;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:11,3:9,5
chr2	10007354	.	T	TTACTATTATTATTACTACTAC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.018762;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,8:6,4:8,4
chr2	10206245	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.01286;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:8,9:7,1
chr2	10942692	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00012491;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:9,6:15,8
chr2	11419508	.	A	AAAAC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0044617;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,14:6,9:4,5
chr2	12123234	.	TC	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.057784;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:16,3:20,1
chr2	12369609	.	C	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00068121;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:8,6:12,7
chr2	14716789	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0048249;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:12,3:19,6
chr2	15723517	.	T	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.12206;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:11,3:14,1
chr2	16279194	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.10105;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:16,5:5,1:11,4
chr2	17353616	.	C	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=6.5042e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,18:12,9:11,9
chr2	17839195	.	TA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.03908;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:9,5:3,1
chr2	19144887	.	CA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0062663;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,14:9,10:7,4
chr2	22050337	.	A	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.012493;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:4,4:30,3
chr2	22659875	.	GCT	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.020734;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:3,14:1,7:2,7
chr2	23120687	.	GCGCA	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0047709;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,13:11,9:6,4
chr2	23714239	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.03274;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:3,7:11,3
chr2	23899918	.	CTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.028261;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,6:4,3:5,3
chr2	23942967	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.030629;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:5,4:5,4
chr2	24912585	.	GCA	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.065801;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,4:8,1:7,3
chr2	25224723	.	TTATTA	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0052174;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:6,13:1,8:5,5
chr2	25625551	.	ATT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.29515;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,6:8,3:2,3
chr2	25728041	.	A	ATG	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.025825;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,9:10,6:6,3
chr2	26995780	.	G	GGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.041917;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,9:9,5:3,4
chr2	27691592	.	C	CTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0069071;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:4,7:6,3
chr2	28461572	.	C	CAAAATAAAATAAATAAAAT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.01217;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,14:5,3:7,11
chr2	29717171	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,4:4,3:5,1
chr2	30681899	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.17647;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,7:5,6:2,1
chr2	32001032	.	A	AT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.091143;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:9,5:8,1
chr2	32930451	.	A	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.031062;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:22,5:14,2:8,3
chr2	33476728	.	C	CCT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.020047;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,9:4,7:6,2
chr2	35007269	.	CA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.028792;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:4,3:9,3
chr2	36506181	.	TCACA	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.12093;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,5:9,2:9,3
chr2	37968438	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,6:4,5:2,1
chr2	38164595	.	C	CACATATATATATATAT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.060124;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:9,2:4,3
chr2	38253252	.	G	GT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0025391;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:12,4:10,7
chr2	38392479	.	C	CCAG	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.011868;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,10:4,9:0,1
chr2	39010899	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.021442;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:11,3:9,3
chr2	39045273	.	A	AGTGTGT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.18447;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,4:8,3:1,1
chr2	39648042	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,8:9,7:2,1
chr2	42018932	.	AAAAAGAAAAG	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.024318;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,8:2,4:9,4
chr2	42060586	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.030521;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:10,2:17,4
chr2	42060587	.	T	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.092279;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:10,1:10,4
chr2	42409722	.	AAAAAAAAT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.043423;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,2:5,3
chr2	43046823	.	ATCTCTCTCTC	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.23663;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:5,3:11,1
chr2	43297376	.	T	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.042986;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:3,4:0,1
chr2	43455520	.	A	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.031253;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,7:13,4:5,3
chr2	44457350	.	A	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00026731;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:28,15:15,10:13,5
chr2	45611225	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=4.6208e-08;SS=2;SSC=73;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:18,19:12,13:6,6
chr2	46855243	.	TCACACACACACA	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0098833;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,7:2,1:1,6
chr2	48834300	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.047515;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:11,5:9,5
chr2	49257453	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.085739;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,5:10,2:6,3
chr2	50352778	.	T	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.073359;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:6,3:10,1
chr2	51504651	.	TGC	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,4:2,3:4,1
chr2	51778275	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.00095347;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,7:3,6:1,1
chr2	51983544	.	C	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.011603;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:8,4:14,2
chr2	52334968	.	A	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00031271;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:14,3:9,9
chr2	52449055	.	G	GTAGTAATAATAATAATAATAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.046146;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:2,1:7,5
chr2	52852312	.	T	TG	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0035088;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,11:8,9:5,2
chr2	54237533	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00069999;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:14,4:8,4
chr2	54513707	.	T	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00086088;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:14,5:9,5
chr2	55728945	.	C	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=2.728e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:11,6:6,9
chr2	56430889	.	T	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00020585;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:24,15:14,6:10,9
chr2	56450099	.	G	GTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.12913;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:8,3:1,2
chr2	57116261	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0045171;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:14,7:14,2
chr2	57569891	.	C	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.001022;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:15,5:16,5
chr2	59467199	.	GTTCATGGCATC	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00092621;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:10,6:8,5
chr2	59755611	.	C	CT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.001853;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:8,7:2,4
chr2	59892090	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00046907;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:10,8:14,4
chr2	60901148	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,2:4,3
chr2	60901151	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10294;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,3:6,1:0,2
chr2	61572716	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:5,4:0,2
chr2	62357869	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.085739;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,5:9,2:7,3
chr2	65218878	.	CA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.017225;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:5,4:0,0
chr2	66341454	.	T	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.093185;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:7,3:14,1
chr2	66794702	.	T	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.20468;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,4:8,3:6,1
chr2	68170747	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.062714;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,6:10,5:2,1
chr2	68760882	.	T	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.26383;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:20,5:9,3:11,2
chr2	69027621	.	A	AGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.034996;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,6:9,1:5,5
chr2	69639050	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0036826;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:11,6:13,4
chr2	70293546	.	C	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=6.2443e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:13,6:11,5
chr2	70637928	.	A	AAAAATAAAAT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.030455;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,7:4,4:7,3
chr2	71097711	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.18447;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,6:6,5:3,1
chr2	71521673	.	T	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=7.7661e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:13,8:13,6
chr2	71618566	.	GTT	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.16209;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:22,3:15,1:7,2
chr2	72144081	.	C	G	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.0019761;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:48,11:24,5:24,6
chr2	74135948	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0058007;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:3,9:2,8:1,1
chr2	75813568	.	C	CT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.088868;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:14,1:16,3
chr2	76443314	.	C	CTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,10:1,6:5,4
chr2	77648462	.	T	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0094953;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,13:3,8:4,5
chr2	78093492	.	A	AT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0082887;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:9,7:15,3
chr2	78710692	.	A	AAAGGAAGG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.13055;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,5:4,4:11,1
chr2	79056095	.	CA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.021576;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,3:7,6
chr2	79521107	.	GATATATATATATATATATATATATATATATAT	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,4:4,1:3,3
chr2	82053878	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0040548;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:3,8:12,5
chr2	82182734	.	TC	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.042901;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:5,3:6,2
chr2	82182736	.	C	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.03771;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:4,3:7,2
chr2	82182739	.	ACTCTC	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.045519;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:5,3:7,2
chr2	82441284	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0037091;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:7,4:11,2
chr2	82784939	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.033516;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:10,2:13,7
chr2	85328781	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:36:1,4:0,1:1,3
chr2	86303212	.	GT	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.030556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,5:5,4:5,1
chr2	86905522	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.038493;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:15,11:11,2
chr2	87018492	.	C	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:3,1:4,1
chr2	87214518	.	G	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.0037978;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:32,16:13,9:19,7
chr2	87222922	.	GGT	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.048406;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:14,2:6,6
chr2	87236895	.	CA	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.059574;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:12,3:8,1
chr2	87429621	.	C	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.064666;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:12,1:13,3
chr2	87429622	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.059209;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:14,2:12,3
chr2	87430689	.	AAGCC	A	0	PASS	DP=161;GPV=1;SPV=0.02276;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:68,15:34,5:34,10
chr2	88983107	.	A	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.018478;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:22,3:19,3
chr2	89592132	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00069917;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:1,3:10,7
chr2	89617384	.	AAT	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.029803;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:11,7:18,4
chr2	89836731	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0094399;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:21,3:11,4
chr2	89909729	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:8,8:0,1
chr2	89919282	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.20218;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:13,1:11,3
chr2	90294162	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.043004;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:18,5:16,2
chr2	90312003	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.002038;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:7,4:16,7
chr2	90321917	.	T	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.046456;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:19,1:16,6
chr2	90332248	.	TTA	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.057842;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:12,4:0,0
chr2	90356850	.	A	ATT	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=0.045905;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:56,11:28,6:28,5
chr2	90382966	.	A	G	0	PASS	DP=217;GPV=1;SPV=0.040517;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:119:102,17:11,2:91,15
chr2	90401914	.	T	A	0	PASS	DP=267;GPV=1;SPV=0.028609;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:142,17:61,10:81,7
chr2	91426791	.	A	G	0	PASS	DP=417;GPV=1;SPV=0.027406;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:227:196,31:125,20:71,11
chr2	91442435	.	C	A	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.024717;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:48,15:21,5:27,10
chr2	91458943	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0053553;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,11:23,9:9,2
chr2	91496251	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.038126;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:51,8:28,7:23,1
chr2	91516287	.	C	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.074336;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:13,4:9,1
chr2	91519296	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.13473;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,1:7,3
chr2	91542845	.	C	CGT	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.032792;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,12:16,7:12,5
chr2	91545052	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0050385;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:6,8:6,2
chr2	91551347	.	A	C	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=0.0093814;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:70,8:32,4:38,4
chr2	91675456	.	A	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.032567;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:8,5:17,6
chr2	92132618	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.14256;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:19,1:12,3
chr2	92249636	.	A	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.10559;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:6,3:26,1
chr2	92254569	.	G	C	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.011495;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:57,10:28,5:29,5
chr2	92261556	.	T	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:1,1:6,3
chr2	92276085	.	T	G	0	PASS	DP=209;GPV=1;SPV=0.027257;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:94,17:33,8:61,9
chr2	92309923	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.17143;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
chr2	92309928	.	T	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.15584;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
chr2	92383293	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.019781;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:22,8:3,3
chr2	92499753	.	T	G	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.027282;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:74,10:54,7:20,3
chr2	92533519	.	G	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.11998;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:21,3:8,1
chr2	92556579	.	A	T	0	PASS	DP=268;GPV=1;SPV=0.0026044;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:158:133,25:101,20:32,5
chr2	92728437	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.20161;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:2,0:26,4
chr2	92759321	.	C	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.17984;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:11,3:5,1:6,2
chr2	92774895	.	C	A	0	PASS	DP=129;GPV=1;SPV=0.035957;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:59,7:8,2:51,5
chr2	92839048	.	T	A	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.032518;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:77,13:38,2:39,11
chr2	92839081	.	G	A	0	PASS	DP=182;GPV=1;SPV=0.041615;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:78,19:24,6:54,13
chr2	92889972	.	CAT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.097251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:0,0:14,4
chr2	93001964	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.025228;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:18,6:11,1
chr2	93009752	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.074238;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:50,6:41,5:9,1
chr2	93039692	.	T	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.094934;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:18,4:2,0
chr2	93040550	.	C	G	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.029623;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:45,5:20,1:25,4
chr2	93042746	.	G	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.13043;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
chr2	93087515	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.11326;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:16,4:25,1
chr2	93096128	.	T	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1025;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:21,4:0,0
chr2	93097106	.	C	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
chr2	93100515	.	T	G	0	PASS	DP=158;GPV=1;SPV=0.035602;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:75,12:51,7:24,5
chr2	93151427	.	T	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.13971;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:1,0:17,4
chr2	93255109	.	G	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.17679;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:0,0:16,4
chr2	93265760	.	A	C	0	PASS	DP=182;GPV=1;SPV=0.020561;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:99:88,11:82,9:6,2
chr2	93316463	.	G	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.17028;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:8,3:8,3:0,0
chr2	93332537	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.077778;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:6,1:5,3
chr2	93473588	.	C	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.086656;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:22,1:4,3
chr2	93628626	.	A	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.07564;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:4,1:9,3
chr2	93641763	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.045792;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:3,2:9,5
chr2	93694069	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.073684;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:6,3:0,0
chr2	93821099	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.027524;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:13,7:2,1
chr2	93961018	.	T	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.044901;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:4,1:14,4
chr2	93972780	.	T	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.048464;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:11,2:21,2
chr2	94084851	.	A	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.12491;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:7,3:14,1
chr2	94087228	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0071633;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:20,3:11,3
chr2	94156216	.	A	AG	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.068436;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,5:8,1:6,4
chr2	94156217	.	A	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.025213;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:7,1:5,5
chr2	94156218	.	A	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,1:5,3
chr2	94995255	.	G	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.19632;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,3:17,1:6,2
chr2	94995261	.	GC	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.096964;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,5:18,2:11,3
chr2	94995266	.	G	GC	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.06862;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,7:15,3:9,4
chr2	95543732	.	T	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.010404;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:21,5:11,3
chr2	96060658	.	T	C	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.016173;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:52,19:24,15:28,4
chr2	96805418	.	G	GT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.028886;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:9,7:0,2
chr2	97012153	.	A	AAAATAAAT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.031844;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:10,8:10,1
chr2	97588780	.	A	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:2,1:4,5
chr2	97665723	.	CTCTCTCTCTCTCTCTATA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.17028;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:8,8:2,4:6,4
chr2	97979503	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.015826;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:12,5:10,5
chr2	101712903	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.019985;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:4,8:5,2
chr2	106289319	.	G	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.06044;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:20,1:9,3
chr2	107433356	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.083772;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:15,8:9,4:6,4
chr2	108098643	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.026352;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:9,3:11,7
chr2	108360003	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0094843;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:1,4:8,7
chr2	108452847	.	C	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.074614;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:17,2:9,2
chr2	108500159	.	T	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:30:0,2:0,2:0,0
chr2	109185314	.	T	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0030216;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:12,2:9,6
chr2	111351928	.	A	AT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.036735;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,9:11,5:10,4
chr2	111639504	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.075514;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:12,2:22,3
chr2	112167884	.	TG	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,2:3,2
chr2	112388323	.	A	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.10585;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:8,4:12,1
chr2	113520484	.	A	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.075302;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:18,1:13,4
chr2	113562784	.	T	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.017729;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:36,8:22,2:14,6
chr2	113587861	.	TCTGCCCTCACTGTGCAATTCCAGGAGTGTTTTTCCTTC	T	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.042403;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:59,12:37,3:22,9
chr2	113597419	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.054436;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:35,6:23,4:12,2
chr2	113693857	.	CTTT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0083313;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,9:7,7:4,2
chr2	116864344	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.01315;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:9,3:7,4
chr2	116873420	.	CTGT	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0027601;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,14:7,7:7,7
chr2	117652617	.	T	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.013487;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:8,2:2,4
chr2	117652670	.	A	AAG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:14,3:2,1
chr2	118620788	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.01064;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:8,3:10,2
chr2	119360512	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:3,4:8,4
chr2	120680498	.	C	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.30769;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:2,1:4,1
chr2	121799626	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.019794;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:14,4:14,2
chr2	122793789	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.1439;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:15,1:13,3
chr2	123567325	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1184;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,3:7,1
chr2	124296151	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00047821;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:16,7:4,3
chr2	124317198	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0047364;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:9,3:14,8
chr2	125499797	.	CT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0060611;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,11:5,8:6,3
chr2	125798730	.	A	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0024512;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:32,14:24,9:8,5
chr2	125854365	.	G	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.001166;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:30,13:12,4:18,9
chr2	125891353	.	GTA	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.037926;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,4:3,4:0,0
chr2	125988641	.	A	AT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0035375;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:12,1:7,5
chr2	127221243	.	ATTTTT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.010374;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,9:4,4:5,5
chr2	127711424	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,3:6,1
chr2	128079612	.	T	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.25455;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,3:4,1:1,2
chr2	128677264	.	C	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.022564;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,11:8,9:19,2
chr2	128677265	.	A	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.010895;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,11:8,9:19,2
chr2	129973563	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.009946;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:10,4:14,3
chr2	130110807	.	A	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.021839;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:9,6:3,4
chr2	130124424	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.026369;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:7,5:11,3
chr2	130197270	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.037457;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:11,1:6,8
chr2	130607976	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.030075;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:0,1:7,4
chr2	130622941	.	T	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.011854;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:8,5:13,2
chr2	130623738	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.084757;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:10,2:18,2
chr2	130648059	.	A	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.010368;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:45,9:27,4:18,5
chr2	130781815	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.039244;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:9,3:3,1
chr2	130926008	.	T	TTTTCTTTC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,4:4,1:10,3
chr2	131040025	.	A	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.042386;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:19,4:20,1
chr2	131264373	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.010286;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:5,2:15,7
chr2	131602701	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.20119;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:42,5:21,1:21,4
chr2	132591278	.	C	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.067079;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,7:1,1:8,6
chr2	132886169	.	TA	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00055994;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:16,22:9,14:7,8
chr2	133444399	.	G	GAT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.030805;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,7:3,4:9,3
chr2	133839416	.	T	TA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0044;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,10:5,7:12,3
chr2	136566790	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=3.8037e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:11,5:10,9
chr2	136709397	.	C	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.088906;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:15,1:9,3
chr2	137404476	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,2:3,1:2,1
chr2	137729042	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.033228;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:16,1:12,5
chr2	138089369	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00040347;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:8,9:17,5
chr2	140112660	.	G	GAGAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.015385;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,10:11,6:2,4
chr2	140696743	.	C	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=8.9862e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:33,15:18,4:15,11
chr2	142086635	.	AC	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.051948;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:10,3:4,1
chr2	142797765	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.024846;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,7:8,6:3,1
chr2	145635002	.	C	CTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.20979;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,4:4,3:2,1
chr2	145687047	.	A	AT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0016822;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:11,5:15,6
chr2	146937086	.	AATGGATGGATGG	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:6,8:5,1
chr2	147673537	.	C	CT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.032095;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,6:13,5:3,1
chr2	148176304	.	GT	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.11076;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,4:14,3:4,1
chr2	148270393	.	A	ATT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.022676;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:14,8:7,5
chr2	149156621	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.001804;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,15:9,9:5,6
chr2	149674983	.	CTA	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.055991;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:15,4:14,2
chr2	149675019	.	CTA	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0083039;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:13,6:5,4
chr2	149705978	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.17217;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,5:4,2:5,3
chr2	150658979	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.031121;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,9:3,6:5,3
chr2	153246512	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0022088;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:10,6:16,3
chr2	153719837	.	G	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=1.6328e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:32,17:20,12:12,5
chr2	154620975	.	TCCTTTCTC	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.10935;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:3,2:21,3
chr2	155334085	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.042555;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:11,5:3,3
chr2	155334086	.	AG	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.016761;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,6:9,3:3,3
chr2	155671369	.	GA	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:9,4:1,0
chr2	158216386	.	CTTTTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:3,4:6,1
chr2	158750164	.	AGT	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0079095;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:5,11:4,7:1,4
chr2	159874069	.	TAA	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.1174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:13,1:17,3
chr2	159874084	.	G	GTA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.023496;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:8,5:14,5
chr2	160191662	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.030011;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:17,5:16,2
chr2	160681459	.	C	CTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,4:2,1:4,3
chr2	161109807	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.029557;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:20,5:19,3
chr2	162820033	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:8,3:6,1
chr2	163102493	.	CA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.011899;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:8,8:4,6:4,2
chr2	163758054	.	C	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=3.7651e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:8,8:12,4
chr2	165147294	.	GGT	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.021659;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:10,9:6,1
chr2	166154444	.	G	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.031046;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:11,3:10,2
chr2	168752279	.	A	ATGTGTGTG	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,4:3,2:2,2
chr2	169656413	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.16794;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:13,1:13,3
chr2	169838387	.	TTG	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.011312;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:4,6:2,4:2,2
chr2	170160245	.	C	CTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.045738;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,6:6,4:8,2
chr2	170866189	.	A	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0040937;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:19,2:9,6
chr2	170921192	.	GTT	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.016957;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,6:4,4:4,2
chr2	171272618	.	AT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.049667;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,7:6,4:7,3
chr2	172709045	.	TC	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.042184;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:16,3:15,2
chr2	172911758	.	CTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.040458;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,7:7,5:3,2
chr2	173939765	.	A	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,2:4,1:3,1
chr2	174347609	.	CTT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.21107;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:14,3:5,2
chr2	174409249	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.058443;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:8,3:10,2
chr2	175000137	.	AT	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0055138;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:8,6:8,4
chr2	175777946	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00025893;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:9,4:17,9
chr2	177044292	.	GACACAC	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0086042;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,13:13,7:5,6
chr2	177414897	.	C	CGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.047817;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:9,6:7,2
chr2	177453190	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=9.674e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:14,17:8,8:6,9
chr2	178016408	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.046186;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:12,3:18,2
chr2	179332330	.	AAAAAGG	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.060034;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:8,1:16,3
chr2	179395127	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.035714;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:12,3:12,4
chr2	179427024	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=4.5381e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:11,5:10,8
chr2	181301902	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.10745;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:11,1:16,3
chr2	181301903	.	G	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.11998;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:11,1:18,3
chr2	182169922	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0066141;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:3,6:2,4:1,2
chr2	182437546	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0057252;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,9:14,5:16,4
chr2	183278919	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00031881;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:6,4:13,6
chr2	184271914	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=1.7586e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:28,17:17,8:11,9
chr2	185865597	.	A	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.033768;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,12:21,2:8,10
chr2	185933382	.	CAATA	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.041061;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:10,7:9,3
chr2	186007102	.	T	TTCTCTCTC	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.044583;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,7:12,4:2,3
chr2	186213505	.	TACAC	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.020174;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:10,2:3,4
chr2	186961457	.	CTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,8:3,5:2,3
chr2	187944437	.	CTTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0089783;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:3,11:1,7:2,4
chr2	188424486	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0031368;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:10,7:15,1
chr2	188466445	.	T	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.46154;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:7,2:5,1:2,1
chr2	188773787	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.072845;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:16,3:13,2
chr2	189019131	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00021002;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:11,8:12,6
chr2	190373244	.	T	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.020223;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:6,4:10,7
chr2	190953950	.	A	ATGTG	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.23366;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:4,2:5,2
chr2	191723162	.	G	GGTGTGT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.065471;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,7:9,6:4,1
chr2	191743433	.	AAC	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.12934;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:14,3:12,1
chr2	192037614	.	GAAAGAGAGAGAGGAGAGAAAGAGAGAGAA	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.043842;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:6,4:6,2
chr2	192532343	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0057103;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:10,2:11,9
chr2	193202938	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00014249;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:9,5:7,8
chr2	195195545	.	C	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0015408;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:5,4:15,6
chr2	195567625	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.17137;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:2,0:19,4
chr2	196051520	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.01728;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:14,3:19,4
chr2	196248599	.	C	CACAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.070228;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:13,1:10,3
chr2	196362318	.	TACACAC	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:9,5:0,3
chr2	198043881	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.15909;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,3:1,1:3,2
chr2	198114672	.	T	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0035421;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:7,1:15,7
chr2	198668815	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00034628;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:12,18:8,12:4,6
chr2	199256010	.	T	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=1.5662e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:14,7:6,8
chr2	199409072	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0013049;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:34,11:17,4:17,7
chr2	200027694	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.038324;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:8,7:3,1
chr2	200657167	.	T	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:3,3:2,2
chr2	201247190	.	CAA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.028846;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,7:1,6:3,1
chr2	202029033	.	CAA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.033431;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,6:8,5:7,1
chr2	202767157	.	CTT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.14804;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:18,4:7,1
chr2	205920262	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.048094;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:20,4:7,1
chr2	208834439	.	T	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.06057;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:13,2:8,3
chr2	210361142	.	G	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=3.8667e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:14,9:9,8
chr2	210388024	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0039305;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:11,4:8,2
chr2	213994049	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0068919;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:4,6:16,2
chr2	215538054	.	TC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.14395;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,4:10,1:10,3
chr2	215538058	.	T	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.12491;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:11,1:10,3
chr2	217528407	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,4:4,1:4,3
chr2	217566745	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0032397;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:16,7:11,3
chr2	217980506	.	C	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.050612;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,4:6,2:6,2
chr2	218561652	.	GA	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.021449;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:5,3:2,4
chr2	222407553	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.19804;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:13,4:5,1
chr2	223266827	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.16375;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:13,2:16,2
chr2	224535001	.	AAAATAAATAAATAAATAAATAAAT	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.13236;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,7:5,2:18,5
chr2	225878815	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,5:1,2:4,3
chr2	226242491	.	G	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00085757;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:17,8:8,4
chr2	226706767	.	C	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:12,5:6,2:6,3
chr2	226981435	.	C	CA	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0035718;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:12,5:12,3
chr2	227569414	.	CAT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.03733;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,6:3,3:2,3
chr2	227660450	.	T	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.46154;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:7,2:3,1:4,1
chr2	228203825	.	T	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00051786;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:7,4:17,5
chr2	229308673	.	CA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:5,5:1,1
chr2	230645163	.	G	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0016474;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:14,5:18,7
chr2	230834879	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0066905;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,13:8,9:5,4
chr2	231017939	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.065325;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,5:6,1:9,4
chr2	231628970	.	GA	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.020229;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:3,6:3,1
chr2	231837173	.	C	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.17925;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:20,3:13,2:7,1
chr2	232180329	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.13093;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:12,3:7,2
chr2	232673907	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.010538;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,10:4,9:3,1
chr2	233494920	.	A	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.00024999;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:3,10:3,6:0,4
chr2	233567321	.	T	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.089909;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:13,2:16,2
chr2	233852579	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.023915;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:10,3:8,6
chr2	234170428	.	T	TTTTTTTTG	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0091533;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,6:0,3:6,3
chr2	235090896	.	CTTCT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.082337;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,6:5,1:11,5
chr2	236160238	.	AGTGT	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0055603;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:15,15:3,3:12,12
chr2	236358897	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00054254;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:11,6:13,7
chr2	236736477	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0032397;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:10,5:17,5
chr2	236893471	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:7,2:6,1:1,1
chr2	238780120	.	C	CTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.020642;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,10:8,7:10,3
chr2	238783555	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.059999;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:9,5:16,1
chr2	240479065	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0012641;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:11,5:16,4
chr2	240516151	.	T	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.091036;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:12,2:16,2
chr2	240976023	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=5.7383e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,18:10,11:10,7
chr2	242138000	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.024789;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:3,1:5,4
chr20	348484	.	C	CGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.19369;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,5:3,2:7,3
chr20	850094	.	T	TACACACACAC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.045151;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,7:10,6:3,1
chr20	2842821	.	GATAGACAT	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:2,2:6,2
chr20	3998574	.	CAA	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.030303;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,4:2,4:0,0
chr20	4168883	.	CTATTTTATTT	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.025866;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:10,3:13,10
chr20	4971299	.	A	AAC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.01398;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,9:10,4:5,5
chr20	5583225	.	CA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.01093;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:3,8:3,1
chr20	6188805	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00060177;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:31,13:14,6:17,7
chr20	6368317	.	A	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.011069;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:18,6:11,4
chr20	7051087	.	A	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.067292;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:9,2:14,4
chr20	8031594	.	G	GT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.020047;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:10,12:2,2:8,10
chr20	8031779	.	GATGT	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.045366;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:13,9:5,2
chr20	10498679	.	CTTTTCT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.097509;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,5:11,1:8,4
chr20	10558363	.	C	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,4:5,1:5,3
chr20	11519528	.	C	CATATATATAT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.039737;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:5,4:3,1
chr20	11945540	.	C	CAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.1866;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,4:10,4:1,0
chr20	12188094	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0072434;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:12,3:13,5
chr20	12506579	.	TACACACACACACAC	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.0090498;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,5:3,3:0,2
chr20	13347841	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0088148;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,8:11,7:7,1
chr20	13655841	.	G	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00072644;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:11,6:7,5
chr20	14854463	.	T	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0033296;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:12,3:4,4
chr20	15713995	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11779;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:16,3:7,1
chr20	16847421	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.065277;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:7,3:7,3
chr20	17164720	.	A	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.02905;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:9,5:10,1
chr20	19758209	.	TTCCTCCTCTTCCTCC	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.030792;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:7,1:6,4
chr20	19844713	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.038406;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,6:3,4:5,2
chr20	20054014	.	T	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00062341;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,14:4,9:5,5
chr20	20098607	.	C	CAAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.023384;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,7:5,6:4,1
chr20	20594728	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.080632;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:7,5:5,1
chr20	21215901	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=5.8478e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:5,4:9,7
chr20	22082830	.	A	ATC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:15,2:8,2
chr20	22145884	.	G	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.046659;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:9,5:12,3
chr20	22907106	.	A	AT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.023323;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,11:6,6:8,5
chr20	23648220	.	A	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.26923;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:5,2:2,1:3,1
chr20	23794248	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.028266;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:9,1:11,5
chr20	24543152	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00058827;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:11,4:10,6
chr20	26553908	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:0,0:15,4
chr20	26553909	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:1,0:14,4
chr20	26558541	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.034074;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:34,9:27,5:7,4
chr20	26558545	.	A	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.046841;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:34,8:26,4:8,4
chr20	26755238	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.013832;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:16,8:0,1
chr20	27161441	.	G	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.083817;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,4:9,1:13,3
chr20	27571425	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.27668;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:13,3:13,3:0,0
chr20	28498801	.	GA	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.047062;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:38,11:26,8:12,3
chr20	28513354	.	T	C	0	PASS	DP=294;GPV=1;SPV=0.018002;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:150:133,17:89,10:44,7
chr20	28513906	.	A	G	0	PASS	DP=179;GPV=1;SPV=0.024244;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:89,17:11,1:78,16
chr20	28525782	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.045506;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:10,3:21,1
chr20	28530574	.	A	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.17137;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:13,1:8,3
chr20	28764397	.	A	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0060655;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:12,3:12,6
chr20	28841135	.	A	T	0	PASS	DP=489;GPV=1;SPV=0.012388;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:274:235,39:145,24:90,15
chr20	29048293	.	G	A	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.030284;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:59,14:27,10:32,4
chr20	29053060	.	T	G	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.01669;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:98:87,11:32,3:55,8
chr20	29074228	.	C	T	0	PASS	DP=330;GPV=1;SPV=0.011905;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:178:160,18:78,6:82,12
chr20	29092153	.	T	A	0	PASS	DP=174;GPV=1;SPV=0.0081632;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:76,16:49,7:27,9
chr20	29484239	.	C	T	0	PASS	DP=157;GPV=1;SPV=0.0056503;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:59,20:33,4:26,16
chr20	29484262	.	T	C	0	PASS	DP=140;GPV=1;SPV=0.0027154;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:53,16:28,4:25,12
chr20	29513191	.	C	T	0	PASS	DP=269;GPV=1;SPV=0.015832;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:155:126,29:59,9:67,20
chr20	29518883	.	T	A	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.044612;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:74,12:38,6:36,6
chr20	29764762	.	A	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.20342;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:5,2:13,2
chr20	29775827	.	A	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.031184;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:17,4:22,1
chr20	29813639	.	A	G	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.036467;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:59,12:35,2:24,10
chr20	29938136	.	C	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.044012;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:32,11:4,1
chr20	29993826	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,3:5,1
chr20	30019959	.	C	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.040043;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:1,5:0,1:1,4
chr20	30177373	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0069365;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:20,6:8,1
chr20	30218923	.	GGT	G	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.038382;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:61,12:33,5:28,7
chr20	30319291	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.076397;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:18,1:15,3
chr20	30756889	.	T	G	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.019521;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:71,13:23,3:48,10
chr20	31055141	.	T	A	0	PASS	DP=190;GPV=1;SPV=0.022857;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:98:80,18:44,10:36,8
chr20	31064593	.	T	TGGAAA	0	PASS	DP=330;GPV=1;SPV=0.0271;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:197:129,22:58,5:71,17
chr20	31072067	.	G	GTGGAATGGAA	0	PASS	DP=453;GPV=1;SPV=0.0097515;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:266:150,27:81,19:69,8
chr20	31832757	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.003828;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:13,6:13,6
chr20	32094705	.	AAAAGAAAGAAAG	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.076981;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:11,6:10,1
chr20	32176929	.	C	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:12,1:3,3
chr20	32683247	.	C	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.049275;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:7,4:5,2
chr20	32964005	.	C	CCTTCTT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.18393;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,4:14,2:12,2
chr20	33087753	.	C	CACACACACACAA	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.017877;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,12:12,6:9,6
chr20	33128672	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.035909;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,6:18,3:15,3
chr20	33486424	.	TTG	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.10954;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:18,2:15,3
chr20	34659444	.	G	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.11202;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:17,3:11,2
chr20	34659445	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.18741;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:17,3:19,1
chr20	35644636	.	CTGAGAA	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0029127;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:12,7:6,5
chr20	35722427	.	A	AAT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.019548;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:5,5:5,2
chr20	35756444	.	CAAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.00096242;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,15:6,13:1,2
chr20	37067781	.	A	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14143;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:9,1:6,3
chr20	37677407	.	T	TGAGAGAGAGAGAGA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,6:4,2:2,4
chr20	38122424	.	TATATATATATATACACAC	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0052174;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:4,2:3,5
chr20	38124075	.	TTA	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0096618;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:7,3:2,4
chr20	39546333	.	G	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0011917;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:11,7:17,3
chr20	39944581	.	C	CGTGT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.018762;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,8:10,5:4,3
chr20	40435661	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.071891;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:23,3:13,2
chr20	40799508	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0017052;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:15,9:16,5
chr20	42794816	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.028284;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:2,6:5,1
chr20	43761217	.	T	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.069354;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:7,3:17,2
chr20	44352966	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.10927;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:7,6:8,1
chr20	44722467	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:4,2:6,2
chr20	47191415	.	GTGGATGGATGGATGGA	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0016586;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:3,7:7,3
chr20	47510432	.	C	CAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.041958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:2,4:2,1
chr20	47890678	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.023472;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:8,1:15,4
chr20	48250829	.	A	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.046816;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:7,3:5,5
chr20	48573458	.	AGTTCTCATCACCAACTGCCTCATCCTGGTTTGAAGACAG	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0073297;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:7,4:2,3
chr20	49022432	.	A	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.036566;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:11,3:6,3
chr20	49254660	.	G	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0013432;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:15,17:9,11:6,6
chr20	49323619	.	TAA	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0032734;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,7:2,6:1,1
chr20	49401268	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0047847;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:1,2:3,3
chr20	50094038	.	T	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.18447;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,4:4,1:5,3
chr20	50681241	.	AAG	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.010837;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,4:4,1
chr20	50782593	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.022677;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:13,5:12,1
chr20	51540658	.	G	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:1,1:6,1
chr20	52733811	.	A	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.04287;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:5,4:10,5
chr20	52986401	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.01441;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,7:6,5:7,2
chr20	53595046	.	C	CA	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.054945;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,3:3,3:0,0
chr20	53670953	.	A	AG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0031242;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,13:4,6:4,7
chr20	53853717	.	GGAAGGAAGGAAAGAAA	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:12,4:0,0
chr20	54058593	.	C	CTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:5,3:5,1
chr20	55688941	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.010968;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:6,2:12,4
chr20	55977899	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.11424;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:3,4:12,2
chr20	56735857	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0004781;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,13:0,2:6,11
chr20	56888307	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00051706;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:7,2:16,8
chr20	57031886	.	TG	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:1,2:12,2
chr20	57550651	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0016175;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:7,8:15,3
chr20	57850478	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0020871;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:6,7:18,3
chr20	57931378	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.014582;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,12:16,6:18,6
chr20	58974064	.	GGAGGAGGAAGAGGAAGAA	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.011329;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:9,7:6,2
chr20	59050022	.	C	CTCTTTCTTTCTT	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0096894;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:7,6:2,1:5,5
chr20	60298262	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00038112;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:14,8:10,4
chr20	60356443	.	CATATATATATAT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.020898;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:2,5:2,1
chr20	60937919	.	TAGTC	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:3,2:6,2
chr20	60992639	.	G	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.34103;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,4:6,2:11,2
chr20	61242949	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0095364;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:6,4:7,5
chr20	63113757	.	C	CA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.02916;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,7:17,4:5,3
chr20	63550977	.	G	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.00012058;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:16,7:9,5
chr20	64201999	.	CCGCGTGTCGGGAACCCCT	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.025141;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:12,6:13,3
chr21	5221111	.	C	T	0	PASS	DP=309;GPV=1;SPV=0.041809;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:171:147,24:90,12:57,12
chr21	5233816	.	G	T	0	PASS	DP=368;GPV=1;SPV=0.037938;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:221:196,25:133,17:63,8
chr21	5336009	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.15033;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:8,2:11,2
chr21	6439083	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.013369;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:2,6:1,1:1,5
chr21	7259334	.	A	AGGAAT	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.010542;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:66,8:31,5:35,3
chr21	7272733	.	G	A	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.026258;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:53,13:32,6:21,7
chr21	7318241	.	G	C	0	PASS	DP=173;GPV=1;SPV=0.016977;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:98:76,22:38,5:38,17
chr21	7923952	.	C	T	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.002962;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:67,18:32,10:35,8
chr21	7925632	.	G	A	0	PASS	DP=153;GPV=1;SPV=0.018535;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:73,22:36,12:37,10
chr21	7930930	.	G	A	0	PASS	DP=220;GPV=1;SPV=0.046012;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:125:102,23:47,14:55,9
chr21	7947527	.	CCCATT	C	0	PASS	DP=166;GPV=1;SPV=0.021582;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:67,17:30,6:37,11
chr21	7954799	.	G	A	0	PASS	DP=208;GPV=1;SPV=0.024987;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:95,23:46,11:49,12
chr21	7956049	.	A	C	0	PASS	DP=192;GPV=1;SPV=0.041181;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:105:85,20:38,11:47,9
chr21	7957932	.	T	A	0	PASS	DP=165;GPV=1;SPV=0.011693;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:63,20:32,11:31,9
chr21	7958822	.	T	A	0	PASS	DP=387;GPV=1;SPV=0.048533;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:217:183,34:90,15:93,19
chr21	8233759	.	GTCTC	G	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.010825;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:28,7:16,5:12,2
chr21	8441992	.	GGGC	G	0	PASS	DP=2900;GPV=1;SPV=0.042171;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:1670:1429,170:517,60:912,110
chr21	8529040	.	T	C	0	PASS	DP=235;GPV=1;SPV=0.0075541;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:136:119,17:60,12:59,5
chr21	8563236	.	AC	A	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.0071452;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:50,9:19,2:31,7
chr21	8591154	.	A	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.086103;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:10,3:10,1
chr21	8664871	.	GAAATGATGAGACA	G	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.038552;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:39,10:26,3:13,7
chr21	8683354	.	C	T	0	PASS	DP=161;GPV=1;SPV=0.0040996;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:66,19:39,11:27,8
chr21	8700048	.	G	A	0	PASS	DP=138;GPV=1;SPV=0.017086;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:57,16:29,10:28,6
chr21	8770206	.	T	C	0	PASS	DP=211;GPV=1;SPV=0.038583;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:92,21:42,13:50,8
chr21	8783441	.	G	GT	0	PASS	DP=237;GPV=1;SPV=0.030156;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:129:94,21:44,10:50,11
chr21	8786423	.	TTCC	T	0	PASS	DP=266;GPV=1;SPV=0.047543;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:153:124,22:79,15:45,7
chr21	8798435	.	C	T	0	PASS	DP=173;GPV=1;SPV=0.026255;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:77,18:50,8:27,10
chr21	8806432	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0024099;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:4,3:6,8
chr21	8819260	.	C	CT	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0059286;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:12,8:18,3
chr21	8824094	.	T	TA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.11785;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:4,3:9,3
chr21	8832187	.	A	C	0	PASS	DP=129;GPV=1;SPV=0.0024352;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:45,17:22,8:23,9
chr21	8850324	.	C	T	0	PASS	DP=502;GPV=1;SPV=0.01289;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:278:250,28:132,16:118,12
chr21	8853786	.	C	T	0	PASS	DP=530;GPV=1;SPV=0.035337;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:287:257,30:129,11:128,19
chr21	8855438	.	T	A	0	PASS	DP=325;GPV=1;SPV=0.041858;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:147:130,17:93,15:37,2
chr21	8857169	.	C	T	0	PASS	DP=287;GPV=1;SPV=0.0012623;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:169:150,19:77,10:73,9
chr21	8858565	.	G	C	0	PASS	DP=575;GPV=1;SPV=0.031343;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:329:295,34:187,16:108,18
chr21	8864192	.	G	A	0	PASS	DP=447;GPV=1;SPV=0.043599;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:248:219,29:95,9:124,20
chr21	8882912	.	C	G	0	PASS	DP=234;GPV=1;SPV=0.031042;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:133:107,26:61,16:46,10
chr21	8997035	.	C	T	0	PASS	DP=267;GPV=1;SPV=0.00075409;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:145:119,26:47,13:72,13
chr21	9020577	.	G	C	0	PASS	DP=286;GPV=1;SPV=0.035284;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:160:135,25:61,15:74,10
chr21	9061147	.	G	A	0	PASS	DP=269;GPV=1;SPV=0.023936;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:142:123,19:54,9:69,10
chr21	9063715	.	C	T	0	PASS	DP=309;GPV=1;SPV=0.017066;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:164:144,20:68,11:76,9
chr21	9079810	.	A	G	0	PASS	DP=158;GPV=1;SPV=0.0018708;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:76,18:34,5:42,13
chr21	9084776	.	C	T	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.036095;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:70,18:33,8:37,10
chr21	9088617	.	G	A	0	PASS	DP=303;GPV=1;SPV=0.0283;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:179:156,23:46,8:110,15
chr21	9093909	.	T	A	0	PASS	DP=234;GPV=1;SPV=0.032151;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:120:100,20:33,8:67,12
chr21	9095993	.	C	G	0	PASS	DP=201;GPV=1;SPV=0.01759;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:90,14:37,11:53,3
chr21	9100763	.	G	A	0	PASS	DP=493;GPV=1;SPV=0.011475;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:264:228,36:111,13:117,23
chr21	9107269	.	G	C	0	PASS	DP=240;GPV=1;SPV=0.018499;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:130:108,22:55,15:53,7
chr21	9127820	.	T	C	0	PASS	DP=480;GPV=1;SPV=0.039051;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:264:223,41:121,16:102,25
chr21	9133399	.	A	G	0	PASS	DP=273;GPV=1;SPV=0.032516;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:163:140,23:71,8:69,15
chr21	9134566	.	G	T	0	PASS	DP=405;GPV=1;SPV=0.02972;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:234:196,38:84,15:112,23
chr21	9134738	.	T	TC	0	PASS	DP=351;GPV=1;SPV=0.0034009;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:182:157,23:90,18:67,5
chr21	9177783	.	G	A	0	PASS	DP=401;GPV=1;SPV=0.035694;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:205:173,32:83,15:90,17
chr21	9183977	.	G	T	0	PASS	DP=396;GPV=1;SPV=0.0064327;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:206:169,37:85,16:84,21
chr21	9249156	.	T	A	0	PASS	DP=418;GPV=1;SPV=0.0014397;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:196:169,27:88,16:81,11
chr21	9250971	.	G	A	0	PASS	DP=449;GPV=1;SPV=0.049173;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:251:222,29:111,21:111,8
chr21	9253375	.	C	A	0	PASS	DP=569;GPV=1;SPV=0.014473;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:310:275,35:165,22:110,13
chr21	9255185	.	T	A	0	PASS	DP=539;GPV=1;SPV=0.012857;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:301:269,32:134,21:135,11
chr21	9255403	.	C	T	0	PASS	DP=512;GPV=1;SPV=0.046245;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:282:252,30:125,17:127,13
chr21	9257802	.	A	T	0	PASS	DP=488;GPV=1;SPV=0.047707;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:260:232,28:111,9:121,19
chr21	9257908	.	G	T	0	PASS	DP=608;GPV=1;SPV=0.011602;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:323:280,43:133,19:147,24
chr21	9259952	.	C	A	0	PASS	DP=521;GPV=1;SPV=0.010574;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:257:213,26:118,12:95,14
chr21	9269934	.	C	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.032349;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:46,8:17,6:29,2
chr21	9271680	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.12627;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:29,3:1,1
chr21	9274079	.	G	GA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:5,2:7,2
chr21	9281724	.	T	C	0	PASS	DP=242;GPV=1;SPV=0.014968;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:144:121,23:79,15:42,8
chr21	9281917	.	C	A	0	PASS	DP=241;GPV=1;SPV=0.022598;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:137:119,18:52,10:67,8
chr21	9290140	.	T	C	0	PASS	DP=350;GPV=1;SPV=0.037032;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:177:159,18:74,7:85,11
chr21	9296068	.	T	A	0	PASS	DP=278;GPV=1;SPV=0.02408;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:163:138,25:52,6:86,19
chr21	9296372	.	A	AG	0	PASS	DP=353;GPV=1;SPV=0.013408;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:207:182,25:96,17:86,8
chr21	9298276	.	G	A	0	PASS	DP=340;GPV=1;SPV=0.036769;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:181:151,30:55,13:96,17
chr21	9302284	.	TG	T	0	PASS	DP=423;GPV=1;SPV=0.036025;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:223:199,24:95,11:104,13
chr21	9302286	.	T	TAA	0	PASS	DP=419;GPV=1;SPV=0.043678;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:219:182,24:86,9:96,15
chr21	9302543	.	G	A	0	PASS	DP=307;GPV=1;SPV=0.047274;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:184:160,24:82,7:78,17
chr21	9305569	.	A	T	0	PASS	DP=312;GPV=1;SPV=0.004428;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:180:155,25:73,11:82,14
chr21	9307181	.	T	G	0	PASS	DP=374;GPV=1;SPV=0.033666;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:215:190,25:82,11:108,14
chr21	9309745	.	C	T	0	PASS	DP=334;GPV=1;SPV=0.0012439;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:209:174,30:92,20:82,10
chr21	9312447	.	C	T	0	PASS	DP=423;GPV=1;SPV=0.047154;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:236:207,29:109,17:98,12
chr21	9314168	.	C	G	0	PASS	DP=483;GPV=1;SPV=8.5725e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:273:215,58:104,32:111,26
chr21	9317020	.	G	C	0	PASS	DP=263;GPV=1;SPV=0.01741;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:130:111,19:64,14:47,5
chr21	9320170	.	G	A	0	PASS	DP=407;GPV=1;SPV=0.0012808;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:227:180,47:65,33:115,14
chr21	9321156	.	G	C	0	PASS	DP=358;GPV=1;SPV=0.0034652;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:199:175,24:77,13:98,11
chr21	9324923	.	C	T	0	PASS	DP=345;GPV=1;SPV=0.033353;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:200:171,29:98,14:73,15
chr21	9325560	.	C	T	0	PASS	DP=516;GPV=1;SPV=0.022753;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:296:266,30:148,16:118,14
chr21	9327769	.	G	A	0	PASS	DP=361;GPV=1;SPV=0.0017408;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:194:168,26:90,16:78,10
chr21	9327799	.	G	A	0	PASS	DP=405;GPV=1;SPV=8.6454e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:220:189,31:92,20:97,11
chr21	9329414	.	G	C	0	PASS	DP=377;GPV=1;SPV=0.019855;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:198:171,27:76,14:95,13
chr21	9331000	.	C	T	0	PASS	DP=284;GPV=1;SPV=0.0013678;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:156:125,31:63,18:62,13
chr21	9331071	.	C	T	0	PASS	DP=305;GPV=1;SPV=9.4138e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:170:134,36:68,21:66,15
chr21	9331208	.	T	C	0	PASS	DP=326;GPV=1;SPV=0.0090971;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:199:162,37:82,17:80,20
chr21	9333403	.	A	T	0	PASS	DP=329;GPV=1;SPV=0.0066175;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:190:158,32:76,18:82,14
chr21	9333753	.	G	A	0	PASS	DP=265;GPV=1;SPV=0.0015494;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:154:120,34:50,17:70,17
chr21	9335609	.	T	G	0	PASS	DP=259;GPV=1;SPV=0.035129;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:144:121,23:70,9:51,14
chr21	9337270	.	A	T	0	PASS	DP=282;GPV=1;SPV=0.0053293;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:149:120,29:54,14:66,15
chr21	9338092	.	T	C	0	PASS	DP=290;GPV=1;SPV=0.00086025;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:127,32:53,15:74,17
chr21	9340700	.	G	C	0	PASS	DP=297;GPV=1;SPV=0.0068861;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:166:138,28:66,15:72,13
chr21	9342509	.	G	A	0	PASS	DP=342;GPV=1;SPV=0.021826;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:185:160,25:61,11:99,14
chr21	9346496	.	A	T	0	PASS	DP=353;GPV=1;SPV=0.036759;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:185:160,25:82,14:78,11
chr21	9346571	.	T	C	0	PASS	DP=392;GPV=1;SPV=0.02125;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:193:173,20:89,5:84,15
chr21	9349138	.	G	GC	0	PASS	DP=307;GPV=1;SPV=0.049995;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:169:149,20:79,10:70,10
chr21	9350854	.	C	T	0	PASS	DP=387;GPV=1;SPV=0.0078513;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:221:190,31:95,17:95,14
chr21	9353047	.	G	T	0	PASS	DP=341;GPV=1;SPV=0.0063786;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:182:148,34:85,19:63,15
chr21	9354467	.	C	T	0	PASS	DP=332;GPV=1;SPV=0.0098387;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:188:162,26:49,11:113,15
chr21	9354918	.	T	G	0	PASS	DP=353;GPV=1;SPV=0.046627;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:192:166,26:90,11:76,15
chr21	9356868	.	C	T	0	PASS	DP=464;GPV=1;SPV=0.021887;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:265:237,28:132,13:105,15
chr21	9358898	.	T	C	0	PASS	DP=352;GPV=1;SPV=0.020415;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:173:144,29:69,16:75,13
chr21	9363273	.	C	T	0	PASS	DP=321;GPV=1;SPV=0.012606;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:192:168,24:97,16:71,8
chr21	9363641	.	C	T	0	PASS	DP=241;GPV=1;SPV=0.045542;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:121:100,21:41,10:59,11
chr21	9367042	.	A	G	0	PASS	DP=642;GPV=1;SPV=0.0028539;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:356:318,38:167,21:151,17
chr21	9368429	.	C	T	0	PASS	DP=683;GPV=1;SPV=0.046887;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:380:340,40:158,21:182,19
chr21	9369655	.	G	A	0	PASS	DP=525;GPV=1;SPV=0.036189;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:275:240,35:130,21:110,14
chr21	9370242	.	G	A	0	PASS	DP=444;GPV=1;SPV=0.0022937;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:227:194,33:85,16:109,17
chr21	9373504	.	G	GAGAT	0	PASS	DP=347;GPV=1;SPV=0.019397;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:194:162,32:72,14:90,18
chr21	9568769	.	C	A	0	PASS	DP=153;GPV=1;SPV=0.0005032;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:60,29:34,16:26,13
chr21	9569908	.	C	T	0	PASS	DP=200;GPV=1;SPV=0.036987;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:101:82,19:46,9:36,10
chr21	9573354	.	C	T	0	PASS	DP=140;GPV=1;SPV=0.018604;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:56,17:29,10:27,7
chr21	9575796	.	C	T	0	PASS	DP=234;GPV=1;SPV=0.039889;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:136:115,21:57,10:58,11
chr21	9579060	.	A	G	0	PASS	DP=161;GPV=1;SPV=0.02489;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:48,14:32,6:16,8
chr21	9585984	.	C	G	0	PASS	DP=249;GPV=1;SPV=0.0098747;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:122:98,24:49,12:49,12
chr21	9593820	.	C	T	0	PASS	DP=165;GPV=1;SPV=0.016174;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:76,16:24,8:52,8
chr21	9595670	.	C	T	0	PASS	DP=161;GPV=1;SPV=0.025548;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:62,14:36,6:26,8
chr21	9604294	.	C	T	0	PASS	DP=144;GPV=1;SPV=0.036297;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:61,14:28,6:33,8
chr21	9611369	.	C	CT	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.03177;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,12:24,8:15,4
chr21	9622929	.	C	T	0	PASS	DP=135;GPV=1;SPV=0.026582;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:58,16:38,6:20,10
chr21	9644497	.	G	T	0	PASS	DP=146;GPV=1;SPV=0.019348;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:57,18:40,8:17,10
chr21	9653120	.	A	G	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.0013323;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:54,25:27,13:27,12
chr21	9691585	.	C	T	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.014408;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:98:74,24:35,13:39,11
chr21	9700317	.	G	T	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.035691;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:47,13:29,4:18,9
chr21	9717066	.	A	G	0	PASS	DP=165;GPV=1;SPV=0.03647;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:79,12:45,7:34,5
chr21	9722947	.	A	G	0	PASS	DP=162;GPV=1;SPV=0.022057;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:71,16:33,10:38,6
chr21	9765078	.	GTATATATATA	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0027332;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:14,10:10,8:4,2
chr21	9806006	.	G	A	0	PASS	DP=155;GPV=1;SPV=0.0014147;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:93:69,24:29,11:40,13
chr21	9820500	.	C	G	0	PASS	DP=414;GPV=1;SPV=0.0030957;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:218:186,28:100,18:86,10
chr21	9820892	.	C	G	0	PASS	DP=427;GPV=1;SPV=0.047126;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:225:181,33:92,18:89,15
chr21	9821495	.	G	C	0	PASS	DP=541;GPV=1;SPV=0.035867;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:316:269,47:113,25:156,22
chr21	9824116	.	C	T	0	PASS	DP=420;GPV=1;SPV=0.013515;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:247:210,37:131,25:79,12
chr21	9827822	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.047138;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:19,6:11,2
chr21	9874259	.	A	T	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.032088;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:76,14:39,3:37,11
chr21	9885332	.	CT	C	0	PASS	DP=156;GPV=1;SPV=0.013025;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:68,21:36,15:32,6
chr21	9907282	.	AT	A	0	PASS	DP=154;GPV=1;SPV=0.018567;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:70,8:35,3:35,5
chr21	9922536	.	A	T	0	PASS	DP=136;GPV=1;SPV=0.00058342;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:57,10:25,7:32,3
chr21	9983152	.	A	G	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.022997;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:53,16:26,8:27,8
chr21	10002648	.	C	G	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.015345;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:47,17:20,11:27,6
chr21	10334729	.	C	T	0	PASS	DP=320;GPV=1;SPV=0.035482;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:195:167,28:88,20:79,8
chr21	10360392	.	G	A	0	PASS	DP=443;GPV=1;SPV=0.03335;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:238:204,34:109,15:95,19
chr21	10369115	.	C	T	0	PASS	DP=161;GPV=1;SPV=0.032698;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:66,17:22,3:44,14
chr21	10393398	.	A	C	0	PASS	DP=239;GPV=1;SPV=0.049025;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:133:116,17:75,11:41,6
chr21	10401605	.	T	C	0	PASS	DP=251;GPV=1;SPV=0.016593;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:132:114,18:73,15:41,3
chr21	10421129	.	C	T	0	PASS	DP=199;GPV=1;SPV=0.0065045;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:87,21:39,9:48,12
chr21	10427641	.	A	G	0	PASS	DP=380;GPV=1;SPV=0.0011008;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:213:176,37:88,18:88,19
chr21	10434766	.	G	A	0	PASS	DP=158;GPV=1;SPV=0.043736;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:70,10:32,6:38,4
chr21	10442800	.	G	T	0	PASS	DP=230;GPV=1;SPV=0.0040681;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:133:106,27:58,13:48,14
chr21	10443821	.	C	A	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.020561;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:89,11:44,6:45,5
chr21	10446922	.	G	T	0	PASS	DP=310;GPV=1;SPV=0.031393;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:180:162,18:96,12:66,6
chr21	10468490	.	T	TGTGTGC	0	PASS	DP=306;GPV=1;SPV=0.0029326;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:177:136,38:73,14:63,24
chr21	10480037	.	C	G	0	PASS	DP=351;GPV=1;SPV=0.03139;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:186:160,26:83,16:77,10
chr21	10581802	.	G	A	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.023901;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:81,19:36,8:45,11
chr21	10656340	.	A	C	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.0083471;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:46,11:32,5:14,6
chr21	10685060	.	C	G	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.006956;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:70,25:30,12:40,13
chr21	10805196	.	CA	C	0	PASS	DP=239;GPV=1;SPV=0.010772;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:133:105,28:60,18:45,10
chr21	12979753	.	G	T	0	PASS	DP=161;GPV=1;SPV=0.035953;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:71,17:38,6:33,11
chr21	13069293	.	G	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.076851;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:14,3:18,1
chr21	13485129	.	T	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.012989;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:36,14:19,11:17,3
chr21	13885151	.	A	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.022967;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,7:1,1:2,6
chr21	13942417	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00094846;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,15:6,9:7,6
chr21	14017766	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.16912;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:6,3:13,1
chr21	16256630	.	T	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00045891;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:11,5:9,6
chr21	16284658	.	T	TTG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.049827;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:10,6:9,3
chr21	17365348	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0013438;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:7,5:9,1
chr21	17703814	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.035087;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:9,8:9,2
chr21	18369973	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,7:1,6:2,1
chr21	18387612	.	TACACACACACAC	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0051869;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,12:4,5:2,7
chr21	18705237	.	A	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=3.7005e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:10,8:9,8
chr21	19154405	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0062692;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:9,3:10,6
chr21	19345908	.	A	ATGTC	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.040844;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,6:16,1:5,5
chr21	19729409	.	A	AT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.057692;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,6:4,5:1,1
chr21	20488919	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:25:1,3:0,1:1,2
chr21	20969566	.	T	TTACAATGAAAAATTCAG	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.025865;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:13,5:8,4
chr21	21343352	.	T	TACACACACAC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.015238;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:3,4:6,5
chr21	21742582	.	A	AT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,7:1,4:4,3
chr21	24243452	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.05154;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:13,2:10,3
chr21	25220910	.	AT	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.01828;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:13,5:10,6
chr21	27131296	.	C	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0016717;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:12,7:19,4
chr21	27298943	.	TA	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.038795;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:7,5:13,3
chr21	27448654	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.001437;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:10,4:15,7
chr21	27502369	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0015405;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:9,6:9,3
chr21	27531878	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:4,5:2,1
chr21	27904417	.	A	AAAG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.090194;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:13,1:10,3
chr21	27951396	.	A	AT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.041061;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:14,8:5,2
chr21	28179992	.	C	CTA	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.15237;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:40,6:18,5:22,1
chr21	28864900	.	T	TAG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.043206;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,7:7,6:10,1
chr21	29296049	.	CAA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.025586;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,12:10,11:1,1
chr21	29519883	.	T	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.15909;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:4,5:3,3:1,2
chr21	29860020	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0085539;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:17,8:14,1
chr21	29905619	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0219;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:7,4:3,3
chr21	30153223	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.048244;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:12,1:15,5
chr21	30558081	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,9:0,5:4,4
chr21	30826651	.	T	TA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,6:5,4:2,2
chr21	30866484	.	G	GTA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0018511;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:2,8:2,4:0,4
chr21	31584399	.	C	CTTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.20553;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:8,1:4,3
chr21	32652938	.	G	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=6.9826e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:26,20:12,12:14,8
chr21	32892695	.	CTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,4:0,0:9,4
chr21	35554234	.	C	CT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.016968;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,7:2,4:2,3
chr21	35851420	.	T	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.29167;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:4,3:1,1:3,2
chr21	35865916	.	G	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.019153;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,9:22,4:13,5
chr21	36644650	.	ATATATG	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.098394;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,2:13,2
chr21	38329455	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.015866;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:14,5:18,2
chr21	38799741	.	G	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.022806;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:43,9:26,5:17,4
chr21	38905139	.	T	TAGATAGATAGATAGATAGATAGACAGAC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.18048;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,5:12,3:12,2
chr21	38915434	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.038416;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:15,4:6,1
chr21	39917573	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=4.1799e-08;SS=2;SSC=73;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:16,24:8,14:8,10
chr21	39974524	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.038306;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:7,4:9,2
chr21	40151130	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.019542;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:43,11:23,5:20,6
chr21	40266635	.	T	TTATATATATATA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.29464;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,5:5,4:3,1
chr21	40453040	.	T	TTGTGTG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.094071;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,5:7,2:5,3
chr21	40765100	.	A	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.038274;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:15,4:9,2:6,2
chr21	40856357	.	T	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.009884;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:20,8:5,3:15,5
chr21	41041897	.	AAG	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.15033;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,4:8,3:11,1
chr21	41179498	.	C	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.036089;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:6,4:1,1
chr21	41518516	.	AC	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.022054;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:19,7:11,1
chr21	41604381	.	CTTTCTTTCTCTTTCTTTCTTTCT	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.011513;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:4,3:28,7
chr21	42401381	.	A	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.051203;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:14,2:6,4
chr21	43736629	.	GTT	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0054348;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:8,13:4,11:4,2
chr21	43965613	.	G	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.045689;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:43,7:29,1:14,6
chr21	44676286	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0034821;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:38,10:20,7:18,3
chr21	44925418	.	GGGAGGGAAGGAA	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.013474;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:12,6:4,4
chr21	45511088	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,4:7,1:7,3
chr21	45987789	.	CG	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0031242;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,13:2,7:6,6
chr21	46134707	.	C	CAGGGTGAGGGTG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0035197;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,11:6,7:2,4
chr21	46135340	.	CAATGTCCCCTCA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.019042;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,14:4,3:10,11
chr21	46201032	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.19313;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,4:4,2:25,2
chr21	46503681	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.041461;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:4,4:13,3
chr21	46506724	.	T	TTTC	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.1356;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:5,2:27,4
chr21	46523393	.	AT	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.018157;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:16,13:10,8:6,5
chr22	10519159	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.016106;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:31,10:0,1
chr22	10540138	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.053114;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:21,3:7,1
chr22	10692797	.	C	A	0	PASS	DP=249;GPV=1;SPV=0.0086306;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:133:108,25:61,8:47,17
chr22	10711502	.	G	A	0	PASS	DP=202;GPV=1;SPV=0.012888;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:84,19:42,10:42,9
chr22	10718972	.	C	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.012144;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:42,9:19,3:23,6
chr22	10719050	.	C	CTCCAT	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.041973;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,7:13,2:18,5
chr22	10730754	.	CTTG	C	0	PASS	DP=214;GPV=1;SPV=0.030973;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:123:100,23:57,10:43,13
chr22	10737681	.	T	A	0	PASS	DP=330;GPV=1;SPV=0.047801;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:177:154,21:71,7:83,14
chr22	10747004	.	G	T	0	PASS	DP=343;GPV=1;SPV=0.016617;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:177:149,28:95,11:54,17
chr22	11038491	.	T	C	0	PASS	DP=287;GPV=1;SPV=0.015677;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:139,20:75,11:64,9
chr22	11039319	.	ATT	A	0	PASS	DP=222;GPV=1;SPV=0.018223;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:93,17:43,11:50,6
chr22	11043051	.	C	T	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.021519;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:48,10:27,7:21,3
chr22	11048550	.	T	A	0	PASS	DP=222;GPV=1;SPV=0.001035;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:130:114,16:52,4:62,12
chr22	11048836	.	T	C	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.0070553;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:77,12:30,3:47,9
chr22	11050709	.	G	A	0	PASS	DP=225;GPV=1;SPV=0.00091932;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:135:112,23:68,9:44,14
chr22	11056810	.	A	G	0	PASS	DP=292;GPV=1;SPV=4.9242e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:168:138,30:78,14:60,16
chr22	11058156	.	A	T	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.0096308;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:55,12:21,5:34,7
chr22	11284131	.	A	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.034481;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:7,3:7,3
chr22	11284214	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=5.846e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,17:11,4:7,13
chr22	11315794	.	G	A	0	PASS	DP=265;GPV=1;SPV=0.017106;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:145:119,26:67,13:52,13
chr22	11617036	.	C	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.000638;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:35,15:15,6:20,9
chr22	11617229	.	T	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.043506;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:41,14:24,3:17,11
chr22	11691473	.	A	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.026654;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:33,9:19,2:14,7
chr22	11789412	.	A	C	0	PASS	DP=236;GPV=1;SPV=0.02995;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:126:109,17:50,8:59,9
chr22	11831534	.	T	C	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.038796;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:59,9:13,2:46,7
chr22	11834556	.	T	C	0	PASS	DP=345;GPV=1;SPV=0.029507;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:184:159,25:63,3:96,22
chr22	11850005	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0068281;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:13,6:11,5
chr22	11855791	.	A	G	0	PASS	DP=440;GPV=1;SPV=0.045175;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:252:213,39:85,4:128,35
chr22	11859488	.	C	T	0	PASS	DP=191;GPV=1;SPV=0.030041;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:86,13:36,2:50,11
chr22	11865928	.	G	A	0	PASS	DP=232;GPV=1;SPV=0.0098825;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:128:113,15:71,12:42,3
chr22	11866660	.	T	C	0	PASS	DP=377;GPV=1;SPV=0.015796;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:192:159,33:89,12:70,21
chr22	11869587	.	T	C	0	PASS	DP=309;GPV=1;SPV=0.029408;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:164:147,17:65,10:82,7
chr22	11869839	.	G	A	0	PASS	DP=182;GPV=1;SPV=0.047269;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:92,15:23,4:69,11
chr22	11890253	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.032708;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:16,3:3,1
chr22	11890558	.	T	A	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.046989;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:67,12:45,10:22,2
chr22	11890603	.	A	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.0044489;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:47,12:27,5:20,7
chr22	11892130	.	C	T	0	PASS	DP=296;GPV=1;SPV=0.016442;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:170:143,27:87,14:56,13
chr22	11900144	.	T	C	0	PASS	DP=299;GPV=1;SPV=0.028786;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:163:137,26:95,10:42,16
chr22	11902251	.	C	A	0	PASS	DP=677;GPV=1;SPV=0.022691;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:378:333,45:181,21:152,24
chr22	11902252	.	A	T	0	PASS	DP=667;GPV=1;SPV=0.015515;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:375:328,47:166,21:162,26
chr22	11911908	.	G	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.066379;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,8:8,6:10,2
chr22	11928081	.	A	G	0	PASS	DP=655;GPV=1;SPV=0.048726;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:375:336,39:183,20:153,19
chr22	11936070	.	A	T	0	PASS	DP=418;GPV=1;SPV=0.00059618;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:209:167,42:88,25:79,17
chr22	11942334	.	C	G	0	PASS	DP=347;GPV=1;SPV=0.021383;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:198:165,33:44,21:121,12
chr22	11947623	.	C	A	0	PASS	DP=158;GPV=1;SPV=0.0050579;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:85,10:45,3:40,7
chr22	11950047	.	A	G	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.044156;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:80,10:40,6:40,4
chr22	11950699	.	TATAC	T	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.012602;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:38,12:10,2:28,10
chr22	11958784	.	C	A	0	PASS	DP=154;GPV=1;SPV=0.0042434;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:64,17:36,10:28,7
chr22	12043389	.	CT	C	0	PASS	DP=170;GPV=1;SPV=0.013846;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:77,13:42,6:35,7
chr22	12047416	.	A	G	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.038584;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:52,15:21,4:31,11
chr22	12071725	.	T	A	0	PASS	DP=209;GPV=1;SPV=0.018587;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:123:110,13:59,10:51,3
chr22	12073053	.	A	G	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.04415;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:101:82,19:39,9:43,10
chr22	12078216	.	T	A	0	PASS	DP=178;GPV=1;SPV=0.044888;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:85,19:40,8:45,11
chr22	12088780	.	CTT	C	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.0010345;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:61,17:25,12:36,5
chr22	12088800	.	A	T	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.0065432;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:73,16:27,10:46,6
chr22	12093764	.	T	C	0	PASS	DP=224;GPV=1;SPV=0.0048439;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:115:92,23:51,11:41,12
chr22	12096985	.	ATTTG	A	0	PASS	DP=162;GPV=1;SPV=0.0042836;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:76,18:47,7:29,11
chr22	12138075	.	A	G	0	PASS	DP=426;GPV=1;SPV=0.007091;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:231:206,25:101,16:105,9
chr22	12156723	.	A	C	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.041292;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:58,9:13,2:45,7
chr22	12200447	.	C	T	0	PASS	DP=337;GPV=1;SPV=0.041512;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:180:156,24:63,8:93,16
chr22	12208541	.	C	T	0	PASS	DP=179;GPV=1;SPV=0.029756;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:70,17:27,7:43,10
chr22	12213734	.	G	A	0	PASS	DP=231;GPV=1;SPV=0.0092587;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:149:128,21:52,9:76,12
chr22	12277008	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.00093163;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:4,3:3,6
chr22	12284638	.	A	G	0	PASS	DP=230;GPV=1;SPV=0.020841;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:127:108,19:68,13:40,6
chr22	12305907	.	A	G	0	PASS	DP=205;GPV=1;SPV=0.047813;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:121:100,21:78,18:22,3
chr22	12349893	.	T	G	0	PASS	DP=223;GPV=1;SPV=0.044175;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:134:118,16:63,5:55,11
chr22	12504173	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:10,4:0,0
chr22	12592601	.	G	A	0	PASS	DP=183;GPV=1;SPV=0.0059851;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:92,19:40,4:52,15
chr22	12617705	.	C	A	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.034319;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:69,14:32,8:37,6
chr22	12697095	.	G	C	0	PASS	DP=205;GPV=1;SPV=0.014095;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:79,18:40,10:39,8
chr22	12700082	.	A	T	0	PASS	DP=183;GPV=1;SPV=0.025064;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:91,20:55,11:36,9
chr22	12721756	.	T	C	0	PASS	DP=220;GPV=1;SPV=0.0062308;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:121:94,27:37,17:57,10
chr22	12723439	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.044668;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:42,9:14,5:28,4
chr22	12789806	.	C	CAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:4,6:4,1
chr22	12807011	.	G	C	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.022184;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:74,14:40,5:34,9
chr22	12810751	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0027702;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:45,11:31,4:14,7
chr22	12810923	.	G	GTAAC	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.15236;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,5:29,2:14,3
chr22	12817696	.	C	A	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.040334;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:52,7:22,5:30,2
chr22	12869391	.	T	C	0	PASS	DP=402;GPV=1;SPV=0.0010087;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:219:193,26:72,9:121,17
chr22	12877926	.	A	T	0	PASS	DP=281;GPV=1;SPV=0.037111;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:160:136,24:77,12:59,12
chr22	12883528	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.012287;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:22,4:6,2
chr22	12895438	.	G	C	0	PASS	DP=279;GPV=1;SPV=0.017536;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:161:134,27:85,13:49,14
chr22	12897751	.	C	A	0	PASS	DP=285;GPV=1;SPV=0.00022687;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:127,32:82,21:45,11
chr22	12901664	.	C	A	0	PASS	DP=223;GPV=1;SPV=0.011487;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:128:106,22:47,11:59,11
chr22	12903574	.	T	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0063397;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:33,4:0,4
chr22	12903902	.	C	A	0	PASS	DP=328;GPV=1;SPV=0.0083562;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:197:161,36:75,24:86,12
chr22	15412353	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.03885;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:44,13:22,9:22,4
chr22	15548844	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.028064;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:46,9:34,8:12,1
chr22	15659861	.	T	TA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.036709;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:0,2:22,7
chr22	15680325	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.019548;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:1,1:9,6
chr22	15708540	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.036782;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:7,2:4,3
chr22	15731112	.	G	C	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.038977;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:61,13:40,11:21,2
chr22	15794011	.	TA	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:9,4:0,0
chr22	15797061	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.068133;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:14,3:21,2
chr22	15837366	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.14691;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:14,4:13,1
chr22	15855606	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.19154;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:7,2:14,2
chr22	16421475	.	T	G	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.010599;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:39,16:16,9:23,7
chr22	16477420	.	TAA	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0076984;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:34,16:10,12:24,4
chr22	16883577	.	G	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.066681;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:17,4:19,1
chr22	17886804	.	CAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0040786;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,8:6,7:1,1
chr22	18084239	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.045694;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,6:8,5:5,1
chr22	18197351	.	G	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.10294;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:0,0:6,3
chr22	18204790	.	T	TATATA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.019827;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:16,6:9,3
chr22	18204837	.	CATATATT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.15941;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:12,3:13,1
chr22	18394806	.	G	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
chr22	18508963	.	CTTT	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.040005;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:32,10:22,9:10,1
chr22	18817078	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.1063;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:43,5:20,3:23,2
chr22	18850435	.	C	T	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.0015486;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:93:71,22:38,18:33,4
chr22	18864613	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.063369;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:18,2:13,3
chr22	18945973	.	T	G	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.020498;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:35,14:19,2:16,12
chr22	19761611	.	G	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.0020111;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:17,6:22,5
chr22	20336043	.	TA	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.045135;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:13,2:19,3
chr22	20695805	.	A	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.04045;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:39,6:14,4:25,2
chr22	21085828	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.039018;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:9,5:6,5
chr22	21178758	.	C	G	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.019424;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:46,14:19,5:27,9
chr22	21184688	.	G	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:9,2:3,2
chr22	21218520	.	G	T	0	PASS	DP=123;GPV=1;SPV=0.010965;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:59,7:36,6:23,1
chr22	21223209	.	C	CT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.045809;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,10:4,5:12,5
chr22	21224952	.	G	A	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.015733;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:73,15:37,9:36,6
chr22	21256883	.	C	T	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.022731;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:56,16:31,6:25,10
chr22	21306870	.	G	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.18947;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
chr22	22393137	.	GA	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.17909;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,5:9,2:10,3
chr22	22485355	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0012565;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:11,5:12,6
chr22	22501019	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.011299;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:6,8:5,1
chr22	23953122	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.020062;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:10,5:15,3
chr22	24251077	.	A	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.077531;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:10,4:20,1
chr22	24611773	.	TTG	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0081121;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:5,8:3,1
chr22	24647131	.	G	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.026665;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:39,16:14,6:25,10
chr22	24649431	.	G	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.047266;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:32,12:15,5:17,7
chr22	25499786	.	TCC	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.060606;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,3:2,1:0,2
chr22	25867619	.	A	ATTTCTTTC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.013499;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:4,5:12,7
chr22	25913947	.	G	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0021771;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:12,8:19,1
chr22	26116686	.	A	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.064244;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:13,2:19,2
chr22	26316871	.	GGAAA	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.012566;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,10:14,4:4,6
chr22	26371066	.	A	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00070453;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:3,3:15,5
chr22	26661959	.	TATAC	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.31818;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,2:4,1:1,1
chr22	26720774	.	G	GAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.056191;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,7:6,6:4,1
chr22	27053565	.	CTCTATATATA	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.22222;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,2:2,1:1,1
chr22	28243174	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0055997;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,9:4,5:3,4
chr22	29412875	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00051119;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:15,20:7,10:8,10
chr22	29704228	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:0,0:5,3
chr22	33559379	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0081203;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:12,4:11,1
chr22	33597278	.	GAA	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0019281;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:10,9:4,2
chr22	34151456	.	C	CAAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.012882;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,7:8,6:1,1
chr22	34300459	.	C	CTTTG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.029051;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,6:5,1:4,5
chr22	35013180	.	T	TA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.016254;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,5:2,1:3,4
chr22	35117748	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.15152;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:22,3:7,1:15,2
chr22	35709064	.	G	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0012095;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:15,4:8,4
chr22	36214791	.	CTG	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0052174;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,7:4,6:3,1
chr22	36227315	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.023574;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:10,13:6,11:4,2
chr22	37079017	.	G	GAA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.11479;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:20,1:4,3
chr22	39050030	.	C	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.041061;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:10,2:9,8
chr22	40149679	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0046348;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:5,4:3,4
chr22	40722477	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.035315;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,8:11,6:4,2
chr22	41312439	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.091143;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,6:10,1:7,5
chr22	42024930	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0003718;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:15,6:11,6
chr22	42055525	.	G	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=5.3881e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:26,22:11,9:15,13
chr22	42424414	.	C	CA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.020223;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,11:7,8:9,3
chr22	43032297	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.094071;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:8,1:4,4
chr22	43417447	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.011166;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:2,4:6,5
chr22	43705251	.	G	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.02165;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:14,5:15,1
chr22	43863195	.	A	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0056305;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,13:7,5:7,8
chr22	44347793	.	G	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.00023745;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:38,15:18,3:20,12
chr22	44408281	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0029154;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:14,7:16,3
chr22	44637661	.	A	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=8.388e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:32,13:16,2:16,11
chr22	44854024	.	CAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:3,4:1,1
chr22	44940388	.	C	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.024567;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:14,1:20,5
chr22	45028914	.	GGTTTTGCTCCCTCTACCTC	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.008813;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:12,3:10,4
chr22	45031952	.	GTCAGGCATTCTAATGGAATTCAGGTATTCTAATGGAT	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11126;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:17,4:9,2
chr22	46224970	.	CT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:18,1:5,3
chr22	46941418	.	A	AATAT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.041497;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:15,8:7,4:8,4
chr22	48729291	.	A	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.053977;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:6,3:10,2
chr22	49017619	.	T	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.038146;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:34,9:17,7:17,2
chr22	49017662	.	T	TC	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.024998;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,14:12,11:16,3
chr22	49031662	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00070453;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:14,4:4,4
chr22	49149250	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.025733;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:4,7:13,3
chr22	49700961	.	C	CT	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0099688;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:20,4:9,4
chr3	811946	.	G	GCACCA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.039018;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:8,5:7,5
chr3	2658965	.	GACAC	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.045366;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:13,8:5,3
chr3	2677449	.	T	TAGAG	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.13842;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:13,2:8,2
chr3	2937137	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=3.2852e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,16:12,9:12,7
chr3	3282501	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.022489;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:1,3:7,4
chr3	3284839	.	T	TTTCTTCTTCTTC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.053471;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:9,1:8,3
chr3	3763961	.	GT	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0017181;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:2,10:1,7:1,3
chr3	3790537	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.097916;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:7,2:7,3
chr3	4255552	.	CAAG	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.044074;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:9,5:9,3
chr3	5827030	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0030859;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:14,5:19,5
chr3	6338735	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.026658;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:17,6:13,1
chr3	6802586	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.015866;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:2,4:5,5
chr3	7939348	.	C	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.016425;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:9,5:6,6
chr3	8149448	.	A	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.16484;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,2:3,1:1,1
chr3	9218606	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.001437;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:15,5:10,6
chr3	9323802	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.02826;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:15,5:18,3
chr3	10410412	.	C	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00021271;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:15,7:12,5
chr3	12108899	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0043761;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:8,3:12,4
chr3	13009209	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.015217;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:11,3:12,4
chr3	15272630	.	CAT	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.049315;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:16,3:9,6
chr3	16761247	.	T	TTC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.036566;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:10,4:7,2
chr3	16761248	.	C	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.026224;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,6:1,5:3,1
chr3	18084532	.	T	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,6:4,4:4,2
chr3	18097749	.	CTCA	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.14084;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:12,2:14,2
chr3	18097755	.	CTGA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.12547;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:12,2:12,2
chr3	18097762	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.096637;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:10,2:14,2
chr3	18097763	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.10745;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:12,2:15,2
chr3	18097765	.	T	TA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.1228;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:12,2:16,2
chr3	18362860	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.12587;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,4:5,4:0,0
chr3	19434174	.	C	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0062647;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,12:11,5:17,7
chr3	19562991	.	AACACAC	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.11479;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:13,2:11,2
chr3	20061990	.	A	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.096892;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:8,3:11,1
chr3	21229506	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00059631;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:9,3:14,9
chr3	21681698	.	G	GA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.091659;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:9,4:4,2
chr3	21838694	.	A	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00088019;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:15,6:9,7
chr3	21881627	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=4.5681e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:11,19:7,12:4,7
chr3	22697698	.	G	GAAAAGAAA	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:1,3:1,2:0,1
chr3	23102581	.	C	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.012894;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:8,5:13,1
chr3	23420498	.	G	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=7.6729e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:12,7:5,4
chr3	23579384	.	CA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.046407;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:4,5:3,1
chr3	23716050	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0029924;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,12:5,5:3,7
chr3	23883904	.	C	CAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.062963;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,5:9,4:3,1
chr3	23950902	.	CTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.01174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:5,3:6,6
chr3	24375396	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.067038;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,5:10,2:8,3
chr3	26821412	.	G	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.021052;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:9,3:17,4
chr3	27282571	.	T	TTATATATA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.10815;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:16,4:14,2
chr3	28563427	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.026091;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:7,6:6,5
chr3	29109615	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:4,2:11,2
chr3	29162145	.	C	CTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.016632;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:9,4:6,2
chr3	29281114	.	G	GT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.008413;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,11:3,2:1,9
chr3	30297039	.	G	GCACACA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.020174;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,6:11,3:2,3
chr3	31489183	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.077118;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:18,5:3,1
chr3	31738855	.	T	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0033714;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:15,6:11,4
chr3	31856069	.	T	TAC	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.025986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:10,10:7,6:3,4
chr3	33166012	.	C	CAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.01217;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:12,14:5,12:7,2
chr3	33433365	.	TA	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:8,12:4,6:4,6
chr3	33433367	.	A	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,10:3,5:4,5
chr3	33715847	.	TAA	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,7:4,6:1,1
chr3	33852925	.	C	CTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.014884;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,8:2,6:1,2
chr3	34676329	.	A	ATTGCACACTTGCAAATACCAGCAAGTGTGGTAT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.17768;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:13,2:16,2
chr3	35057370	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=6.1031e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:7,8:12,3
chr3	35671582	.	T	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0090318;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:6,1:11,6
chr3	36300868	.	A	ATACG	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.066411;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:4,3:8,1
chr3	36533475	.	GTTT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.046664;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,7:6,6:3,1
chr3	38621506	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0056191;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:16,3:10,6
chr3	39571649	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:2,1:7,3
chr3	40426107	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0043505;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:7,6:2,1
chr3	42416008	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.082353;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,3:3,2:2,1
chr3	43903722	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.01463;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:6,7:5,1
chr3	44126691	.	G	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00014161;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:11,10:9,3
chr3	45068384	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00057944;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:14,7:10,5
chr3	45415809	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0063539;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:3,3:8,3
chr3	46207649	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.42424;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:6,2:3,1:3,1
chr3	46488434	.	G	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.015626;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:9,1:13,6
chr3	46759472	.	G	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:10,2:5,2
chr3	47241799	.	G	GTA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.021189;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:9,5:5,4
chr3	47897378	.	C	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00061829;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:11,4:15,9
chr3	48509583	.	CA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.02835;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:9,6:5,3
chr3	48554407	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=6.1955e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:28,16:21,10:7,6
chr3	48665989	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.11424;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:8,3:7,3
chr3	49295716	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.12591;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:18,2:9,2
chr3	49849845	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.035523;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:1,7:5,1
chr3	49881334	.	C	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00090214;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:17,3:10,5
chr3	50850218	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0018631;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:9,4:8,5
chr3	50948033	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.020315;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:2,7:11,3
chr3	51193800	.	T	TA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.1713;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:18,1:12,3
chr3	51249008	.	C	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.10755;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:15,3:8,1
chr3	52283819	.	TAA	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.041789;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:4,2:10,3
chr3	54141061	.	C	CTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.013369;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:2,6:0,3:2,3
chr3	54910793	.	A	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.013909;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:8,2:12,3
chr3	55549477	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.031702;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,6:0,2:2,4
chr3	55842076	.	G	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.028886;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:14,2:16,3
chr3	56032975	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.038416;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:15,4:6,1
chr3	56906975	.	A	ATT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.098383;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,5:8,4:1,1
chr3	58033635	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0039417;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:41,9:18,4:23,5
chr3	58328961	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:1,2:0,0:1,2
chr3	59215302	.	ATATAT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.094902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:10,4:12,1
chr3	59797192	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0054287;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:18,6:9,3
chr3	60038012	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0074978;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:19,4:11,4
chr3	60614820	.	G	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.12913;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,6:6,5:3,1
chr3	61600173	.	AAT	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.092437;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,5:2,4:5,1
chr3	65122609	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00064998;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:12,19:5,9:7,10
chr3	67947115	.	T	TTTTATTTATTTATTTATTTATTTA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.077195;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,5:10,3:8,2
chr3	68262307	.	GTATATATATATATATATA	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.29371;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:3,2:3,2
chr3	68461282	.	A	AAAAC	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.023384;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,7:5,5:4,2
chr3	69225519	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.015535;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,11:6,9:2,2
chr3	69242478	.	ATTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:6,3:2,2
chr3	69418822	.	A	ATGTG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.029963;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:5,6:10,4
chr3	71937988	.	C	CTGTG	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.015417;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:11,5:9,6
chr3	72633690	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0034744;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:17,6:10,8
chr3	73347437	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.16358;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:14,1:8,3
chr3	73534019	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0064143;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,9:19,5:16,4
chr3	74269048	.	G	GA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0043101;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,7:9,6:5,1
chr3	75096062	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.040085;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:5,4:5,1
chr3	75643476	.	C	T	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.046603;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:61,16:36,8:25,8
chr3	75785855	.	G	GA	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.039244;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:76,19:36,10:40,9
chr3	75811514	.	G	A	0	PASS	DP=138;GPV=1;SPV=0.037707;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:72,12:30,5:42,7
chr3	76425510	.	G	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.18176;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:11,1:11,3
chr3	76719798	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.020851;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:10,4:17,1
chr3	76811818	.	CTTCCTTCCTTCCTTCCTTCT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.016673;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:7,2:7,4
chr3	76834013	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.036896;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:10,10:2,3:8,7
chr3	77077386	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0004715;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:8,5:14,4
chr3	77323024	.	ATATAT	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.038499;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:28,8:19,4:9,4
chr3	78310768	.	GAAGA	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.014912;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,5:6,2:4,3
chr3	78388527	.	C	CATCTGCCTGTTACCCAGTTCCAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0090305;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:2,2:8,6
chr3	78407100	.	C	CAA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.054402;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:13,7:10,1
chr3	78711440	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:5,1:5,3
chr3	79221172	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.014256;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:17,3:15,4
chr3	79411983	.	G	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.070174;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:14,3:13,2
chr3	80015600	.	C	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.018088;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,13:2,10:7,3
chr3	80976113	.	A	AT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.03148;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,9:8,2:8,7
chr3	80976130	.	A	AT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.020128;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,7:6,2:4,5
chr3	83176263	.	T	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0003718;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:12,8:14,4
chr3	86335842	.	TTTTA	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.024474;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:7,3:21,6
chr3	86995549	.	A	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.27273;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,2:4,2:0,0
chr3	86995551	.	T	TAC	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.11905;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:2,3:2,2:0,1
chr3	87249132	.	C	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0027508;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:18,5:7,3
chr3	88009796	.	CA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.01497;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:9,6:1,3
chr3	88324586	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0016295;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:13,6:11,3
chr3	90140539	.	ATT	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:7,3:1,1
chr3	90792691	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.096637;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:0,1:24,3
chr3	90793168	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.044239;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:19,4:4,2
chr3	90794556	.	G	A	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.03166;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:74,12:39,9:35,3
chr3	90795159	.	G	C	0	PASS	DP=145;GPV=1;SPV=0.028927;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:70,8:62,4:8,4
chr3	90802407	.	G	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.070897;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:6,3:14,2
chr3	90806554	.	C	A	0	PASS	DP=161;GPV=1;SPV=0.014168;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:93:80,13:48,11:32,2
chr3	90807066	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.11288;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:0,0:32,4
chr3	90819164	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:9,4:0,0
chr3	90868586	.	C	G	0	PASS	DP=445;GPV=1;SPV=0.018445;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:227:186,34:130,24:56,10
chr3	90869777	.	A	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0071078;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,14:2,9:26,5
chr3	90889577	.	C	T	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.018335;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:65,20:12,9:53,11
chr3	90900435	.	G	A	0	PASS	DP=170;GPV=1;SPV=0.044262;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:81,9:15,2:66,7
chr3	90904126	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.026131;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:4,2:25,9
chr3	90939861	.	C	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.017899;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:24,7:7,2
chr3	90948616	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.044393;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:6,2:21,4
chr3	90988846	.	C	T	0	PASS	DP=758;GPV=1;SPV=0.02669;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:431:385,46:385,45:0,1
chr3	90999996	.	A	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.046078;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:43,11:15,3:28,8
chr3	91019218	.	C	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.043528;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,4:30,4:2,0
chr3	91063898	.	C	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.012749;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:5,5:2,1
chr3	91082603	.	GT	G	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.034533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:54,11:24,9:30,2
chr3	91082660	.	C	G	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0061213;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:45,9:15,7:30,2
chr3	91128600	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0031056;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:1,8:18,1
chr3	91141548	.	A	C	0	PASS	DP=155;GPV=1;SPV=0.03166;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:85,10:12,4:73,6
chr3	91179559	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.26429;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:31,4:2,0
chr3	91187298	.	A	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:0,0:13,4
chr3	91222727	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:1,0:10,4
chr3	91229920	.	G	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.065277;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:14,3:0,3
chr3	94740829	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00085567;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:11,2:11,8
chr3	95832587	.	T	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0074891;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:4,2:1,3
chr3	96005104	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.046272;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:10,8:16,1
chr3	96317750	.	G	GTTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.016795;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,7:7,4:4,3
chr3	97319442	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00059631;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:12,5:11,7
chr3	98538904	.	CTT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.098383;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:6,4:3,1
chr3	98838390	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.021576;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:5,4:10,5
chr3	99691705	.	A	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,12:4,6:4,6
chr3	103044860	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0048152;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:7,2:14,4
chr3	105280352	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.06057;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:10,2:11,3
chr3	105470134	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.020691;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:15,4:8,2
chr3	106707358	.	A	AT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.050426;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,5:5,3:8,2
chr3	106707369	.	T	TA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.06523;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:9,3:10,1
chr3	106875480	.	A	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.014512;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:18,3:13,4
chr3	108720876	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00089447;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:12,6:12,6
chr3	109317351	.	A	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.22636;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:11,3:11,1
chr3	111807946	.	GT	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.013238;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,8:9,4:1,4
chr3	114544406	.	CTTCT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.079329;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:3,2:7,4
chr3	116618234	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0015408;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:11,6:9,4
chr3	116760286	.	CAA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,5:3,4:3,1
chr3	117050840	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.22085;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:8,3:7,1
chr3	117634731	.	C	CTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.016617;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,11:6,5:5,6
chr3	118647946	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.020447;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:15,12:4,7:11,5
chr3	120151071	.	ATT	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.078283;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:9,4:19,3
chr3	121253810	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:2,3:2,4
chr3	121764195	.	A	AACACACACAC	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.041061;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,10:13,6:6,4
chr3	122009324	.	A	AACACACACACAC	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.020362;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,5:0,2:4,3
chr3	122145747	.	G	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00044867;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:9,6:9,4
chr3	124044897	.	C	CT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.011574;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,9:3,2:11,7
chr3	124495729	.	T	TAAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0071396;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:0,4:7,3
chr3	124668043	.	G	GAC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.020229;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,11:3,4:3,7
chr3	125813770	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00041251;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:13,7:8,3
chr3	126336272	.	A	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.087731;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:13,1:12,3
chr3	127184619	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0089538;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,9:16,4:14,5
chr3	127947372	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0058348;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:8,5:13,2
chr3	131586850	.	G	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.00065864;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:36,17:20,5:16,12
chr3	133003397	.	A	ATG	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.033935;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,9:9,6:6,3
chr3	133044974	.	T	TTC	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.029233;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:15,1:14,5
chr3	133091223	.	C	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00041251;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:12,7:9,3
chr3	133158465	.	TA	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0079864;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:9,19:6,13:3,6
chr3	133425913	.	G	GGGCAAGGGAA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:5,2:5,3
chr3	134321577	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0057971;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:2,3:5,3
chr3	134401573	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.18741;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:17,3:19,1
chr3	134858009	.	C	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.00021937;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:34,14:16,6:18,8
chr3	135253682	.	A	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:6,2:5,7
chr3	135390016	.	C	CA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.058582;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,6:13,4:15,2
chr3	136439389	.	GAC	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.010741;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:14,6:3,1
chr3	137135157	.	G	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.030261;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:43,8:18,2:25,6
chr3	140079750	.	C	CAAAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.14691;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:17,3:10,2
chr3	140513583	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.041958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,6:2,5:2,1
chr3	140654957	.	G	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0036574;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,12:17,5:17,7
chr3	143284404	.	A	AT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00073094;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:18,23:8,10:10,13
chr3	144954711	.	T	TTTTTTTG	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.013096;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,11:8,6:6,5
chr3	144955970	.	G	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0060655;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:8,3:16,6
chr3	147159575	.	G	GTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.027219;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,7:6,4:8,3
chr3	147859108	.	G	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0010857;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:15,3:11,6
chr3	148642510	.	C	CAAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.040129;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:20,15:10,13:10,2
chr3	148822292	.	CA	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.074323;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:23,7:8,5
chr3	149184023	.	TA	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.27273;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,2:2,1:2,1
chr3	149853455	.	GGAGAGAGAGA	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0061246;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,9:4,8:2,1
chr3	150028648	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.17909;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,5:11,3:8,2
chr3	150211910	.	A	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.15152;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:3,2:1,1:2,1
chr3	151031259	.	GAT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.20399;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:14,2:2,2
chr3	151072525	.	C	CT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0073228;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,11:9,5:5,6
chr3	151547425	.	T	TAC	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.031932;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:9,4:17,3
chr3	151547427	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.031946;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,8:7,5:11,3
chr3	151850080	.	GT	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00066677;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:21,20:11,12:10,8
chr3	152104773	.	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.021839;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:6,6:6,4
chr3	153009169	.	A	AAT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.020164;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,10:11,5:3,5
chr3	153520081	.	CT	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.084394;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:15,4:11,2
chr3	154618292	.	G	GAGAA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0085378;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,13:9,11:5,2
chr3	158758484	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0073874;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:13,4:18,5
chr3	158891833	.	G	GTGTGTATGTA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.010989;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,4:2,3:0,1
chr3	158923448	.	A	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0021714;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:43,13:22,5:21,8
chr3	159818570	.	G	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.015987;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:42,7:22,1:20,6
chr3	160906602	.	T	TAAAGAAAAAAAAGAAAAGA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.046809;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,10:10,6:18,4
chr3	161840354	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.02204;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:11,5:16,5
chr3	162199912	.	T	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.028261;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:4,5:5,1
chr3	162590763	.	TATACAC	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.083225;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:11,1:14,4
chr3	163402299	.	GTT	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.17207;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,6:16,4:7,2
chr3	163502562	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0090481;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:33,9:11,3:22,6
chr3	163604681	.	A	ATAT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.023188;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:7,14:4,8:3,6
chr3	164207930	.	T	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.16752;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:11,2:14,3
chr3	164363535	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.027191;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:9,6:4,5:5,1
chr3	164386069	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.042571;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:14,8:14,1
chr3	164537163	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,4:2,2:4,2
chr3	164604251	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0052479;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:20,5:11,2
chr3	165771059	.	A	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.066176;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:35,6:17,2:18,4
chr3	165883390	.	T	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=5.8703e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:13,7:9,8
chr3	166073224	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0030133;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:12,7:17,3
chr3	166106743	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0018733;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,15:4,11:2,4
chr3	167488145	.	A	AAC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0052134;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,12:7,9:7,3
chr3	168370031	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.033902;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:9,8:6,1
chr3	168578212	.	CATTT	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00014877;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:16,21:8,10:8,11
chr3	168830673	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.12152;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:22,3:17,2
chr3	169378591	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0041535;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,8:8,7:1,1
chr3	170140627	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.032608;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:10,6:7,8
chr3	170336573	.	TC	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.15679;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,4:16,1:7,3
chr3	170382413	.	A	AT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.001414;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,14:8,8:3,6
chr3	170577624	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.013014;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:7,6:3,1
chr3	171301124	.	A	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00053399;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,16:9,9:13,7
chr3	171310223	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.035434;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:8,2:11,2
chr3	171310226	.	A	ATATGACTCACAG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.041011;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,4:8,2:10,2
chr3	171310228	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.042521;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,4:9,2:11,2
chr3	172504674	.	CT	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0086143;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:20,17:7,9:13,8
chr3	172701449	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.010683;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:6,5:8,5
chr3	172797018	.	C	CTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0095255;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:11,11:10,3
chr3	173392472	.	C	CA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.016244;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,10:8,9:9,1
chr3	174090019	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.020202;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:13,5:19,4
chr3	174625059	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.091248;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:12,2:3,3
chr3	174698931	.	T	TTA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.032608;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:4,4:13,6
chr3	174698967	.	G	GTATATA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.032529;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:6,4:14,4
chr3	175061728	.	A	AATATATAT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0085423;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,10:10,7:6,3
chr3	175849410	.	C	CATATAT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.020362;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,5:2,4:2,1
chr3	176233797	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0070885;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:7,6:1,1
chr3	177312931	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,12:2,8:6,4
chr3	177819193	.	C	CT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0074752;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,9:3,6:3,3
chr3	177939576	.	A	AAG	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.039093;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:28,2:16,4
chr3	178163969	.	T	TA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.038251;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:15,6:6,5
chr3	178517187	.	CTGTG	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0023791;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:13,16:7,11:6,5
chr3	178568854	.	T	TA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,4:10,2:7,2
chr3	178757829	.	C	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.055901;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,2:3,2
chr3	178757830	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.12422;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:9,3:6,1:3,2
chr3	178838570	.	CA	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.034981;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,15:10,9:9,6
chr3	180248085	.	CTTCTT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.012898;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,9:6,6:7,3
chr3	180333476	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.041472;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:19,3:14,2
chr3	180873483	.	T	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.14912;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:17,2:15,2
chr3	181121602	.	G	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.00022269;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:33,18:12,13:21,5
chr3	181950827	.	C	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.11468;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:45,5:18,1:27,4
chr3	182590903	.	T	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.06044;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:15,2:14,2
chr3	183164314	.	G	GTTTTTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.007971;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:5,5:3,1
chr3	183321454	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.22736;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:10,1:21,3
chr3	183519895	.	CAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.20342;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:13,2:5,2
chr3	183622530	.	A	AAAGG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.2649;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,4:19,3:9,1
chr3	183957716	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.10745;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:12,2:15,2
chr3	184500646	.	A	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0046257;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:45,12:17,7:28,5
chr3	185875280	.	G	GTA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.015957;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:12,7:12,3
chr3	185912906	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00034897;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,14:10,8:4,6
chr3	186995505	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.01971;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:8,7:2,1
chr3	187268547	.	AAT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.067038;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:11,2:7,3
chr3	187573591	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.008152;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:44,14:20,6:24,8
chr3	188182772	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.046124;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,13:8,11:12,2
chr3	189483916	.	G	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.00034436;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,12:11,7:23,5
chr3	189697231	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.036146;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:10,5:3,5
chr3	189942884	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0030392;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,12:15,7:19,5
chr3	190489200	.	TCTTCCTTCCTTCCTTCCTCTCTTC	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.032647;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:2,1:6,9
chr3	191216854	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.017938;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:14,2:14,4
chr3	191619293	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.040043;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:29:1,5:1,3:0,2
chr3	192158675	.	T	TCC	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.015152;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:0,4:0,1:0,3
chr3	193418065	.	T	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0070131;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,15:5,6:6,9
chr3	194143191	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.016203;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:9,7:6,1
chr3	194324950	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.22386;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,5:7,4:13,1
chr3	194526987	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.090728;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:18,2:3,4
chr3	194846551	.	TGAA	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.055365;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,7:30,5:11,2
chr3	195067358	.	A	ACCTC	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0088119;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,12:5,8:9,4
chr3	195483671	.	C	T	0	PASS	DP=230;GPV=1;SPV=0.0063764;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:156:128,28:60,12:68,16
chr3	195491737	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.067189;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:11,3:19,3
chr3	195502702	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.10544;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:15,1:13,3
chr3	195502739	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.095104;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:15,1:15,3
chr3	195661457	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.25076;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:19,3:10,1
chr3	195667466	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.10935;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:14,1:10,4
chr3	195750391	.	AGGCCT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0069124;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:9,7:5,3
chr3	195786809	.	A	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=9.7816e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,13:7,7:4,6
chr3	195812455	.	C	CTCAGTG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.079112;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:10,1:9,3
chr3	195866336	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00086166;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:15,8:13,5
chr3	196462980	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0070913;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,10:4,3:2,7
chr3	196973207	.	T	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.13598;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,6:15,2:12,4
chr3	197513494	.	A	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.045056;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:35,6:17,4:18,2
chr3	197617964	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.076398;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:47,6:13,1:34,5
chr3	197630964	.	G	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.072974;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:45,5:25,3:20,2
chr3	198099324	.	C	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:3,2:2,2
chr4	1641147	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:11,2:12,3
chr4	1690259	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.1056;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:16,4:11,1
chr4	3522099	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=7.9857e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:14,9:10,4
chr4	4065631	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0094013;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:9,4:8,2
chr4	4891540	.	G	GGT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.034533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:5,12:4,3:1,9
chr4	5762728	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.04958;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:2,2:7,4
chr4	6012995	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0003546;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:36,14:19,7:17,7
chr4	7895852	.	G	GTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0058007;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,9:1,8:2,1
chr4	8919107	.	TC	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.071818;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:13,1:9,5
chr4	9245168	.	G	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.14664;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:0,0:30,4
chr4	9253009	.	T	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:1,1:5,1
chr4	10096558	.	CACTACGA	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0068367;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:9,5:19,3
chr4	10380072	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.04522;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:16,4:5,2
chr4	10894438	.	A	ATGTGTGTG	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.069881;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,6:6,5:5,1
chr4	16303360	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:11,2:6,2
chr4	17459743	.	C	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0094928;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:12,5:12,7
chr4	18140794	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00034731;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:6,4:11,5
chr4	18384018	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:36:1,4:1,2:0,2
chr4	18837294	.	C	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:2,3:0,1:2,2
chr4	18851445	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0030535;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:7,1:15,7
chr4	19416219	.	T	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.0076904;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:35,8:19,6:16,2
chr4	21534948	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.013492;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:18,5:12,5
chr4	23721457	.	T	TG	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.046407;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,6:4,1:3,5
chr4	23859780	.	CAAAATAAAATAAAATAAAAT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.20158;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,5:5,2:8,3
chr4	24387746	.	AAGAG	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:5,2:11,2
chr4	24416559	.	G	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.00073216;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:31,13:14,3:17,10
chr4	24503955	.	A	C	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.016099;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:42,6:16,3:26,3
chr4	25612012	.	C	CA	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:4,1:1,1
chr4	26028535	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1184;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:1,3:15,1
chr4	26153944	.	T	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00088132;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:7,6:11,3
chr4	26244403	.	ATG	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.034438;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:11,4:3,4
chr4	27930275	.	A	ATTTTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.018404;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:5,3:6,2
chr4	29338563	.	T	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0020609;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:18,7:12,4
chr4	29990623	.	A	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0049228;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:8,5:11,3
chr4	30265706	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00014298;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,15:16,7:10,8
chr4	30545108	.	ATT	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.014318;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,9:11,4:2,5
chr4	30969410	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=4.5431e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:11,21:5,10:6,11
chr4	32619397	.	TTA	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00064391;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:17,19:10,9:7,10
chr4	32868624	.	A	AT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.009581;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,8:6,3:5,5
chr4	32870349	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0064316;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:18,3:15,4
chr4	33477438	.	C	CT	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.11157;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,5:12,2:25,3
chr4	36484889	.	AATATATATTAGTTTATATATATAAT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.1733;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:9,2:14,2
chr4	37667875	.	C	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00037684;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:11,17:5,7:6,10
chr4	37717454	.	G	GA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.02381;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:0,4:0,4:0,0
chr4	37846536	.	C	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00041007;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:31,13:17,8:14,5
chr4	40440334	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0051054;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:10,3:11,4
chr4	40536472	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.008555;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:16,1:7,5
chr4	41688196	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.1174;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:14,2:16,2
chr4	42269487	.	AT	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.060606;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,3:2,1:0,2
chr4	44068258	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0050026;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:33,11:17,6:16,5
chr4	45463386	.	G	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0007185;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:9,8:15,4
chr4	46482995	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0010272;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:11,8:8,2
chr4	46880412	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.016783;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,6:1,5:2,1
chr4	47607316	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.010694;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:13,3:11,3
chr4	48206777	.	CAAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.036896;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:7,7:3,2
chr4	48663336	.	AT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.16591;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:13,3:11,1
chr4	49106475	.	T	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.06273;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:46,6:18,3:28,3
chr4	49143684	.	A	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.021804;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:14,4:11,4
chr4	49146153	.	T	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.037765;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,6:8,1:12,5
chr4	49154652	.	ATTCCATTCCATTCCG	A	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.0046134;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:51,12:22,4:29,8
chr4	49176935	.	C	T	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.0016415;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:57,23:28,9:29,14
chr4	49189440	.	A	G	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.04566;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:93:79,14:43,5:36,9
chr4	49189600	.	T	A	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.043504;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:62,7:21,3:41,4
chr4	49191971	.	T	C	0	PASS	DP=170;GPV=1;SPV=0.011176;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:76,11:41,8:35,3
chr4	49247362	.	A	C	0	PASS	DP=436;GPV=1;SPV=0.015707;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:240:213,27:110,14:103,13
chr4	49247728	.	G	T	0	PASS	DP=283;GPV=1;SPV=0.044397;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:157:130,27:43,7:87,20
chr4	49251622	.	G	T	0	PASS	DP=431;GPV=1;SPV=0.043034;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:233:201,32:106,16:95,16
chr4	49258258	.	G	C	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.045994;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:61,8:35,3:26,5
chr4	49262059	.	G	T	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.046309;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:59,9:37,1:22,8
chr4	49262142	.	C	G	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.037371;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:62,10:35,2:27,8
chr4	49266887	.	A	T	0	PASS	DP=165;GPV=1;SPV=0.036057;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:69,9:31,7:38,2
chr4	49271516	.	C	A	0	PASS	DP=514;GPV=1;SPV=0.04954;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:299:264,35:103,19:161,16
chr4	49272320	.	CAG	C	0	PASS	DP=318;GPV=1;SPV=0.020118;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:175:149,26:92,18:57,8
chr4	49273776	.	A	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:0,0:12,4
chr4	49499983	.	T	A	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.024194;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:76,9:34,2:42,7
chr4	49528367	.	C	G	0	PASS	DP=167;GPV=1;SPV=0.008798;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:75,20:42,11:33,9
chr4	49528580	.	C	T	0	PASS	DP=152;GPV=1;SPV=0.016846;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:71,17:38,8:33,9
chr4	49536801	.	C	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.079421;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:25,3:16,2
chr4	49537004	.	A	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.044663;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:27,4:6,1
chr4	49539589	.	G	T	0	PASS	DP=253;GPV=1;SPV=0.012202;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:133:108,25:32,6:76,19
chr4	49542594	.	T	A	0	PASS	DP=341;GPV=1;SPV=0.028817;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:167:148,19:111,14:37,5
chr4	49556231	.	G	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.023936;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:41,10:21,6:20,4
chr4	49564230	.	C	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.023277;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:39,9:17,6:22,3
chr4	49577931	.	G	A	0	PASS	DP=483;GPV=1;SPV=0.016158;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:271:243,28:118,13:125,15
chr4	49623865	.	T	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.01036;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:18,5:15,2
chr4	49623899	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.040811;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,4:16,2:15,2
chr4	49769446	.	A	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.14763;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:17,3:5,1
chr4	49792161	.	T	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:5,3:0,0
chr4	49811692	.	A	G	0	PASS	DP=140;GPV=1;SPV=0.007853;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:70,8:16,4:54,4
chr4	49851853	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.059824;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:10,1:12,3
chr4	50070268	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.053977;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:3,2:13,3
chr4	50396563	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.049522;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:2,0:25,4
chr4	50500851	.	C	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.042772;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:6,5:8,1
chr4	51168884	.	AT	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:4,2:8,2
chr4	51168890	.	A	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.20468;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:5,2:9,2
chr4	51299531	.	C	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.17496;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:25,4:0,0
chr4	51800205	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.027526;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:42,9:21,1:21,8
chr4	51805358	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.091638;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:31,4:2,0
chr4	51869177	.	T	TA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0065088;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:4,7:5,5
chr4	52529341	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=5.4898e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,15:12,11:14,4
chr4	52805823	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00037903;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:9,6:12,7
chr4	54390724	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0025244;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:11,2:17,7
chr4	54896152	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0022419;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:7,6:15,1
chr4	55535739	.	C	CTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,3:3,1
chr4	57299586	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.18293;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:16,3:8,1
chr4	57299587	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.15645;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:18,4:8,1
chr4	58068918	.	C	CTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.017534;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:2,9:0,8:2,1
chr4	58641958	.	A	ATTTTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.020229;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,11:4,5:2,6
chr4	58875435	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.18293;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:16,3:8,1
chr4	60180653	.	T	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.021244;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:19,5:8,4
chr4	61040718	.	A	AAG	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.16176;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,4:4,2:4,2
chr4	62942582	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0083613;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:9,4:13,2
chr4	63780494	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.00051624;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:10,4:17,5
chr4	64291817	.	A	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0046664;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:12,2:11,5
chr4	64834601	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.096892;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:12,2:7,2
chr4	65170525	.	A	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0031867;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:17,3:15,7
chr4	65536762	.	AT	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.01326;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:13,2:12,4
chr4	65867467	.	C	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.017857;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:0,5:0,4:0,1
chr4	66225901	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0022875;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:7,7:15,1
chr4	66922720	.	CAAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,4:7,3:5,1
chr4	66954819	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=2.0129e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,13:7,9:6,4
chr4	67112889	.	T	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.02659;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:10,4:15,7
chr4	68374231	.	A	AT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.00061425;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,9:5,6:6,3
chr4	68708239	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0072434;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:10,1:15,7
chr4	69762151	.	C	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.051532;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:13,6:21,1
chr4	69762168	.	AC	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.16752;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:12,4:13,1
chr4	72935056	.	A	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.011854;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:11,4:10,3
chr4	73199221	.	CTG	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0022326;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,14:7,9:6,5
chr4	74778829	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0089809;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:4,3:14,4
chr4	74866501	.	T	TTG	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0065359;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:3,10:1,5:2,5
chr4	74876177	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0051097;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:8,5:12,1
chr4	75444380	.	A	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.012154;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:9,4:19,3
chr4	76667972	.	A	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.35897;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,2:3,1:3,1
chr4	79035584	.	G	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.010612;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:13,2:7,3
chr4	79919865	.	TTA	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.27778;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,2:2,1:1,1
chr4	80390934	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.040221;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:9,3:13,3
chr4	80390952	.	CATGTAT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,7:3,3:4,4
chr4	80725111	.	AT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,4:3,3:6,1
chr4	80847514	.	G	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0023811;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:35,12:16,4:19,8
chr4	81944595	.	A	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.057471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:4,2:7,2
chr4	84413977	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=7.9781e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:11,8:10,6
chr4	84695509	.	T	TAG	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.020979;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,4:1,3:1,1
chr4	84909029	.	T	TAC	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0044537;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:9,10:13,7
chr4	85227114	.	GAA	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0047113;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,9:4,8:1,1
chr4	85839849	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.07699;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:8,2:7,3
chr4	86191591	.	T	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0021672;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:2,11:1,2:1,9
chr4	87354111	.	C	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0002635;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:12,17:7,13:5,4
chr4	87602062	.	G	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00017769;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,13:13,8:9,5
chr4	88325476	.	A	AACACACACACACACAC	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:5,4:3,3
chr4	90548727	.	G	GAT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0065711;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:8,8:5,4
chr4	92874787	.	C	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.01289;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:13,1:10,4
chr4	93398129	.	G	GTGTGTGTGTGTGTA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0070449;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,10:4,4:6,6
chr4	94516508	.	GTCTCTC	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0042182;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,14:9,6:5,8
chr4	94659494	.	ATG	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.037926;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:4,10:2,7:2,3
chr4	94686504	.	TGA	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:13,1:2,3
chr4	95617505	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.033048;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:37,8:9,6:28,2
chr4	96073939	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.00062529;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:16,6:19,5
chr4	96169856	.	TTA	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.024399;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:4,4:14,3
chr4	96173079	.	C	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0010058;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:29,13:17,7:12,6
chr4	96870642	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0055489;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:8,10:7,3
chr4	96871087	.	A	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.18479;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:7,4:10,1
chr4	97246408	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.002981;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,11:5,8:1,3
chr4	97722964	.	ATT	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0018191;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:8,6:5,3
chr4	97738044	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0050026;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:33,11:21,4:12,7
chr4	98485803	.	A	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.035523;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:4,4:2,4
chr4	101958464	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.048122;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:3,5:4,3
chr4	102539236	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.046407;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,6:5,4:2,2
chr4	103577197	.	CTCTT	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.009884;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:4,1:16,7
chr4	104085363	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.072765;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:12,1:5,3
chr4	104689672	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.016449;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,16:13,5:5,11
chr4	106340393	.	G	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.010547;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:41,11:21,4:20,7
chr4	106340394	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0090402;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:41,11:23,4:18,7
chr4	108099550	.	GTGTGTA	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.018146;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:5,4:8,3
chr4	108099560	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:5,2:8,2
chr4	108807819	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,1:6,3
chr4	109489638	.	TA	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.092902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:11,1:14,4
chr4	109569497	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.040508;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,10:7,3:9,7
chr4	109656379	.	TTTTTTTTTTTTTTG	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.031623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:5,3:2,3
chr4	109947819	.	G	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.00040854;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:9,5:22,6
chr4	109968707	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.18558;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:14,3:16,1
chr4	110127406	.	C	CAAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.01286;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,10:13,9:2,1
chr4	110621822	.	A	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.17857;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:2,3:0,1:2,2
chr4	111054977	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.079663;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:19,2:16,3
chr4	111718414	.	T	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.00058795;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:37,14:11,10:26,4
chr4	111946369	.	GA	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0094549;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:9,6:2,1
chr4	112874080	.	C	CT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:3,8:3,2
chr4	113036251	.	T	TA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00035427;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,19:8,9:6,10
chr4	113490926	.	G	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.045213;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:12,3:10,6
chr4	114363005	.	T	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:39:0,2:0,1:0,1
chr4	114722013	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.073064;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:14,4:13,3
chr4	114914907	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00097763;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:11,9:15,4
chr4	117280895	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.11319;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:15,2:9,4
chr4	118299794	.	T	TA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.044583;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:9,6:5,1
chr4	118299812	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.014137;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:9,5:6,1
chr4	118566690	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.14148;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:43,5:19,2:24,3
chr4	119065816	.	A	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.029631;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,12:19,3:22,9
chr4	119278889	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.024163;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:8,4:2,3
chr4	119380045	.	ATGTGTG	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0016056;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:12,6:7,12
chr4	121241245	.	GATATAT	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,6:4,5:1,1
chr4	122262148	.	T	TTGTGTGTG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0031331;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:7,17:2,10:5,7
chr4	122659627	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.027077;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:6,8:4,1
chr4	123101433	.	G	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.002347;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:19,3:12,8
chr4	124860352	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=4.1153e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:27,25:12,13:15,12
chr4	125873987	.	C	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=3.4736e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,15:7,4:20,11
chr4	125977342	.	GT	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:10,2:5,2
chr4	127022288	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0039729;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:8,2:10,11
chr4	127584099	.	T	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.097639;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:22,1:21,5
chr4	128391550	.	TTCTCAGCATC	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0013772;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:6,7:3,5
chr4	129093245	.	C	G	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.0002415;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:42,17:21,7:21,10
chr4	129508436	.	G	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=3.2196e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,16:10,11:15,5
chr4	130548217	.	G	GA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.19203;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:17,2:6,2
chr4	130999757	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,5:7,2:5,3
chr4	131382119	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.057437;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:14,4:17,2
chr4	131601676	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0011236;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,15:10,8:2,7
chr4	131739922	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.07595;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,7:18,6:23,1
chr4	132254108	.	G	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.0011222;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:44,14:22,3:22,11
chr4	133188665	.	G	GT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.20626;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:15,2:9,3
chr4	133465011	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.003755;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:8,7:18,4
chr4	133709434	.	CTT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.065637;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:5,2:11,2
chr4	134314408	.	CAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.014757;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,7:4,6:2,1
chr4	134476372	.	CT	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0018803;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,9:8,6:6,3
chr4	135175844	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=4.2369e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:24,21:16,12:8,9
chr4	135338205	.	T	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.00090248;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:42,14:27,7:15,7
chr4	135389840	.	A	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0042224;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:16,8:9,4
chr4	136581756	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,4:2,3:12,1
chr4	137476829	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00030915;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,16:9,5:12,11
chr4	137988192	.	G	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.21212;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:4,4:2,1:2,3
chr4	138691868	.	ATGTT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,4:1,1:5,3
chr4	139294019	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=9.5813e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:9,22:2,12:7,10
chr4	140482716	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=1.1051e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:19,20:14,10:5,10
chr4	140509727	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=8.8502e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:25,19:15,11:10,8
chr4	141195113	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0074013;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:21,8:10,2
chr4	141365380	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.23136;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:26,3:10,1
chr4	141367006	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.055478;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,6:9,3:7,3
chr4	141447702	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.085652;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:22,2:16,3
chr4	141531350	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.045818;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:17,16:12,8:5,8
chr4	142185400	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.26323;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:11,2:22,3
chr4	142270933	.	T	TTG	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00060741;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:18,21:12,11:6,10
chr4	142658636	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=1.6244e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:26,25:14,12:12,13
chr4	143691301	.	G	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.015768;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:13,3:18,6
chr4	143792778	.	GTTT	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.012898;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:13,5:0,4
chr4	143884845	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.26692;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:13,3:5,1
chr4	144367898	.	T	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.063391;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:24,6:14,2:10,4
chr4	144396265	.	GACTTCAAACTATACTACAAGACTA	G	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.014917;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,7:22,5:19,2
chr4	145471093	.	CATATAT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.27778;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,2:3,2:0,0
chr4	145514483	.	A	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.043968;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:39,6:14,3:25,3
chr4	145693666	.	A	AC	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.020898;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:0,1:4,5
chr4	146128392	.	T	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.016381;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:16,3:18,7
chr4	147095728	.	C	CGT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:10,2:5,2
chr4	147378325	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=2.4608e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:10,6:6,9
chr4	149160054	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.03902;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:37,6:19,3:18,3
chr4	150112825	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0005865;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:2,11:0,4:2,7
chr4	151435784	.	CAAA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.024875;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,10:11,4:4,6
chr4	152377598	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.022117;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:10,11:7,2
chr4	152804089	.	C	CAT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.019565;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:2,2:6,3
chr4	153203103	.	CAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0050173;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:13,15:10,7:3,8
chr4	153387688	.	C	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.040545;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:46,7:20,1:26,6
chr4	153470210	.	CTGCAAAGTCTGGGGAATTATGG	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.030384;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:16,4:16,2
chr4	153480517	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.20342;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,4:11,3:7,1
chr4	154284194	.	T	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00025351;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:12,9:15,4
chr4	154690631	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.026404;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:13,5:16,1
chr4	157780889	.	G	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.11642;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:21,3:15,3
chr4	158105035	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.048872;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:8,5:3,3:5,2
chr4	158435477	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:4,1:8,3
chr4	159072451	.	CTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.18447;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,4:5,3:4,1
chr4	160299963	.	T	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.026663;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:45,10:22,5:23,5
chr4	160619682	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0087719;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:15,7:16,3
chr4	161036076	.	TTTC	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.12121;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:3,3:2,1:1,2
chr4	162279281	.	T	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.080505;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:12,1:22,3
chr4	162453398	.	A	ATATATATGC	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.049459;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:23,2:9,5
chr4	162571965	.	A	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.00019467;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:33,16:10,8:23,8
chr4	162594584	.	A	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.54715;SS=2;SSC=2;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:16,4:4,3:12,1
chr4	163238160	.	T	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.00040665;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:10,8:23,4
chr4	163894907	.	A	ACACG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:26:0,2:0,2:0,0
chr4	165238781	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.061837;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:22,1:18,4
chr4	165481016	.	AT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0014462;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:11,17:6,8:5,9
chr4	168113386	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.16157;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:24,5:12,1
chr4	168165391	.	A	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:1,2:1,2:0,0
chr4	168520347	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.043687;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:9,3:10,11
chr4	168680481	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.028934;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,9:13,8:3,1
chr4	168704664	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0401;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:6,5:4,3
chr4	168878682	.	T	TTG	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0057971;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:6,5:2,3
chr4	169016051	.	ATCTCTCTCTC	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.023788;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,8:1,4:8,4
chr4	169283846	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.011513;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:13,7:19,3
chr4	169337332	.	G	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=4.7151e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:26,24:14,9:12,15
chr4	169922477	.	C	CT	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.067671;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:17,3:18,1
chr4	170573022	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.10277;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:11,5:6,1:5,4
chr4	171410940	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0076774;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,14:3,9:12,5
chr4	171423511	.	G	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0057828;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:16,1:15,7
chr4	172085080	.	A	AATACAT	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=8.8502e-06;SS=2;SSC=50;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:25,19:10,12:15,7
chr4	172487367	.	C	CTTCTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.060124;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,5:2,3:11,2
chr4	172887682	.	G	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=4.7666e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:28,24:14,11:14,13
chr4	173022078	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.12418;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:11,1:7,3
chr4	173074876	.	AG	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.1713;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:11,2:19,2
chr4	173799232	.	CTCTCTTTCTT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:2,2:7,3
chr4	174007990	.	G	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=8.4559e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:34,21:21,10:13,11
chr4	174544193	.	G	GAAGAAAGAAAGAAAGA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.11479;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:18,1:6,3
chr4	174788590	.	T	TAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.024017;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,11:5,8:3,3
chr4	175564011	.	T	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=1.2509e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:24,24:13,15:11,9
chr4	177349034	.	A	ATT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.008413;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:4,11:2,8:2,3
chr4	178395316	.	A	AAT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.028014;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,8:9,7:8,1
chr4	178395352	.	A	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.00048402;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:12,16:6,6:6,10
chr4	178691496	.	CA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.036129;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,9:11,7:3,2
chr4	179037015	.	ATTGTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:7,1:5,3
chr4	179924448	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=1.7081e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:26,26:17,15:9,11
chr4	180257232	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.023519;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:21,3:16,4
chr4	180278694	.	G	GA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0013083;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:10,16:9,16:1,0
chr4	180401541	.	G	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,5:3,1:6,4
chr4	180639435	.	C	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.035616;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:14,3:21,2
chr4	180721638	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.014917;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:10,4:8,3
chr4	181641760	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0037594;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:3,10:1,8:2,2
chr4	181746053	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=2.0181e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,14:8,7:4,7
chr4	182100646	.	T	TATACAC	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.047515;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,10:12,5:8,5
chr4	183487423	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:8,3:2,1
chr4	184132818	.	TACAC	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.1268;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:19,2:17,2
chr4	184372964	.	T	TTA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10283;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:11,1:6,6
chr4	184430283	.	TGTCTGGCCCAGCCTTTTCCTTGTATGCCTCCTGCA	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.060413;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:9,2:8,3
chr4	184480460	.	A	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.055176;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,8:13,6:17,2
chr4	184546648	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10283;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:16,6:1,1
chr4	185124123	.	T	TTGTGTGTG	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0056141;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:25,18:9,9:16,9
chr4	185157455	.	CA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.023323;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:5,9:9,2
chr4	185433419	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.18479;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,5:10,2:7,3
chr4	185487365	.	GC	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00044052;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:19,21:9,9:10,12
chr4	185536811	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.16725;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:10,7:7,5:3,2
chr4	185796509	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.19619;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:12,4:24,1
chr4	185926555	.	G	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.056428;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:21,6:11,2:10,4
chr4	186466671	.	T	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.18072;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:20,3:15,1
chr4	187906580	.	C	CAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.028014;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,8:14,7:3,1
chr4	188023604	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.030216;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,1:8,3
chr4	188325903	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:8,1:15,4
chr4	188411557	.	TGA	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.13842;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:16,3:5,1
chr4	188604588	.	AGAT	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0073681;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:11,6:10,9
chr4	189578190	.	A	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0022098;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:33,14:13,9:20,5
chr4	189686266	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14178;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:7,4:11,1
chr5	302652	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.00072987;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,12:10,7:1,5
chr5	426881	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:4,1:2,1
chr5	434455	.	TGAAAACAGAGCCAGACTCTC	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0005395;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:35,12:15,6:20,6
chr5	434478	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.00075349;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:40,12:17,6:23,6
chr5	484383	.	G	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.022704;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:1,1:5,4
chr5	658645	.	ATTTTTTTTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10277;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:9,4:2,1
chr5	1061521	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.027042;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:5,4:7,2
chr5	1379965	.	A	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0053746;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:4,5:6,5
chr5	1867380	.	T	TG	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,4:2,4:0,0
chr5	3492742	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0058302;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:14,3:11,6
chr5	3761401	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.058905;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:5,1:11,3
chr5	4095577	.	T	TTC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030499;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:4,1:7,5
chr5	4095578	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.041466;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:2,1:8,5
chr5	5385200	.	C	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=1.9475e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:26,16:11,10:15,6
chr5	5725921	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00033318;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:10,7:10,3
chr5	6185027	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.052107;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:8,3:4,2
chr5	6367923	.	TGA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.097916;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:10,4:4,1
chr5	6816160	.	C	CTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.041958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,5:2,4:2,1
chr5	7143259	.	G	GTGTGTATATATA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.13115;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:8,3:15,2
chr5	7589498	.	G	GAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.20553;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,4:11,4:1,0
chr5	8720398	.	C	CA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:9,4:1,0
chr5	8746665	.	A	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:4,2:3,1:1,1
chr5	8972532	.	T	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.014208;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:16,5:10,2
chr5	9593951	.	G	GTATATATATATATATATATA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.12238;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,6:2,5:2,1
chr5	9929839	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0019458;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:14,4:13,6
chr5	9953576	.	C	CATATATATATAT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0047113;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,11:1,8:4,3
chr5	10418381	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.026469;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,7:12,5:2,2
chr5	10638985	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.15773;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:7,2:11,2
chr5	11771192	.	C	CTTTTTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.021739;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,11:6,9:3,2
chr5	11776456	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00039776;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:7,5:7,4
chr5	11864540	.	G	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0070909;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:13,4:7,2
chr5	13798739	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0034395;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,9:9,4:9,5
chr5	14812120	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:5,2:4,1:1,1
chr5	15309583	.	GAA	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.15847;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:20,1:4,4
chr5	15715489	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0028043;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,12:9,11:2,1
chr5	16662316	.	A	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.042986;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,5:2,2:1,3
chr5	17965702	.	CATATATATATAT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.097902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,5:3,4:1,1
chr5	18046470	.	TTA	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.10919;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:16,1:11,7
chr5	18444169	.	CATGTATATATACACACATACACATAT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:4,1:16,3
chr5	19177693	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0085139;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,10:3,4:2,6
chr5	19392403	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=2.5801e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:6,5:9,8
chr5	19917432	.	T	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.019651;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:12,3:6,2
chr5	20617230	.	G	GAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0087567;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,8:5,5:1,3
chr5	20755141	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.057471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:3,3:8,1
chr5	20757924	.	C	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.030818;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:15,3:18,4
chr5	20865871	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.048994;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:4,3:10,2
chr5	21211538	.	T	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0136;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:12,2:18,4
chr5	22999419	.	C	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0020064;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:8,6:10,4
chr5	23118340	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.049017;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,6:4,2:5,4
chr5	23671914	.	ATT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:6,1:7,3
chr5	23988366	.	A	ATTCT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.15033;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,4:6,3:13,1
chr5	24459502	.	A	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.008739;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:9,2:15,4
chr5	24465506	.	A	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=2.2669e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:17,7:9,7
chr5	24560220	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.064743;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:12,3:12,1
chr5	24626897	.	T	TAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.17768;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:11,3:18,1
chr5	24929831	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0036796;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:7,4:16,3
chr5	26090026	.	C	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0001506;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:12,8:10,3
chr5	26479675	.	C	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.081606;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:25,2:12,3
chr5	26564815	.	C	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0018443;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:5,3:10,6
chr5	28107717	.	TTATATATA	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.034533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:3,4:2,1
chr5	28581865	.	T	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0019152;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:17,3:12,6
chr5	28818454	.	A	AG	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:8,2:4,2
chr5	28929068	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00014246;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,13:4,5:9,8
chr5	28975244	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00024975;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:12,4:4,4
chr5	29032844	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.023889;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:17,5:12,1
chr5	29403167	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=9.4662e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:10,4:13,8
chr5	29837121	.	T	TCTCTCTCTCTTTC	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:0,2:0,0:0,2
chr5	29927548	.	AGTGTGTGT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.037533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:11,14:7,9:4,5
chr5	30353234	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11664;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:12,2:13,3
chr5	30490627	.	G	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.14851;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:17,2:10,2
chr5	31293367	.	A	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.12943;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:16,3:16,1
chr5	31578439	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:5,2:7,2
chr5	31776626	.	T	TTTTATTTA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.034267;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,10:8,5:11,5
chr5	33123422	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0045179;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:4,8:5,3
chr5	34251894	.	A	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:1,3:1,1:0,2
chr5	36171226	.	C	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0037034;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:36,13:18,7:18,6
chr5	36322184	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.015172;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:3,5:4,1
chr5	37373706	.	A	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.46667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,2:4,1:1,1
chr5	37874339	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.099099;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,4:11,1:7,3
chr5	37964914	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0022018;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:12,4:15,5
chr5	39619776	.	TTTC	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.21118;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:11,3:16,1
chr5	39967650	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.015561;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:4,7:5,1
chr5	40018312	.	GTGGGACCTTTGGGACCAGATAGTAGAACAT	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.013486;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:10,6:12,6
chr5	40968559	.	ATATATATTT	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,2:3,1:1,1
chr5	42962772	.	T	TGAGAGAGAGAGAGA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.14971;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:11,3:14,4
chr5	43273910	.	GTGTTTATCTTTT	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00046879;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:12,5:14,6
chr5	44196047	.	G	GA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0047113;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,9:4,6:1,3
chr5	44377438	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00021022;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:12,6:9,4
chr5	44852745	.	C	CAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.023031;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:9,7:5,1
chr5	45031943	.	CTTTGTAAT	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.02029;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:9,4:16,2
chr5	46366052	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0080354;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:13,7:16,2
chr5	46648697	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.19386;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:25,1:10,3
chr5	46708068	.	T	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:10,4:0,0
chr5	47074114	.	A	C	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,4:0,0
chr5	47100917	.	T	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=8.135e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:28,17:17,7:11,10
chr5	47129394	.	A	G	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.042795;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:66,9:11,1:55,8
chr5	47130262	.	A	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:4,2:9,2
chr5	47136617	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.053471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:0,0:17,4
chr5	47296981	.	A	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.027952;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:1,1:32,11
chr5	49622546	.	A	G	0	PASS	DP=290;GPV=1;SPV=0.04415;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:151:127,24:50,18:77,6
chr5	49666505	.	A	G	0	PASS	DP=514;GPV=1;SPV=0.033824;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:269:231,38:138,19:93,19
chr5	50114336	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.079987;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:28,4:1,1
chr5	50114341	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.045693;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:24,4:0,1
chr5	50137140	.	G	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.10523;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:15,2:9,2
chr5	50140793	.	A	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.017008;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,9:28,4:7,5
chr5	51400213	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,4:2,1:7,3
chr5	51414171	.	A	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.044512;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:16,1:10,5
chr5	52872566	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.038306;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:6,4:10,2
chr5	53458614	.	G	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0048811;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:13,2:7,6
chr5	54474179	.	T	TTCTG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0012329;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:6,4:11,7
chr5	56115212	.	AAT	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.070922;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:11,2:10,2
chr5	58870530	.	A	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0050994;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:14,7:15,2
chr5	59795974	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00012605;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:29,15:13,7:16,8
chr5	60613826	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.047147;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:8,2:14,3
chr5	62224050	.	AGAGTGTGTGT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:7,2:2,2
chr5	62248035	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.045245;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:19,2:12,6
chr5	62441496	.	CTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:4,7:5,4
chr5	62533215	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.14143;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,4:6,3:9,1
chr5	64862369	.	A	AAAAC	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00051119;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:15,18:5,14:10,4
chr5	65271376	.	TA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.014832;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:3,7:5,3
chr5	65898796	.	TTTCTC	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.032155;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:10,1:10,8
chr5	67116208	.	GT	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.052464;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:9,1:8,4
chr5	67958371	.	AACACACACACACAC	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.035837;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:8,6:3,1
chr5	68303425	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0013501;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,9:9,7:2,2
chr5	69164026	.	AATAT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,5:2,2:3,3
chr5	70219857	.	G	A	0	PASS	DP=563;GPV=1;SPV=0.019992;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:305:273,32:178,21:95,11
chr5	70427617	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12093;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:11,3:7,2
chr5	74925221	.	TG	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.012101;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:10,5:4,7
chr5	77816249	.	G	GA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0072464;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:7,6:1,1
chr5	78279850	.	A	AATAT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.11479;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:12,3:12,1
chr5	78279867	.	AAT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.067038;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:9,4:9,1
chr5	80035844	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.068498;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:16,2:14,2
chr5	80505749	.	A	ATT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10784;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,4:2,2:5,2
chr5	81116837	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0045171;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:13,4:15,5
chr5	81737787	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.052666;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:17,4:4,3
chr5	82370810	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.1672;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:22,2:11,2
chr5	84864162	.	AT	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.04073;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:22,7:9,3:13,4
chr5	85131821	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00089348;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:31,13:14,8:17,5
chr5	85358431	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.015895;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:7,6:8,5
chr5	85677331	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.00034555;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:9,21:3,10:6,11
chr5	88191956	.	CA	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.016254;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:1,4:4,1
chr5	89120537	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.01328;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,16:10,9:11,7
chr5	89311458	.	A	AAT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.046584;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,3:3,1
chr5	92880197	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0011799;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:13,6:17,4
chr5	94564384	.	T	TTGTG	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0030816;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:4,4:5,4
chr5	96313865	.	A	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.017586;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:41,9:14,6:27,3
chr5	97657022	.	C	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.053015;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:8,2:8,2
chr5	99522765	.	C	G	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.041137;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:48,11:16,4:32,7
chr5	100066701	.	T	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.018907;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:12,2:7,4
chr5	100493719	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.013595;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,11:3,7:2,4
chr5	100593974	.	A	ATATC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.098039;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,2:2,1:2,1
chr5	105296226	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0090312;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,3:4,2
chr5	105610844	.	A	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00013297;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:8,7:13,5
chr5	106604048	.	A	AAAATATAT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0045549;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:7,15:5,11:2,4
chr5	106755918	.	A	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.26667;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:6,2:5,1:1,1
chr5	108772333	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.073359;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:5,2:11,2
chr5	108819179	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.023188;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:3,4:4,2
chr5	110770611	.	A	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=8.0653e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:24,25:10,11:14,14
chr5	111991173	.	C	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00013948;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:14,7:13,6
chr5	112527856	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00028322;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:32,17:18,6:14,11
chr5	112818834	.	G	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,4:9,2:4,2
chr5	113653297	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.1866;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:11,7:7,5:4,2
chr5	114664322	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.11068;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,6:4,5:4,1
chr5	115547919	.	A	ATATGTGTGTGTG	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,4:4,2:2,2
chr5	116333491	.	CAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0072464;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,7:6,5:2,2
chr5	116879726	.	A	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.037129;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:14,1:5,8
chr5	117190472	.	T	TAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.20294;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,4:12,1:8,3
chr5	117284179	.	T	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.076651;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:4,2:8,3
chr5	117689652	.	G	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.067973;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:26,3:7,1
chr5	121657690	.	T	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:3,1:3,1
chr5	122513085	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.04669;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:8,5:10,2
chr5	122544822	.	AAAAAAAAATATAT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0017499;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,8:3,4:2,4
chr5	123023807	.	A	AACACACACACACAC	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.039556;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,5:9,3:9,2
chr5	123559703	.	T	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:1,2:1,1:0,1
chr5	124029932	.	A	AACACAC	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0014872;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,14:16,10:9,4
chr5	124764014	.	CTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.013999;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:7,4:0,3
chr5	124935723	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.03183;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:6,7:6,2
chr5	126576262	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.02087;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,6:3,5:3,1
chr5	126800951	.	CTA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.046584;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:7,3:1,1
chr5	126800956	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:7,2:3,2
chr5	127110306	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0010933;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:13,3:15,8
chr5	127614711	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,6:3,4:3,2
chr5	127676757	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00049368;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:12,7:8,2
chr5	127974670	.	AT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.014951;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,13:6,6:9,7
chr5	128759156	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0040779;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:12,6:10,4
chr5	129389321	.	TGTC	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.21839;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:10,2:7,2
chr5	131005742	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.034681;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:15,5:17,3
chr5	131240280	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00039828;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:9,3:10,6
chr5	131466384	.	A	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.051054;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:12,1:10,3
chr5	132433778	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.057386;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:9,6:7,1
chr5	132482663	.	GT	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.016254;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,10:4,8:1,2
chr5	132726572	.	C	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=7.8617e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:8,4:7,9
chr5	132881827	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:9,4:9,1:0,3
chr5	132889001	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0031368;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:10,5:15,3
chr5	133588185	.	G	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.15398;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:6,1:10,3
chr5	135812312	.	A	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.014019;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:12,2:21,5
chr5	138777250	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.032019;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:9,4:25,2
chr5	139155448	.	T	TGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.15033;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:7,2:12,2
chr5	139180058	.	T	TAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.014514;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,9:4,3:8,6
chr5	139381614	.	CA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.015632;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:6,6:5,1
chr5	144179804	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00031474;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:11,9:11,6
chr5	145219813	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00034047;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:12,2:7,7
chr5	145964307	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.065637;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,1:7,3
chr5	146560118	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,2:4,1:2,1
chr5	146679477	.	G	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.094721;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:1,0:14,4
chr5	147717784	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0024544;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:7,5:9,2
chr5	148068578	.	A	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:8,3:2,1
chr5	148091756	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.07699;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:10,2:5,3
chr5	148476969	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0035514;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:15,4:14,6
chr5	148615692	.	TAAAG	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.08744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:12,1:7,3
chr5	149956178	.	A	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.054545;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:1,2:0,1:1,1
chr5	151788570	.	A	ATGTG	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.029941;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,6:9,2:4,4
chr5	153243557	.	CA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:5,2:4,2
chr5	153577078	.	A	ATGGATGGATGGG	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.030435;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:6,4:3,1
chr5	153577162	.	A	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.30769;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,2:3,1:3,1
chr5	154586572	.	G	GA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.037198;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:8,4:2,1
chr5	154646237	.	GT	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.026636;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,6:2,4:4,2
chr5	155487913	.	A	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0001844;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:11,7:3,2
chr5	155796806	.	C	CA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:6,3:5,1
chr5	156416076	.	A	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0017626;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:9,4:9,4
chr5	156957512	.	C	CAAAAAAAAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.05132;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:7,3:6,1
chr5	156981148	.	CTCTTTCTTTCTT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0069996;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,10:1,5:5,5
chr5	157280363	.	A	ATTTTTTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0024977;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:6,3:5,5
chr5	158163405	.	T	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.28571;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:2,2:2,1:0,1
chr5	160202798	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.023376;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:4,6:7,2
chr5	160236016	.	G	GT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.029563;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:7,6:2,1
chr5	161571650	.	CATAT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.18462;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,6:1,5:5,1
chr5	161839895	.	C	CTCTTTCTTTCTTTCTT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.046953;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,4:1,1:1,3
chr5	162242657	.	GAT	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.032901;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,6:5,3:4,3
chr5	162978186	.	A	AACACACACACACAC	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.023788;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:6,6:3,2
chr5	163001832	.	T	TA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0025641;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,5:3,3:2,2
chr5	163226988	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.12238;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:4,3:0,0:4,3
chr5	163610852	.	G	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0012326;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:8,5:5,2
chr5	164402989	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.00037022;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:0,8:0,3:0,5
chr5	166523934	.	C	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00016765;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:4,2:5,6
chr5	167288558	.	C	CAAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.048889;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:4,3:6,1
chr5	170243365	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0015313;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:3,6:3,2
chr5	172286885	.	T	TA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.049017;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:6,4:3,2
chr5	173106732	.	C	CTATTT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0014808;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:3,6:10,5
chr5	173221743	.	A	ATG	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0021778;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,8:4,5:1,3
chr5	173338133	.	GTATATATATATA	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,9:6,6:2,3
chr5	173699017	.	A	ACGCGCGCG	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0038904;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,5:5,4:1,1
chr5	173872574	.	A	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.023715;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:5,3:1,1
chr5	174689912	.	C	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:5,1:0,1
chr5	175122973	.	A	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.34286;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,2:3,1:4,1
chr5	175930222	.	T	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.012785;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:16,5:13,5
chr5	175952831	.	T	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0072303;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:8,1:2,5
chr5	175961219	.	A	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0034188;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:2,3:2,1
chr5	176000359	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.031374;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:6,6:8,1
chr5	176576579	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0017828;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,11:3,9:2,2
chr5	177048787	.	C	CTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.048872;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:5,4:3,1
chr5	177644622	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:1,3:4,2
chr5	177645886	.	C	CG	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:6,3:1,1
chr5	177812290	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:5,3:0,0
chr5	177871804	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:4,3:2,1
chr5	178002236	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0069323;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:2,4:2,4
chr5	179384589	.	C	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.00042646;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:4,5:7,3
chr5	180954948	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,4:0,2:9,2
chr5	181306616	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.043255;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:2,3:5,2
chr6	371529	.	CAGG	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.091614;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,4:9,3:13,1
chr6	851213	.	C	CAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.042772;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:9,5:5,1
chr6	911480	.	TCTACAGACAGGTGAGGGGCCCC	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00040386;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:20,17:12,8:8,9
chr6	3181862	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.1538;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:12,2:9,2
chr6	4258452	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.20263;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,5:13,1:8,4
chr6	4674905	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00028843;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:11,3:6,7
chr6	5444493	.	AGAG	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.046953;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,4:1,1:1,3
chr6	7450593	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.046407;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:5,5:2,1
chr6	8044283	.	C	CAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,8:1,6:4,2
chr6	8628542	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.016425;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:2,3:5,4
chr6	8628547	.	TTC	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0026779;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:2,3:7,4
chr6	8978319	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.020362;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:2,1:2,4
chr6	9516350	.	A	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0049562;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,9:16,5:14,4
chr6	9752208	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=6.9341e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:11,7:5,5
chr6	10563774	.	A	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.26923;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:5,2:4,1:1,1
chr6	11052766	.	CA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:6,3:3,1
chr6	11083103	.	C	CTTTTTT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.042541;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,8:10,4:9,4
chr6	11319730	.	ACT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.066185;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,4:10,2:3,2
chr6	11319742	.	A	ACT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,5:7,2:3,3
chr6	11636065	.	CA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0027473;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:0,11:0,8:0,3
chr6	11700420	.	A	AATATATATAT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.070707;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,4:2,2:1,2
chr6	11855203	.	T	TTGTGTG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.015843;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:6,1:3,5
chr6	12065694	.	T	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.10478;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:36,6:14,2:22,4
chr6	12753779	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.016493;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:10,2:9,4
chr6	14031306	.	TAACACACA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0080824;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:12,6:6,5
chr6	14163457	.	CT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.017499;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,8:5,5:3,3
chr6	14353495	.	G	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=6.4422e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:27,16:15,12:12,4
chr6	14382908	.	T	TCTTC	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.16171;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,4:15,3:12,1
chr6	15094541	.	A	AC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.048379;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,7:6,2:5,5
chr6	15220872	.	CGGGGGAGAGGAAAT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.010097;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:7,9:9,3
chr6	15620983	.	T	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00060146;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:17,6:13,6
chr6	16121816	.	G	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0011498;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:18,5:8,6
chr6	16289848	.	ATTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.026006;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:2,1:3,3
chr6	17020444	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0024472;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:6,3:2,4
chr6	20310118	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.2066;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:10,4:7,3:3,1
chr6	20992037	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.037203;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,2:8,2
chr6	21635083	.	G	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.18479;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,5:9,3:8,2
chr6	22077805	.	T	TTAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0070729;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:9,13:4,10:5,3
chr6	22481638	.	A	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:3,2:4,2
chr6	22868282	.	CAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0021831;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:3,8:2,7:1,1
chr6	23276844	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0009678;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:13,6:8,3
chr6	23827822	.	C	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0025987;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:13,11:12,3
chr6	24378956	.	G	GA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.12587;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,4:5,4:0,0
chr6	24389373	.	A	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:1,2:0,1:1,1
chr6	26042796	.	A	ATT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.13093;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:7,1:12,4
chr6	27045173	.	G	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.001551;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:19,5:17,4
chr6	27221394	.	T	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.093861;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:15,3:16,1
chr6	27803526	.	TCACACA	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.040458;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,8:9,3:1,5
chr6	28080543	.	A	AT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.036419;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:6,4:6,1
chr6	28891642	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.021198;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:13,4:9,3
chr6	29187357	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=7.3665e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:11,6:12,7
chr6	29707390	.	T	TACACAC	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,4:4,3:2,1
chr6	30415665	.	C	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0014573;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:16,17:6,9:10,8
chr6	30515671	.	CTAGA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0010237;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:11,10:4,3
chr6	31409323	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.037466;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:6,2:6,5
chr6	31455864	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.16038;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:19,3:13,1
chr6	31682815	.	AG	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.00054583;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:2,10:1,6:1,4
chr6	32010061	.	G	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:0,0:8,4
chr6	32215812	.	CCTTT	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.014575;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:11,1:4,6
chr6	32215827	.	TC	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.018966;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:9,1:2,5
chr6	32690111	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.11117;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:11,6:10,2
chr6	33230722	.	G	GGAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0088608;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,7:4,4:8,3
chr6	33309720	.	CT	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.02381;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:0,5:0,4:0,1
chr6	34136563	.	GAC	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0079095;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,8:3,4:2,4
chr6	34397811	.	C	CT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.12474;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:17,3:10,1:7,2
chr6	35182724	.	TATATATATATA	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:1,2:0,1:1,1
chr6	35383871	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.025813;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:16,6:15,3
chr6	36175391	.	GA	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.12114;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:11,3:11,1
chr6	36549329	.	CTCTTCT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.022311;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,6:1,3:7,3
chr6	37044481	.	T	TA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.045954;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:12,4:5,4
chr6	37121230	.	C	CAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.018778;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:5,10:3,9:2,1
chr6	37959118	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0010244;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:14,5:13,5
chr6	39724452	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0069323;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,8:3,7:1,1
chr6	40655197	.	ATG	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.28876;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:15,2:10,2
chr6	41283329	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.089909;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:19,1:10,3
chr6	41565463	.	A	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=3.5464e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:8,11:9,4
chr6	42841075	.	TA	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.010718;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,9:4,4:1,5
chr6	43398399	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.017846;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:6,4:11,6
chr6	44508149	.	A	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00088456;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:8,6:12,5
chr6	45150720	.	G	GTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,6:3,4:2,2
chr6	45318277	.	A	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.03797;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:15,4:13,3
chr6	45866424	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.13357;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:13,1:9,3
chr6	47660260	.	GACACACAC	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.004644;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,10:3,8:2,2
chr6	49020323	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:1,2:1,1:0,1
chr6	49721139	.	G	GTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,6:2,4:4,2
chr6	49769054	.	A	AACACACACACAC	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.030049;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,8:10,3:10,5
chr6	51202674	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.038803;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:8,7:13,3
chr6	51519797	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.030178;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:4,4:14,6
chr6	51671401	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0007325;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:11,5:13,5
chr6	52363343	.	C	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0013429;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:15,5:17,4
chr6	52945792	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00051706;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:12,3:11,7
chr6	53253265	.	ATC	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.064915;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:11,2:11,2
chr6	54004937	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.014884;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,7:0,6:3,1
chr6	54305991	.	T	TATC	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0012439;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:20,5:16,6
chr6	55055543	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.041422;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:20,4:8,2
chr6	56847002	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0084817;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:8,7:3,1
chr6	56900875	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.013014;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:4,6:6,1
chr6	57256745	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.072149;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,5:3,3:10,2
chr6	57941432	.	CAAA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:3,3:7,1
chr6	58263125	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.001881;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:10,2:10,6
chr6	58392444	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0077272;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:12,3:15,4
chr6	59562159	.	G	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.091304;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:11,4:0,0
chr6	59562160	.	A	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:11,4:1,0
chr6	59828833	.	C	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.17137;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:1,0:20,4
chr6	60656011	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=1.0579e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,11:1,4:3,7
chr6	60700140	.	GTATA	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.074661;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,6:3,3:3,3
chr6	60807897	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00044723;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:13,6:10,7
chr6	62166021	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0001375;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:6,7:14,4
chr6	66768518	.	C	CA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:8,3:2,1
chr6	67152335	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.02373;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:12,4:19,4
chr6	67662695	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:2,2:5,2
chr6	68646475	.	C	CA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.014937;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,10:11,7:8,3
chr6	69735444	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.28571;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:2,2:1,1:1,1
chr6	70227424	.	T	TAAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.037328;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:10,5:4,2
chr6	70938255	.	GATAC	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.035323;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:6,3:9,5
chr6	71355521	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00013746;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:13,17:9,5:4,12
chr6	71382249	.	A	AAT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.019243;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:10,4:7,2
chr6	71807875	.	A	AC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.028152;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:12,5:3,6
chr6	72196379	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.031815;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:16,7:10,4:6,3
chr6	72275120	.	GTATATATATATATATATATATATATATATATA	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,6:2,5:1,1
chr6	72339150	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.040704;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:10,3:12,1
chr6	72500306	.	AAG	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.47431;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,2:10,1:4,1
chr6	72500330	.	AAG	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.091304;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:5,2:6,2
chr6	72587312	.	AAAAGAAAG	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.041365;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:13,2:10,2
chr6	74165440	.	C	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=9.4662e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:9,5:14,7
chr6	74797476	.	C	CAT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.092308;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,4:1,3:4,1
chr6	74810977	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0041136;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:6,6:12,4
chr6	75326112	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.041869;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:13,4:18,2
chr6	75370340	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.027357;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:12,1:5,4
chr6	75563329	.	C	CTGTGTGTG	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0024526;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,7:1,5:3,2
chr6	76048137	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.020112;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:8,3:18,3
chr6	76687005	.	A	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.21429;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:2,2:2,1:0,1
chr6	78186375	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.017534;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:2,9:2,7:0,2
chr6	78541340	.	GAGAGAGCCAGACAGCA	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0010369;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:12,6:3,4
chr6	79461984	.	C	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0087781;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:12,5:11,2
chr6	80145831	.	C	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=1.1889e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,16:12,9:9,7
chr6	81647497	.	A	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00096111;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:21,8:11,4
chr6	83221158	.	C	CAAAAAAAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.018671;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,8:8,7:5,1
chr6	83237314	.	GA	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0093841;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:10,6:5,6
chr6	83497818	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.082213;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:4,4:7,1
chr6	84254247	.	G	GT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=3.216e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:7,18:2,11:5,7
chr6	85135130	.	A	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.18947;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,2:7,1:0,1
chr6	85939416	.	A	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.10313;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:9,1:16,3
chr6	87128988	.	C	CGTATATATATGTATGTATATT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.076205;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,4:7,1:16,3
chr6	87519184	.	A	ATGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.012445;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,9:1,8:10,1
chr6	87599354	.	A	ATTAT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0011759;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,15:5,9:6,6
chr6	87673155	.	T	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.16176;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,4:4,1:4,3
chr6	88860839	.	C	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,2:3,1:3,1
chr6	90100726	.	CAG	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.119;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,4:14,2:12,2
chr6	90377719	.	CTTTTTTCT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:3,1:8,3
chr6	90377955	.	C	CTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.069881;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,6:7,5:4,1
chr6	90613784	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,2:2,1:0,1
chr6	92125323	.	C	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0005561;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,11:13,8:14,3
chr6	92434273	.	GT	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0039973;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:14,6:6,3
chr6	93069000	.	T	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0061026;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:9,6:8,2
chr6	93832826	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.036102;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:3,5:8,2
chr6	94052100	.	C	CATCT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.039629;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:6,4:14,5
chr6	94575966	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0066305;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:10,2:16,7
chr6	94581085	.	C	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.070286;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:11,3:26,2
chr6	95486242	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.075302;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:16,2:15,3
chr6	97284483	.	G	GCA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0067841;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:8,11:5,8:3,3
chr6	97992099	.	C	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0096405;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:5,7:11,2
chr6	98224506	.	A	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.27778;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:3,2:2,1:1,1
chr6	98609318	.	C	CAATAAATAAATA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.021295;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:11,6:13,4
chr6	99097661	.	ATT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0053012;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:12,14:5,12:7,2
chr6	99107066	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.002821;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:9,1:13,6
chr6	100608289	.	TTA	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:2,3:3,4
chr6	101681421	.	T	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10493;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:6,1:14,3
chr6	102120230	.	A	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00096111;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:21,3:11,9
chr6	102244230	.	C	CAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.051826;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:8,4:9,2
chr6	103531457	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0061655;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:17,3:9,5
chr6	103711877	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.014654;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:7,4:7,6
chr6	104444919	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.42424;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:6,2:4,1:2,1
chr6	105906381	.	GCACA	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,8:4,5:0,3
chr6	105968316	.	C	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.015217;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:12,2:11,5
chr6	106348910	.	C	CAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,8:2,6:2,2
chr6	110923933	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=2.7315e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:7,9:15,8
chr6	112312923	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0369;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,7:10,3:16,4
chr6	114045997	.	G	GCACACACACACA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.03726;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:11,5:4,2
chr6	115067637	.	T	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.061918;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:22,3:14,2
chr6	115531711	.	T	TATAGATAG	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.014357;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,10:7,4:12,6
chr6	115643130	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=6.6326e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:4,7:8,2
chr6	117430681	.	CAAAAAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.040724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,7:3,6:2,1
chr6	118529612	.	A	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.35897;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,2:3,1:3,1
chr6	120692029	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:12,2:5,2
chr6	121462554	.	C	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:6,1:7,3
chr6	121606531	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,8:5,5:4,3
chr6	121928140	.	CA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.01473;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:8,7:3,2
chr6	122053984	.	T	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00047262;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:24,15:4,2:20,13
chr6	122633975	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.024127;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:10,3:16,5
chr6	122858018	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0021937;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:14,23:3,11:11,12
chr6	123238249	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00054254;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:12,7:12,6
chr6	124841840	.	ATT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.088935;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:14,3:4,1
chr6	125517647	.	CA	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.003791;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:18,6:4,3
chr6	125703568	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0078821;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:9,5:16,6
chr6	126856226	.	ATTTATTTTAT	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.027339;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:8,5:14,7
chr6	129371607	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.04053;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:6,6:6,2
chr6	132533977	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:6,2:11,2
chr6	132973261	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.015866;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,10:3,4:4,6
chr6	133385393	.	G	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.21429;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:2,2:0,1:2,1
chr6	134625659	.	C	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0030392;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,12:16,5:18,7
chr6	135313506	.	G	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0086598;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:11,2:16,5
chr6	135750267	.	C	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.11141;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:15,3:14,1
chr6	136786379	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.040398;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,10:9,9:3,1
chr6	137948309	.	A	ACT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.036089;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,5:3,2:4,3
chr6	138043394	.	C	CA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1866;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,4:9,3:2,1
chr6	138147228	.	GA	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.023132;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:10,5:11,5
chr6	138819248	.	A	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.051532;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:19,5:15,2
chr6	138955457	.	A	AAGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:3,1:8,3
chr6	139384172	.	G	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.051834;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:9,1:15,3
chr6	142204643	.	ATTTAATCCTTTTATATTTAAAAGGATTTAAAT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.040541;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:6,4:10,1
chr6	142244318	.	C	CAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,9:2,8:4,1
chr6	143580508	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.019763;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:6,4:3,3:3,1
chr6	143977473	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.11275;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:11,2:8,3
chr6	145034839	.	CTGTCA	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.000451;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:9,7:15,3
chr6	145934473	.	T	TAAATAAAATAAAATA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.031374;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:7,6:7,1
chr6	146089679	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.015414;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:19,5:9,2
chr6	146455122	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.039565;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:16,6:7,3
chr6	146568404	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:3,2:3,2:0,0
chr6	147461958	.	CA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.16725;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:9,4:1,0
chr6	147626818	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
chr6	147630491	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.004211;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:12,5:5,7
chr6	147719790	.	GT	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.048152;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:17,3:16,2
chr6	147719796	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.044221;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:15,3:19,2
chr6	148368772	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.055478;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:9,4:7,2
chr6	148899092	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0039295;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:4,8:2,5:2,3
chr6	149324826	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.035315;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,8:7,5:8,3
chr6	149790516	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0048547;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,10:4,4:3,6
chr6	150085900	.	CAA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,11:1,6:8,5
chr6	150202396	.	C	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.003184;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:15,6:12,2
chr6	150884141	.	A	AT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:6,6:5,3
chr6	152256431	.	AAAATAAAT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.2206;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:11,3:17,3
chr6	153401835	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00077962;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:7,5:8,4
chr6	155627833	.	A	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.019883;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,3:5,1
chr6	155968845	.	C	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0012998;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:9,5:13,6
chr6	162713493	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.12913;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,6:3,4:6,2
chr6	164455129	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.011343;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:14,10:6,3:8,7
chr6	164745498	.	TC	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.021576;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:7,3:2,4
chr6	164787517	.	C	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=1.7213e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:36,19:18,8:18,11
chr6	164939524	.	A	AG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.1396;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:12,3:12,2
chr6	164939526	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.12337;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:13,3:11,2
chr6	164939530	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.10585;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:11,3:9,2
chr6	165398498	.	T	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.090909;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:2,2:2,2:0,0
chr6	165656258	.	T	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.023879;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,6:6,2:8,4
chr6	166893252	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0022056;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:11,6:11,4
chr6	166963191	.	TG	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0088769;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:7,7:5,2
chr6	167177840	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.019711;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:16,5:12,2
chr6	167698965	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.048018;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:19,5:14,1
chr6	167977818	.	C	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.014142;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:3,5:2,1
chr6	168603242	.	CTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,8:4,4:4,4
chr6	168618449	.	G	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.073366;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:10,2:9,6
chr6	168931505	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:4,2:9,2
chr6	168976849	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.038024;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:8,2:18,2
chr6	169724395	.	C	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.14022;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:14,2:8,3
chr6	170656349	.	G	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.07564;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:11,1:2,3
chr7	404072	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:1,5:3,3
chr7	494624	.	AG	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:2,2:2,2
chr7	735331	.	C	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.019565;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,3:4,2
chr7	745433	.	C	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.027483;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:38,6:27,2:11,4
chr7	955827	.	A	AC	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.09755;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:14,3:19,1
chr7	1003990	.	T	TGA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.12491;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,4:19,4:2,0
chr7	1432727	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0023389;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,8:11,3:5,5
chr7	2946634	.	C	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0010857;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:16,6:10,3
chr7	3554208	.	C	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0014163;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:13,4:18,7
chr7	4680676	.	C	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,10:3,9:3,1
chr7	5184282	.	C	CTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.045113;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:3,2:4,2
chr7	5411515	.	C	CA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.037732;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:7,6:1,1
chr7	5920207	.	C	CA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.030143;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:7,4:8,4
chr7	5932183	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.040214;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:4,4:9,3
chr7	6092010	.	TC	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1025;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:10,2:11,2
chr7	6275849	.	C	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0066305;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:16,6:10,3
chr7	6410880	.	A	AT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.19783;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,3:7,2:5,1
chr7	6754598	.	C	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.13842;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:0,0:21,4
chr7	7429425	.	CTCACATACACACACACTCTCTT	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.016338;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:9,2:9,7
chr7	9156843	.	C	CAAAAAAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0070449;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:6,9:4,1
chr7	9762027	.	AAC	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.06523;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:11,3:8,1
chr7	9762054	.	ATATATATTTATAT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.039244;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:10,3:2,1
chr7	10795416	.	C	CCACACACA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.011637;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,14:11,11:6,3
chr7	11638318	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00054466;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:8,5:14,4
chr7	12502281	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.040876;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:11,4:4,4
chr7	12888535	.	T	TTC	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.12491;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,4:3,1:18,3
chr7	13324565	.	T	TCC	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.091949;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,6:3,1:8,5
chr7	13820734	.	T	TCTTC	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.080042;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:9,3:9,1
chr7	14188044	.	A	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.035742;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:18,2:16,3
chr7	14577572	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00029763;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:16,4:15,10
chr7	14906441	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.16366;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:10,3:10,2
chr7	15432333	.	T	TATATATATACATAC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.086103;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,4:9,3:11,1
chr7	15586829	.	G	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.014512;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:16,3:15,4
chr7	15997975	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.011243;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:14,5:16,5
chr7	16628905	.	GT	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.039346;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:7,7:14,1
chr7	16919988	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00086166;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:14,7:14,6
chr7	21203931	.	C	CCACACACA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.20979;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,4:3,3:3,1
chr7	21227141	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.09755;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:21,2:12,2
chr7	21789796	.	TC	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.10766;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:6,2:13,2
chr7	23034703	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=6.6609e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,16:12,10:8,6
chr7	23154355	.	A	AAAAC	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.031691;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:8,5:13,6
chr7	24779498	.	G	GGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.020195;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:13,5:5,5
chr7	24940809	.	CT	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0336;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:12,1:8,3
chr7	26090458	.	C	CAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.016673;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:11,5:3,1
chr7	26301018	.	CCAA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.069881;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:8,5:3,1
chr7	28000618	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.019346;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,8:9,6:4,2
chr7	28000622	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.041789;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,5:8,4:6,1
chr7	28348385	.	CTCTCTCTCTCTG	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.053885;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,4:8,2:10,2
chr7	28624676	.	G	GAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.13055;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:10,4:5,1
chr7	32443079	.	CAAA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,7:1,2:1,5
chr7	33020563	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0012119;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:12,5:15,9
chr7	33783473	.	CTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.23498;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,5:4,3:8,2
chr7	34386872	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=9.3501e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:17,24:9,14:8,10
chr7	35574098	.	AG	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.031059;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:8,4:0,2
chr7	36056071	.	GCAGGA	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0035575;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:14,4:9,4
chr7	36056080	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0022392;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:14,4:7,4
chr7	36056083	.	T	TG	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0053469;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:16,3:8,4
chr7	36056086	.	T	TA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0040413;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:15,3:7,4
chr7	36198359	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.097902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,4:3,1:1,3
chr7	36778301	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.003548;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:12,3:13,6
chr7	37691045	.	C	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0029872;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:12,6:8,2
chr7	38548054	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.027745;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:16,7:15,1
chr7	40346934	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=1.4316e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:8,20:6,12:2,8
chr7	40988895	.	T	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:1,2:1,1:0,1
chr7	43032440	.	A	AAGAAG	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.083011;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,5:5,4:3,1
chr7	43898788	.	AATTT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.045217;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,6:5,4:5,2
chr7	44085359	.	C	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,5:6,1:1,4
chr7	45547680	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,4:3,1:3,3
chr7	47172855	.	T	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.013178;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:12,1:12,5
chr7	47910826	.	T	TTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.066403;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,5:2,3:9,2
chr7	48294442	.	G	GT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.11905;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:2,4:1,2:1,2
chr7	51086358	.	GAAAAAAAAA	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0011057;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,8:1,6:1,2
chr7	51271899	.	T	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.00028557;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:32,14:19,7:13,7
chr7	51541412	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00053327;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:8,5:9,5
chr7	51610845	.	G	GTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,9:5,8:6,1
chr7	52199611	.	C	CAA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00023911;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:9,16:3,8:6,8
chr7	52403946	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.034956;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:9,2:9,3
chr7	52445996	.	ATTTTTT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:5,3:5,2
chr7	53857364	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0048332;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:16,6:17,4
chr7	54302829	.	C	CA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:11,4:0,0
chr7	55143189	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0042512;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:10,5:15,5
chr7	55323199	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.29371;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,3:3,1:3,2
chr7	55924515	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0036989;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:11,4:17,6
chr7	56151217	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.22147;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:21,3:13,2:8,1
chr7	56168398	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:21:1,3:1,3:0,0
chr7	56447514	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.023537;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:5,2:2,3
chr7	56815431	.	G	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1184;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:10,1:6,3
chr7	56870617	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1184;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:12,1:4,3
chr7	57396857	.	CTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0062713;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:2,10:1,9:1,1
chr7	57408800	.	G	GTTTTCTTTTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0098833;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,9:0,6:3,3
chr7	57499513	.	G	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00070765;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:13,5:7,6
chr7	57617502	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.09126;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:21,3:20,2
chr7	57708767	.	A	G	0	PASS	DP=214;GPV=1;SPV=0.042999;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:87,16:51,5:36,11
chr7	58074648	.	G	T	0	PASS	DP=192;GPV=1;SPV=0.0026177;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:87,17:52,13:35,4
chr7	58074649	.	C	T	0	PASS	DP=194;GPV=1;SPV=0.00093139;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:105:82,23:48,19:34,4
chr7	58081151	.	C	G	0	PASS	DP=212;GPV=1;SPV=0.029944;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:121:100,21:48,9:52,12
chr7	58083546	.	C	G	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.0098911;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:52,11:29,7:23,4
chr7	58089349	.	CAA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.029941;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,6:8,5:5,1
chr7	58207631	.	A	C	0	PASS	DP=152;GPV=1;SPV=0.016846;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:71,17:29,8:42,9
chr7	59849357	.	G	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.083867;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:1,4:21,1
chr7	59967230	.	T	C	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.04075;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:75,9:32,3:43,6
chr7	60443284	.	T	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0056445;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,9:22,8:13,1
chr7	60938782	.	AT	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.038854;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:36,9:17,8:19,1
chr7	60945409	.	C	T	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.030386;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:50,7:21,4:29,3
chr7	61002037	.	T	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.13544;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:18,3:15,1
chr7	61013469	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.040635;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:18,5:16,2
chr7	61116195	.	C	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.023715;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:6,4:0,0
chr7	61117113	.	C	G	0	PASS	DP=166;GPV=1;SPV=0.034069;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:80,15:49,5:31,10
chr7	61118060	.	G	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0089809;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:3,3:15,4
chr7	61255209	.	T	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.04;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:11,3:10,1
chr7	61409812	.	A	G	0	PASS	DP=253;GPV=1;SPV=0.011294;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:136:113,23:93,19:20,4
chr7	61410142	.	TC	T	0	PASS	DP=184;GPV=1;SPV=0.010722;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:93:77,16:30,6:47,10
chr7	61527517	.	T	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.029593;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:39,9:31,6:8,3
chr7	61764874	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.11252;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:6,6:12,1
chr7	61804323	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0036085;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:17,5:10,3
chr7	61839512	.	T	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.24348;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:13,3:6,1:7,2
chr7	62030363	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.014757;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:3,2:3,5
chr7	63564349	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.13974;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:13,3:16,1
chr7	63629694	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,3:8,1
chr7	63754992	.	T	A	0	PASS	DP=268;GPV=1;SPV=0.007447;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:149:129,20:42,4:87,16
chr7	63769322	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.010262;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:14,4:10,6
chr7	63835793	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.049522;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:12,3:15,1
chr7	64004410	.	T	TAAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.053755;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:4,4:7,2
chr7	64097000	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.032916;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:12,2:8,5
chr7	64491938	.	T	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.037956;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:7,6:11,4
chr7	64847332	.	A	ATAT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.01093;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:0,5:6,5
chr7	64963760	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:3,2:3,1:0,1
chr7	65241850	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:8,4:0,2
chr7	65505802	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.10954;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:19,4:14,1
chr7	66509760	.	C	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,4:1,2:3,2
chr7	66983916	.	A	AT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.028261;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,6:4,3:5,3
chr7	67266492	.	A	AT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.069853;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:10,3:7,2
chr7	68029021	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:3,3:7,2
chr7	68479343	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.021836;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:12,3:13,4
chr7	68499365	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.25199;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:14,3:3,1
chr7	68894513	.	C	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.069378;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:17,1:24,4
chr7	69137867	.	G	GA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0050212;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:19,6:6,5
chr7	70340163	.	A	AACACACACACACAC	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.04484;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:7,5:5,2
chr7	71334028	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.037817;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:16,4:15,2
chr7	71836622	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.037596;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:8,5:2,2
chr7	72287435	.	AT	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.040038;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,6:9,2:0,4
chr7	73805601	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.077778;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,4:4,3:7,1
chr7	73835197	.	TCTCCCTCTC	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,8:3,2:6,6
chr7	73836216	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.032901;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:2,1:7,5
chr7	74547439	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:6,2:3,2
chr7	75010085	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0084069;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,13:4,4:7,9
chr7	75110961	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.021859;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:5,5:3,4
chr7	76441133	.	T	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.031136;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:11,1:18,4
chr7	76606109	.	G	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.024562;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:35,10:18,3:17,7
chr7	76958294	.	T	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:10,3:3,1
chr7	77001029	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.039335;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:8,5:11,1
chr7	77053418	.	G	A	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.0025089;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:51,20:24,11:27,9
chr7	77357429	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00082439;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:18,4:8,8
chr7	77440170	.	ATTT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:7,3:4,5
chr7	77998313	.	C	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00039176;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,17:10,10:9,7
chr7	78004586	.	CTGTGTGTGTG	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.041917;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:12,11:6,5:6,6
chr7	78083388	.	GA	G	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,3:2,3:0,0
chr7	80020388	.	G	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.045175;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:20,2:19,3
chr7	81539388	.	A	ATATG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.13842;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,4:10,2:11,2
chr7	83775895	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.17496;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:14,1:11,3
chr7	84534144	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00022237;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,16:14,7:7,9
chr7	85333823	.	G	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0013654;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:4,4:2,5
chr7	86331047	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=2.1506e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:8,9:8,4
chr7	86627560	.	CT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.03989;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:2,5:2,1
chr7	88053624	.	GAAAGAAAGAA	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0049129;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,7:6,2:1,5
chr7	88113703	.	AATATATAT	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:1,4:3,1
chr7	89375746	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.10577;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,5:5,4:1,1
chr7	89424208	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.076628;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:9,2:3,2
chr7	90100890	.	A	ATT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0027397;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:4,8:5,2
chr7	90901691	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.044901;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:4,4:14,1
chr7	91863676	.	A	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.15152;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,2:0,1:3,1
chr7	92870188	.	TA	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0032575;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:3,7:1,1
chr7	95500568	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0015076;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:3,9:3,1
chr7	97702887	.	C	CTTAAAG	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:3,4:0,2
chr7	98405344	.	GCTTTCTTT	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.011224;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,8:7,5:3,3
chr7	100181901	.	C	CAA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:6,4:2,1
chr7	100697996	.	CTT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.01037;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:2,5:2,2
chr7	101002450	.	G	A	0	PASS	DP=291;GPV=1;SPV=0.00231;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:135:118,17:63,7:55,10
chr7	101098714	.	G	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0033765;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:15,2:9,5
chr7	101320558	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.018182;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:0,3:0,1:0,2
chr7	101342021	.	T	TTTC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.21569;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,3:5,1:14,2
chr7	101355066	.	TTTTTC	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.011229;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:4,4:5,5
chr7	101946544	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.15021;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,5:5,4:3,1
chr7	102060580	.	CATATAT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.042412;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:9,3:6,1
chr7	102564422	.	C	CAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.13663;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:22,3:5,1
chr7	102566067	.	G	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.036714;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:11,7:16,3
chr7	102576894	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.03782;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:13,5:12,3
chr7	102592796	.	G	A	0	PASS	DP=159;GPV=1;SPV=0.00012025;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:56,23:27,13:29,10
chr7	102618555	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=4.7617e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,13:7,10:7,3
chr7	105501970	.	ATAT	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:2,2:2,1:0,1
chr7	106586896	.	A	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=2.3666e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:6,7:3,2
chr7	107749938	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.029646;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:9,1:10,8
chr7	108692388	.	A	ATTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0055944;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,6:1,3:1,3
chr7	108725935	.	A	AGAGAGG	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,7:4,2:1,5
chr7	110192628	.	T	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.063158;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:2,2:4,1
chr7	110315561	.	C	CCT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.020229;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,7:4,5:2,2
chr7	110963987	.	A	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.029051;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,6:4,4:5,2
chr7	110989531	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.037021;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:6,2:0,3
chr7	115821961	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.004902;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:0,14:0,10:0,4
chr7	117059807	.	C	CA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,3:3,1
chr7	119335917	.	GT	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.027438;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:3,4:3,1
chr7	120081165	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0018031;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:9,6:3,3
chr7	120828655	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0095459;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,5:1,4:1,1
chr7	123360172	.	CTGTG	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.027972;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:3,5:3,2:0,3
chr7	125248961	.	G	GT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.012694;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:5,6:2,1
chr7	126360474	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.042184;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:11,2:20,3
chr7	126595400	.	T	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.001998;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:1,5:0,3:1,2
chr7	128188120	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.125;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,2:1,1:3,1
chr7	129963936	.	G	GT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.00068862;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:7,10:2,2
chr7	130782419	.	CTCTT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0019985;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:3,3:3,5
chr7	131983250	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.00029663;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:3,5:4,4
chr7	132020640	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.019656;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:10,5:5,1
chr7	132716676	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.001026;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,10:3,8:1,2
chr7	133227300	.	TATA	T	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,2:2,1:1,1
chr7	134371720	.	C	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00095953;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,7:7,2
chr7	134544731	.	G	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0014954;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:6,1:9,5
chr7	136452552	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.013177;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,5:5,1:1,4
chr7	139490533	.	CA	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.00098508;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:1,8:0,6:1,2
chr7	139623517	.	CAA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.01548;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:2,3:2,3
chr7	140583926	.	G	GA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.21839;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:7,3:10,1
chr7	141002399	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14141;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,4:3,1:1,3
chr7	141604374	.	G	GTATATATATA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:2,5:4,1
chr7	142383337	.	T	TTCTATAA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:4,2:2,2
chr7	143208151	.	A	AAGTAT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.03311;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,4:6,3:2,1
chr7	143540747	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.010482;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:4,8:14,3
chr7	144149689	.	C	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:2,2:0,1:2,1
chr7	144244550	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.013378;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:4,4:14,5
chr7	144285525	.	T	C	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.01061;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:34,13:20,5:14,8
chr7	145196271	.	TTTTTCTTTTC	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.023384;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:2,5:7,2
chr7	146856297	.	G	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.024462;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,4:7,2:3,2
chr7	147010007	.	CTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0032575;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:3,7:1,1
chr7	147317800	.	A	ATATATGTG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.066185;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,4:4,2:9,2
chr7	147995532	.	G	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.012694;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:7,7:3,4:4,3
chr7	147997556	.	CAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.01192;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,6:4,5:1,1
chr7	148737558	.	G	GTA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.037585;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,9:6,4:11,5
chr7	150776543	.	C	CAAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0053523;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:12,15:6,13:6,2
chr7	151027375	.	TCTCCCCATGTGATGAAATATGGCCTCGTGGGAAGGGAAAGACCTGACCGTCCC	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.022869;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:10,1:6,5
chr7	151759722	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=2.5053e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,13:6,5:2,8
chr7	151874171	.	GATGTATATGTAT	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.023174;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,7:9,4:11,3
chr7	151962609	.	G	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.030888;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:5,3:10,2
chr7	152307195	.	GAGGAAGGAAGGAAGGAAGGA	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.11779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,4:12,2:11,2
chr7	152674740	.	A	AT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,4:10,2:2,2
chr7	152686129	.	AAT	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.037091;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:8,2:13,2
chr7	153182612	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=2.5052e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,14:6,3:10,11
chr7	153217951	.	T	TCACACACACACACACACA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.20798;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,5:5,4:3,1
chr7	154436098	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0050968;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:12,3:8,2
chr7	155158263	.	A	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.023736;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:2,1:1,4
chr7	155946844	.	TTCCTTCTC	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.031056;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:1,2:6,2
chr7	156265789	.	G	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:2,4:2,1
chr7	157261307	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.0013986;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:1,8:0,4:1,4
chr7	157827362	.	C	CCACAACACAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0033618;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,10:3,7:4,3
chr7	158126119	.	A	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.14737;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
chr7	158417950	.	C	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0095694;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:3,3:2,2
chr8	768418	.	A	AT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.079329;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,6:4,4:6,2
chr8	1130104	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.059189;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,9:12,4:13,5
chr8	2591252	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.018203;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:11,7:2,2
chr8	3035255	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0011925;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,15:13,8:13,7
chr8	3233859	.	C	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0018791;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:10,4:5,4
chr8	3926079	.	CCATA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.053471;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:11,1:6,3
chr8	4023753	.	ATTT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.045792;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:10,3:2,4
chr8	4974183	.	A	AT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0026204;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:11,8:11,7
chr8	5395533	.	T	TTTAC	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.027862;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,5:8,1:12,4
chr8	6223947	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.099033;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,6:9,4:11,2
chr8	6228677	.	A	AACACACAC	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.024017;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:8,11:6,6:2,5
chr8	7102233	.	A	AAT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.01905;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:8,5:8,3
chr8	7178754	.	AT	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.016427;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:9,8:6,2
chr8	7208193	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.051948;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:4,2:10,2
chr8	7577272	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.064336;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:16,6:1,1
chr8	7616393	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.097916;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:7,3:7,2
chr8	7774382	.	C	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.00071446;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:2,7:2,2:0,5
chr8	8059318	.	G	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.077195;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:10,1:8,4
chr8	8140683	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0038917;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:4,7:3,2
chr8	8161203	.	T	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.0083882;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:37,17:20,10:17,7
chr8	8176793	.	G	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:7,4:0,0
chr8	8186779	.	C	G	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.018219;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:46,9:35,6:11,3
chr8	8675975	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.018778;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,7:3,6:2,1
chr8	9627563	.	G	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.13255;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:12,1:19,3
chr8	9657272	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:1,1:5,3
chr8	11567367	.	GCTCAGTCAATT	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.038024;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:15,2:11,2
chr8	12439341	.	T	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:11,2:4,2
chr8	12504320	.	G	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:2,3:4,2
chr8	12560699	.	TATAC	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.047445;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:43,7:26,3:17,4
chr8	12560716	.	ATATATACG	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.039034;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:39,7:25,2:14,5
chr8	12739967	.	G	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.16038;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:20,2:12,2
chr8	12902624	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.034045;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:9,5:2,3
chr8	14471992	.	G	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00089348;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:31,13:12,3:19,10
chr8	14507129	.	C	CAAACTGTCTTTTCAATTGATCGGGACAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.16591;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:11,2:13,2
chr8	15430011	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0037259;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,14:6,7:8,7
chr8	16297238	.	G	GTAAGT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.2164;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:12,2:7,2
chr8	16961661	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:8,2:2,2
chr8	17267469	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.050264;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:12,3:16,4
chr8	18018899	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0072464;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,7:3,3:5,4
chr8	18164474	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0062626;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:21,3:10,7
chr8	18562931	.	G	GA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.12152;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:18,6:9,5:9,1
chr8	18968867	.	A	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.024337;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:6,6:6,3
chr8	20373742	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.096892;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:16,2:3,2
chr8	20469842	.	T	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00034218;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:16,6:12,5
chr8	20472586	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,5:2,3:3,2
chr8	22648907	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.011282;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:10,6:12,3
chr8	22815366	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00020424;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:10,4:18,9
chr8	23346100	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.072845;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:20,3:9,2
chr8	24020415	.	CTG	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.052123;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:10,2:9,5
chr8	24837126	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.22222;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:3,2:1,1:2,1
chr8	25410974	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:2,2:8,3
chr8	25410983	.	GCACGCA	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.25455;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,4:2,2:3,2
chr8	26002932	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0055469;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,8:3,5:7,3
chr8	26004673	.	CA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.047472;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:3,2:1,2
chr8	26618481	.	GT	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.051469;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:13,4:4,3
chr8	26680343	.	CTCTT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.07564;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,4:4,1:9,3
chr8	26968288	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0023514;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:7,4:13,6
chr8	27525370	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0010271;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:12,5:9,5
chr8	27865789	.	T	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.21429;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,2:2,1:0,1
chr8	28773463	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:4,2:7,6
chr8	30904446	.	CA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0077494;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:6,6:2,2
chr8	31452437	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00015011;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:15,7:11,7
chr8	31903148	.	C	CTTTTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.029748;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:6,5:2,1
chr8	32293718	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:6,3:6,2
chr8	32861894	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0055972;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,9:2,8:5,1
chr8	34653359	.	T	TACACAC	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,11:5,6:6,5
chr8	34981471	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.27277;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:10,2:11,2
chr8	35423852	.	C	CT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.030898;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:11,5:10,2
chr8	35531347	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.016624;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:1,2:4,6
chr8	36989569	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.062277;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:13,1:11,4
chr8	37293591	.	C	CTTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.01204;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:2,4:5,1
chr8	37719760	.	AAAAATCATTTTTTATAAAATGATTTAT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.021554;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:5,4:12,1
chr8	38155939	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,6:4,5:1,1
chr8	38530230	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.20221;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,7:7,6:1,1
chr8	38641551	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00051874;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:17,4:8,10
chr8	38883251	.	CA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.010538;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,10:4,8:3,2
chr8	38889122	.	ATTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:0,2:0,1:0,1
chr8	38933790	.	A	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.22636;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:13,3:9,1
chr8	39862529	.	CAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:3,4:6,1
chr8	40628239	.	G	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00056666;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:9,4:12,7
chr8	40885450	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.001656;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:7,3:9,3
chr8	41899637	.	TA	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.16912;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:7,2:12,2
chr8	43080779	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00011238;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,13:19,5:3,8
chr8	43299102	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.15773;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:4,1:14,3
chr8	43561054	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.01309;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:10,2:13,4
chr8	45928279	.	T	A	0	PASS	DP=251;GPV=1;SPV=0.026298;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:123,17:96,13:27,4
chr8	46948727	.	T	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.015934;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:17,8:12,6
chr8	49391539	.	A	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.001872;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:15,7:18,5
chr8	49706495	.	GT	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.013285;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,6:4,3:5,3
chr8	49918516	.	CAGATAATTTCTTTAGAA	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.027273;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:20,2:14,3
chr8	50455983	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0087456;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:14,2:10,5
chr8	50807212	.	G	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0066036;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:11,6:11,2
chr8	51171654	.	G	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0094722;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:16,6:10,2
chr8	51887745	.	C	CT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.0065492;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:3,5:1,2
chr8	53610444	.	A	ACT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.03602;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:3,2:8,4
chr8	55021486	.	G	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00016802;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:28,16:16,9:12,7
chr8	55213856	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.088235;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:3,2:3,2
chr8	55213864	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,2:5,2
chr8	55730292	.	T	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00032942;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:15,6:10,5
chr8	56106846	.	C	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.02531;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:11,8:5,5
chr8	56533074	.	T	TCACA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0047113;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:5,9:2,7:3,2
chr8	56848939	.	A	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0074736;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:5,2:13,4
chr8	57210828	.	G	C	0	PASS	DP=339;GPV=1;SPV=0.030644;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:205:181,24:126,12:55,12
chr8	57356054	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=6.2405e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:9,5:14,9
chr8	57527689	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.27778;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,2:1,1:2,1
chr8	58261941	.	G	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.026944;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:21,1:10,4
chr8	59456165	.	G	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:0,1:10,3
chr8	59473524	.	C	CAAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.037926;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:4,10:4,10:0,0
chr8	59756155	.	A	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0019356;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:9,4:12,4
chr8	60874150	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00056109;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:12,8:12,3
chr8	61333479	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=8.1152e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:24,17:9,7:15,10
chr8	62305584	.	A	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0019076;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:9,4:17,5
chr8	63498774	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.014722;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:17,3:12,7
chr8	63579606	.	G	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12913;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,5:3,4:6,1
chr8	63584605	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0021565;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:37,11:18,5:19,6
chr8	63783492	.	G	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0014004;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:14,5:10,4
chr8	64504827	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=5.1887e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:5,8:10,3
chr8	65623892	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.038324;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,12:7,8:4,4
chr8	66304830	.	G	GTC	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.1866;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:9,3:2,1
chr8	66357348	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.16794;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,4:13,2:13,2
chr8	67475816	.	TC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.033472;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:3,1:12,7
chr8	68366059	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.11302;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:8,1:13,3
chr8	68789726	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0017011;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,12:17,3:11,9
chr8	70242309	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00034156;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:28,15:12,3:16,12
chr8	71712673	.	T	TTTTTTATATATATATATATATATA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.034172;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,10:12,2:13,8
chr8	71908412	.	T	G	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=5.4865e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,15:12,10:15,5
chr8	71914084	.	CTTTTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.048379;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:9,6:2,1
chr8	72851888	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0064207;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:11,8:4,3
chr8	73465197	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0084627;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,15:9,7:10,8
chr8	73831632	.	T	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0059655;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:6,4:9,1
chr8	74883479	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.016974;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:16,5:13,2
chr8	75424064	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00022212;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:9,4:10,6
chr8	75714037	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0012364;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:12,7:10,3
chr8	75945290	.	T	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0019062;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:14,3:14,7
chr8	76691423	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0012499;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:11,4:11,8
chr8	78001645	.	G	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.035819;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,5:10,3:4,2
chr8	79787710	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,3:1,2:2,1
chr8	79860397	.	C	CT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0057809;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:7,5:11,9
chr8	82761960	.	T	TACACAC	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.14945;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:10,3:4,1
chr8	83059537	.	CGTGT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.027219;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,7:12,6:2,1
chr8	83710933	.	T	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00095522;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:9,6:17,5
chr8	84064952	.	GAATTCTGA	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0040715;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:15,5:11,4
chr8	84563053	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0018707;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:11,4:7,5
chr8	84951535	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.027005;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:6,4:9,4
chr8	86082779	.	T	TTAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.058442;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:4,3:10,1
chr8	87307263	.	T	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.069705;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,5:19,2:15,3
chr8	87323710	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.027099;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:6,4:10,4
chr8	87685190	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.12627;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:15,1:15,3
chr8	87764539	.	C	CCACACACACACACACA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.19203;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:18,3:5,1
chr8	88226876	.	GTATT	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.02975;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:11,7:12,7
chr8	88495491	.	T	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.058905;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:6,2:10,2
chr8	89215700	.	AAT	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,3:0,1
chr8	90307988	.	T	TAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.011343;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,10:5,5:9,5
chr8	92359845	.	G	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.053561;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:21,2:15,3
chr8	93887123	.	A	AG	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:3,2:5,5
chr8	94244272	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:7,1:10,3
chr8	94417480	.	TA	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00751;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:11,7:7,7
chr8	95080164	.	T	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.049659;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:16,1:9,4
chr8	98209445	.	CA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.070365;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,7:13,6:7,1
chr8	99639985	.	GTAA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.091248;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,5:11,2:4,3
chr8	100173752	.	T	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0086598;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:8,4:19,3
chr8	102265001	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0031867;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:17,4:15,6
chr8	102422896	.	A	AATAAT	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0003919;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,11:14,5:11,6
chr8	102422898	.	A	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00014199;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:12,5:12,7
chr8	102988780	.	A	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.05251;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:11,2:4,2
chr8	103757014	.	A	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.17677;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,5:4,2:10,3
chr8	104803651	.	C	CT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.175;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:5,2:0,0
chr8	105877643	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.10294;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:4,1:2,2
chr8	105877656	.	ATATT	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.12384;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:7,3:4,1:3,2
chr8	106283108	.	G	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.028152;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:5,4:10,8
chr8	106704393	.	CTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.28571;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:2,2:0,1:2,1
chr8	106852135	.	T	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.27273;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:4,2:3,1:1,1
chr8	107012898	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0003039;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:8,6:10,4
chr8	107241914	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.16038;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:20,3:12,1
chr8	107342782	.	TACACACACACACAC	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.01623;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,9:5,7:1,2
chr8	107370725	.	G	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,1:6,1
chr8	107681071	.	TA	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0029007;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:4,5:6,1
chr8	109235877	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.037466;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:8,3:4,4
chr8	109725620	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0012739;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:14,8:4,1
chr8	109940110	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0053357;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:5,4:11,2
chr8	110728374	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.25496;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,4:11,2:16,2
chr8	111871255	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0027922;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:16,7:15,4
chr8	113444374	.	G	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.015152;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:0,6:0,2:0,4
chr8	113761203	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0025244;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:15,6:13,3
chr8	114210471	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.037648;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,12:5,9:4,3
chr8	116457834	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=7.4607e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,15:17,6:8,9
chr8	117230448	.	C	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00054703;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:10,8:9,5
chr8	117261582	.	T	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.092375;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:17,3:7,1:10,2
chr8	118002381	.	C	CAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.030629;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,8:8,7:2,1
chr8	118039557	.	CAA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.01093;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:4,5:2,4
chr8	118234710	.	C	CA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.046295;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,9:2,8:12,1
chr8	118366878	.	AAAT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0072004;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:8,4:5,5
chr8	119161003	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.17135;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:10,4:6,1
chr8	119706719	.	TTCTA	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.026393;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:5,1:8,4
chr8	119706737	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.040541;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:5,4:11,1
chr8	119858172	.	C	CAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:8,2:3,2
chr8	121353652	.	CTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.20798;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,4:5,3:3,1
chr8	122102608	.	A	AT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0081097;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:12,8:8,5
chr8	122307907	.	T	TCACA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.019732;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:10,4:8,5
chr8	122314225	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0087456;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:13,4:11,3
chr8	124239204	.	A	AAAAAAAAGAAAG	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.1226;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,6:4,3:7,3
chr8	125477576	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.010154;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:12,2:7,8
chr8	126053788	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00025694;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:26,16:12,11:14,5
chr8	126682726	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.018909;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:13,2:8,3
chr8	128717468	.	G	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:7,3:3,2
chr8	130467443	.	CAAAAAA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.028284;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:3,6:4,1
chr8	130707431	.	A	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=1.8253e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:11,6:12,7
chr8	130934253	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=4.5866e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:12,8:8,4
chr8	131139943	.	T	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0035972;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:12,5:14,3
chr8	132403016	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.20798;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,4:6,3:2,1
chr8	133214050	.	AGT	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.20321;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,3:11,1:7,2
chr8	133445676	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0020609;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:15,5:15,6
chr8	134874840	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.021449;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,12:2,9:5,3
chr8	135262344	.	G	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.094934;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:2,0:18,4
chr8	135536234	.	GTT	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.080632;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:9,5:3,1
chr8	136313794	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.034248;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:12,2:11,3
chr8	136350316	.	A	AGATGTAATG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0066039;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,12:7,5:7,7
chr8	136723179	.	G	GCACACACACA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.025058;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:1,6:1,5:0,1
chr8	137214206	.	GTATATATA	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.039683;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:0,4:0,1:0,3
chr8	138248823	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.015968;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:8,7:4,1
chr8	138613540	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=2.4756e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:26,16:12,5:14,11
chr8	138829403	.	G	GTTTTT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.092308;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,4:3,3:2,1
chr8	143065758	.	CTT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.13842;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:5,3:16,1
chr8	143405337	.	C	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.016594;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:16,6:7,1:9,5
chr8	143430504	.	C	CCCGGCGGGGGCGGGGGGGCG	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0056397;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:6,5:10,6
chr8	144913678	.	A	AACACAC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.051826;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:12,5:5,1
chr9	545752	.	A	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,5:1,4:6,1
chr9	1573639	.	G	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.066411;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:5,1:7,3
chr9	3707361	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0097742;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:11,6:14,2
chr9	6790682	.	A	AAG	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.006192;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,6:2,3:3,3
chr9	6866971	.	TTGTGTG	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,5:4,3:4,2
chr9	7029298	.	T	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.056718;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:10,4:9,1
chr9	8353818	.	ATATATGTATATATGT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.045818;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,8:4,4:13,4
chr9	8870687	.	A	AACACACAC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.010195;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:8,10:7,7:1,3
chr9	9671005	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0048714;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:13,3:13,7
chr9	9878253	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0003601;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:16,9:11,5
chr9	10031987	.	T	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=6.3758e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:14,23:9,13:5,10
chr9	11379751	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.073744;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:13,1:15,3
chr9	11778177	.	C	CAAAAAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.057585;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,7:11,5:7,2
chr9	12922049	.	A	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00054998;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:12,4:14,8
chr9	13345168	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00019093;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:8,8:6,2
chr9	13668785	.	A	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0047434;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:10,6:14,2
chr9	14083479	.	T	TA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.024242;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:1,7:0,4:1,3
chr9	14091075	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.14145;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:16,2:18,2
chr9	15406668	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0051722;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:9,5:5,2
chr9	15774246	.	TAAA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,4:4,2:6,2
chr9	15830968	.	A	AT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.046518;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,13:4,5:7,8
chr9	16779114	.	T	TA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.1538;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,4:14,1:7,3
chr9	16935628	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00022074;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:13,7:10,6
chr9	18735753	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0083519;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:4,6:5,3
chr9	19891171	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0019011;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:15,3:9,6
chr9	20599459	.	A	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.099099;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,4:9,1:9,3
chr9	23070620	.	C	CAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.057736;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:18,6:2,1
chr9	25595525	.	CTT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.034438;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:9,5:5,3
chr9	26249433	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00080797;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:19,4:6,7
chr9	26369801	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.024724;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,8:5,7:0,1
chr9	26621231	.	G	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00052875;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:17,3:7,7
chr9	26645167	.	TAC	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.050612;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:5,3:7,1
chr9	27403516	.	ATTT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,10:3,4:4,6
chr9	27444154	.	A	AGAAG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0012598;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,13:8,8:3,5
chr9	27691811	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.11013;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:10,1:12,3
chr9	27825162	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0011908;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:12,5:15,7
chr9	29898309	.	C	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00067124;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:11,7:14,4
chr9	30518419	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0044113;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:13,2:10,7
chr9	31290559	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0014939;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:14,4:8,6
chr9	32577585	.	G	GT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.025825;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,9:11,7:5,2
chr9	32769927	.	C	CAGAGAG	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:8,12:3,9:5,3
chr9	33317433	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.01269;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:4,4:11,1
chr9	34301987	.	ATT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.20342;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:13,1:5,3
chr9	34636320	.	A	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:4,2:0,1:4,1
chr9	36187024	.	CTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12913;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,5:2,4:7,1
chr9	37258757	.	T	TA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.14279;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,5:15,4:1,1
chr9	37377794	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.17677;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,5:7,1:7,4
chr9	37384136	.	TTTCCTTCC	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0047325;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:4,5:7,2
chr9	37649466	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=3.8209e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:18,19:10,12:8,7
chr9	37741450	.	G	GAC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,6:3,4:2,2
chr9	38983868	.	C	T	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.042309;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:52,9:18,7:34,2
chr9	38993833	.	C	T	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.045773;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:76,13:23,3:53,10
chr9	39002559	.	T	G	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.031751;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:61,17:30,8:31,9
chr9	39584576	.	C	CAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.026636;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,6:2,4:4,2
chr9	39586459	.	G	T	0	PASS	DP=138;GPV=1;SPV=0.0060513;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:71,9:55,5:16,4
chr9	39625941	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.15152;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:22,3:16,2:6,1
chr9	39776863	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:13,4:0,0
chr9	39818290	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.059274;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:13,3:5,1
chr9	40716658	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.081606;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:23,2:14,3
chr9	40971176	.	A	C	0	PASS	DP=233;GPV=1;SPV=0.029454;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:122:104,18:47,8:57,10
chr9	41000264	.	T	G	0	PASS	DP=175;GPV=1;SPV=0.036965;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:101:84,17:39,6:45,11
chr9	41082797	.	C	T	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.0069784;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:63,9:24,6:39,3
chr9	41158015	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.037533;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:7,2:4,5
chr9	41184026	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.023196;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:13,6:14,1
chr9	41234892	.	C	A	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.00011711;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:101:85,16:17,11:68,5
chr9	41241909	.	T	C	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.031176;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:53,12:24,2:29,10
chr9	41266616	.	C	T	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.03955;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:47,12:32,9:15,3
chr9	41294007	.	G	A	0	PASS	DP=158;GPV=1;SPV=0.024194;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:75,16:29,5:46,11
chr9	41474195	.	A	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.025784;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:8,2:10,5
chr9	41697097	.	C	CA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.11505;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:20,1:11,3
chr9	41803726	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.036397;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:13,1:14,3
chr9	42158933	.	CAGACTGGACT	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=7.8055e-05;SS=2;SSC=41;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:13,9:12,5
chr9	42164810	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.15576;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:16,1:21,4
chr9	43181108	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.13544;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:16,2:17,2
chr9	43301126	.	A	T	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.014473;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:61,7:29,5:32,2
chr9	43301142	.	ATATT	A	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.013323;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:57,7:29,6:28,1
chr9	43301203	.	TTG	T	0	PASS	DP=134;GPV=1;SPV=0.0090494;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:68,8:34,6:34,2
chr9	44027408	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.19203;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:9,3:14,1
chr9	44030494	.	G	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
chr9	44545523	.	A	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.07478;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:14,4:0,0
chr9	45308796	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:0,0:10,4
chr9	60568577	.	C	G	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.040799;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:52,9:36,4:16,5
chr9	60575712	.	CA	C	0	PASS	DP=198;GPV=1;SPV=0.033306;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:87,15:43,9:44,6
chr9	60575716	.	G	C	0	PASS	DP=194;GPV=1;SPV=0.047582;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:92,15:40,9:52,6
chr9	61174867	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.11076;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:8,3:10,1
chr9	61562987	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.034805;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:15,7:12,1
chr9	61846153	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:0,0:15,4
chr9	61915381	.	T	C	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.046035;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:49,9:25,8:24,1
chr9	62307653	.	A	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:7,4:0,0
chr9	62748136	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.047306;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:10,7:14,4
chr9	63039174	.	T	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.004644;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:1,3:4,4
chr9	63759448	.	C	T	0	PASS	DP=224;GPV=1;SPV=0.02963;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:103,15:39,6:64,9
chr9	63825097	.	T	C	0	PASS	DP=412;GPV=1;SPV=0.035766;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:242:216,26:65,5:151,21
chr9	63885664	.	C	G	0	PASS	DP=170;GPV=1;SPV=0.014958;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:86,10:48,5:38,5
chr9	64082964	.	TTATATATA	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10784;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:7,2:0,2
chr9	64109795	.	C	CAATT	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0015933;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:34,16:16,8:18,8
chr9	64446417	.	A	G	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.015578;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:49,7:29,3:20,4
chr9	64469826	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:2,2:5,2
chr9	64722888	.	T	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:11,4:0,0
chr9	65061096	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.07699;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:2,1:13,4
chr9	65377823	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.012829;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:15,5:2,2
chr9	65514830	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.03355;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:41,8:24,6:17,2
chr9	65551509	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.023216;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:10,7:18,6
chr9	65554563	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.025087;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:14,1:9,7
chr9	65650975	.	C	T	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=0.038338;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:66,18:30,16:36,2
chr9	65770295	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.15715;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:9,1:26,4
chr9	66160564	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.011804;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:14,7:13,5
chr9	66261718	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.016158;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:19,6:7,1
chr9	66369884	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.028693;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:13,7:10,1
chr9	67085333	.	AATTT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.064151;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:13,2:6,4
chr9	67630851	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.20137;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:15,2:15,2
chr9	67787558	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.038355;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:1,1:24,10
chr9	67798387	.	C	A	0	PASS	DP=194;GPV=1;SPV=0.020786;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:109:86,23:33,10:53,13
chr9	67832491	.	A	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.011315;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:8,2:10,7
chr9	67881117	.	T	A	0	PASS	DP=140;GPV=1;SPV=0.0052956;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:71,9:40,8:31,1
chr9	68287357	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.006964;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:13,5:8,4
chr9	69696380	.	A	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.018392;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:12,5:11,1
chr9	72132286	.	A	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0026089;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:11,4:13,5
chr9	74125462	.	G	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00044867;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:9,4:9,6
chr9	74319090	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0032501;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:7,3:9,3
chr9	74361818	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=4.9557e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:18,5:5,9
chr9	77048262	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=8.3349e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,15:6,7:8,8
chr9	79695351	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.028109;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:9,5:13,3
chr9	80580189	.	C	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00011357;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:13,7:11,6
chr9	81013339	.	G	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00064075;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:12,8:14,2
chr9	83008891	.	C	CTCATATATATAT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.14706;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:7,3:5,2:2,1
chr9	83479785	.	G	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.035088;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:6,4:0,0
chr9	85700487	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.031142;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:15,1:15,4
chr9	86510989	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00071247;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:8,8:10,4
chr9	87239049	.	G	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0028443;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:10,3:18,5
chr9	87518485	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.034541;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:8,11:14,6
chr9	88112566	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.1733;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:8,1:15,3
chr9	89979293	.	G	GT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.035742;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,8:13,6:4,2
chr9	90429584	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.064526;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:17,2:10,2
chr9	90526339	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.094934;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:12,2:8,2
chr9	93023795	.	CTTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.026248;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,7:5,4:3,3
chr9	93074431	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:4,4:1,1
chr9	96727745	.	A	AT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:6,3:4,1
chr9	99841231	.	G	GA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.008316;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:8,5:5,1
chr9	101181127	.	A	ATG	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.16725;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,4:6,3:4,1
chr9	102099034	.	T	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00046907;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:13,7:11,5
chr9	102208043	.	C	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00035208;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:14,8:9,6
chr9	103543037	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0033765;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:9,3:15,4
chr9	104528724	.	C	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00088456;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:13,5:7,6
chr9	104944790	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:1,2:1,2:0,0
chr9	105162046	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.017149;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,10:3,6:3,4
chr9	105654873	.	CTG	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0024274;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:8,12:6,9:2,3
chr9	108743292	.	ATATG	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.034547;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:8,6:6,1
chr9	110433364	.	CAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,7:3,4:1,3
chr9	111499821	.	CA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.006192;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:3,5:2,1
chr9	112515042	.	G	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1184;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:15,4:1,0
chr9	113061748	.	C	T	0	PASS	DP=206;GPV=1;SPV=0.033714;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:124:99,25:32,14:67,11
chr9	113257478	.	AT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.013999;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,7:5,4:2,3
chr9	114660862	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.028284;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:1,3:6,4
chr9	115271886	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.004902;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:2,12:0,7:2,5
chr9	116998569	.	CCATA	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.13598;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:13,1:17,3
chr9	117043907	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0043505;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,7:4,5:5,2
chr9	117067055	.	G	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.11013;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:12,1:10,3
chr9	117585579	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0039611;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:20,20:9,11:11,9
chr9	117975199	.	T	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0066857;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:10,5:11,2
chr9	119366504	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:4,10:2,5:2,5
chr9	119800001	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:3,1:4,1
chr9	120020055	.	T	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.07519;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:17,1:19,3
chr9	121544139	.	CATAT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.02381;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:0,5:0,2:0,3
chr9	121858266	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.013337;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:17,3:9,3
chr9	122727039	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.010718;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,9:3,7:2,2
chr9	126511387	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.04741;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:8,7:5,1
chr9	127021497	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=1.904e-05;SS=2;SSC=47;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,16:3,13:4,3
chr9	127471472	.	T	TA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.023537;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,5:2,4:5,1
chr9	127713496	.	CTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,4:5,2:4,2
chr9	128083513	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.034783;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:3,3:7,3
chr9	130409638	.	G	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0025617;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:16,4:13,4
chr9	132105907	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0099286;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:14,5:17,4
chr9	132188636	.	T	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=3.9192e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:36,14:18,8:18,6
chr9	132832063	.	GA	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:9,4:1,0
chr9	134098711	.	T	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=1.8301e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,15:13,9:14,6
chr9	134948374	.	T	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0011495;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:12,7:15,6
chr9	136131338	.	C	CGGG	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,4:2,4:0,0
chr9	136150424	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.18039;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:5,1:15,3
chr9	136725211	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.03183;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:6,6:6,3
chr9	136889990	.	TGA	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=5.7121e-05;SS=2;SSC=42;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:8,16:3,7:5,9
chr9	138129089	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.12919;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,4:10,3:10,1
chr9	138144598	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:10,1:2,3
chr9	138214206	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.018754;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:17,1:17,6
chr9	138237340	.	AG	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:8,4:1,1
chrX	2904903	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0070433;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,9:4,8:1,1
chrX	3534618	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=2.1749e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:5,5:9,5
chrX	3653799	.	A	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.074074;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:3,1:3,1
chrX	3740839	.	A	AAAAAG	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.097902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,4:4,3:0,1
chrX	6584770	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.040303;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:6,1:6,4
chrX	8498537	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.031621;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:5,2:0,1
chrX	8594688	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0017181;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:2,10:1,7:1,3
chrX	8594703	.	TATATATACAC	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.004156;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,9:3,6:1,3
chrX	9404939	.	C	G	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.044225;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,9:16,6:21,3
chrX	9405966	.	G	A	0	PASS	DP=340;GPV=1;SPV=0.0049026;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:160:141,19:76,7:65,12
chrX	9410334	.	T	C	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.035719;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:63,8:21,1:42,7
chrX	9411980	.	C	A	0	PASS	DP=281;GPV=1;SPV=0.0018742;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:123:107,16:49,8:58,8
chrX	9973248	.	C	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=3.4015e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:8,4:11,10
chrX	10648510	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0017074;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:9,3:6,4
chrX	11411183	.	T	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.17857;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,3:0,0:2,3
chrX	11412688	.	C	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=2.2035e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:5,5:4,6
chrX	11679886	.	TTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.038233;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,7:7,3:5,4
chrX	13600283	.	T	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:6,1:1,1
chrX	15059829	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.00017781;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:4,5:5,4
chrX	15398102	.	T	TG	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.00018275;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,9:1,8:2,1
chrX	15746022	.	CT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.0091688;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,8:2,6:1,2
chrX	16231503	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.073684;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:3,2:3,1
chrX	16355097	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.040959;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:1,3:1,2:0,1
chrX	21945634	.	T	TCC	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.011438;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,4:0,0:3,4
chrX	22375511	.	T	TGAGAGAGA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.014934;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:5,3:4,4
chrX	22899014	.	ATG	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.020407;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:7,3:5,3
chrX	23377575	.	GGTGT	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.037596;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:6,3:4,4
chrX	23500147	.	T	TTTTTATTTTATTTTA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.033054;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:1,5:8,3
chrX	24617371	.	G	GT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0064996;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,9:1,7:3,2
chrX	24660678	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0098951;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:2,4:5,3
chrX	25828071	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.016117;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,4:4,1:3,3
chrX	25998490	.	G	GCACACACACACACACACACA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0011899;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,8:3,7:2,1
chrX	26326024	.	ATGTTTGTT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.013215;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:5,5:7,4
chrX	27975047	.	TAC	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00041615;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:12,16:4,10:8,6
chrX	28969902	.	AAC	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.011818;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:4,4:8,3
chrX	28981090	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.047386;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,4:2,3:1,1
chrX	30638324	.	T	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0021778;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,8:1,2:4,6
chrX	32975346	.	C	CT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:3,4:1,1
chrX	34423647	.	C	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.06993;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:3,3:2,2:1,1
chrX	36949507	.	C	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00061448;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:3,2:6,4
chrX	38917230	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=1.9105e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:12,8:7,10
chrX	40914902	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00070944;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:3,7:2,2:1,5
chrX	41272377	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.065801;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:4,1:11,3
chrX	41290837	.	CAA	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.022967;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,7:2,5:1,2
chrX	42871500	.	C	CGTGT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.042556;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,7:7,5:5,2
chrX	42891118	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.040008;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:7,4:9,5
chrX	42894141	.	A	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:6,5:5,3
chrX	42972776	.	T	TAGAAAAACAAGATCCGAGAAG	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.046756;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,9:11,4:12,5
chrX	44594077	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.2381;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:3,3:1,2:2,1
chrX	44803555	.	G	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.036129;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,13:6,10:8,3
chrX	44963440	.	A	AGT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.15083;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,4:7,3:17,1
chrX	47579180	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=8.8092e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:13,6:8,6
chrX	48529848	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=6.1566e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,17:12,7:7,10
chrX	49346058	.	T	A	0	PASS	DP=486;GPV=1;SPV=0.03642;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:278:234,43:118,26:116,17
chrX	49619948	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.043835;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:8,2:14,2
chrX	49619950	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.048259;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:12,2:12,2
chrX	51421220	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00025408;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:12,3:11,9
chrX	52419147	.	C	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00075376;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:36,14:16,7:20,7
chrX	53023677	.	AT	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.02002;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:4,4:8,5
chrX	54226092	.	AC	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.00077284;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,13:4,11:2,2
chrX	54270399	.	CT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.029934;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:12,5:6,1
chrX	54685643	.	T	TTC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.040404;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:4,2:9,2
chrX	54923568	.	G	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=2.6553e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:30,18:11,9:19,9
chrX	55564766	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0071969;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:14,6:14,7
chrX	56915260	.	CAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.029748;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:4,5:4,1
chrX	57744654	.	G	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=1.048e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:16,3:7,10
chrX	60240358	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0091975;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:26,6:6,2
chrX	61341951	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.046535;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:2,1:41,5
chrX	62741422	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0035775;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:13,3:9,4
chrX	64611760	.	A	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00017112;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:14,6:12,7
chrX	64699661	.	G	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0011798;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:15,6:8,6
chrX	64793574	.	G	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.002842;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:35,12:18,5:17,7
chrX	65450670	.	C	CAT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.037185;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:6,2:3,4
chrX	65810417	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0055487;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:11,3:20,6
chrX	66218774	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00016675;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:19,21:8,6:11,15
chrX	66303397	.	A	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.054139;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:10,2:22,6
chrX	66472390	.	C	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0021701;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:36,10:16,5:20,5
chrX	67150890	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0083333;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:17:0,3:0,2:0,1
chrX	67150912	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.49123;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,4:9,1:4,3
chrX	67419912	.	G	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00064966;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:12,3:17,8
chrX	67992259	.	CAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.017544;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,8:5,7:2,1
chrX	73061472	.	T	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.000163;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:17,5:14,9
chrX	73361697	.	C	CT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.013595;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:5,5:0,2
chrX	74744950	.	T	TC	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.076628;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,4:5,2:7,2
chrX	76790727	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:9,4:0,0
chrX	78979489	.	T	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.027364;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:13,3:14,3
chrX	79578104	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.066077;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:14,4:8,1
chrX	79748440	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00010913;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:9,7:9,6
chrX	80039055	.	C	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00027813;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:7,3:16,10
chrX	81140559	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.11424;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:10,5:5,1
chrX	81773446	.	A	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=6.6326e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:6,7:6,2
chrX	82101828	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.002634;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:11,3:12,6
chrX	83560970	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.048309;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,7:2,3:7,4
chrX	85615846	.	A	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.014806;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:14,2:13,7
chrX	86368530	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0008518;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:14,4:8,5
chrX	86753077	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.14178;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:18,5:10,2:8,3
chrX	87738329	.	AT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.030075;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:3,4:4,1
chrX	87741877	.	T	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0040858;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:13,5:17,3
chrX	88399377	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00040909;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:13,5:9,4
chrX	88501121	.	CA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,7:3,6:4,1
chrX	88632183	.	A	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.000837;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:13,3:6,7
chrX	88674609	.	A	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00016223;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:5,7:10,4
chrX	89407083	.	G	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.005596;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:9,3:9,4
chrX	89426842	.	A	ATAT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,4:5,3:6,1
chrX	89426855	.	AT	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.041126;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:8,4:7,1
chrX	89504923	.	C	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.016081;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:10,4:11,3
chrX	89755313	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00012155;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,11:0,4:8,7
chrX	89783722	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=6.0385e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,12:2,5:5,7
chrX	89965420	.	A	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.020544;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:8,3:4,6
chrX	89965421	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:7,3:4,5
chrX	90351880	.	G	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.016081;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:5,3:16,4
chrX	90950728	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.013018;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:40,8:19,5:21,3
chrX	93311798	.	TA	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,4:3,2:1,2
chrX	93452164	.	G	GTA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.024751;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,7:7,3:5,4
chrX	94925670	.	GAA	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.018634;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:6,4:1,1
chrX	96018623	.	C	CA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0019356;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,8:12,6:9,2
chrX	96980998	.	C	CAAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.1088;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:11,4:4,1
chrX	97145325	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.037203;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:5,2:9,2
chrX	97161051	.	G	GT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0033;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,9:3,5:5,4
chrX	99836512	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0015923;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:16,3:7,10
chrX	100321805	.	TC	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,8:4,2:4,6
chrX	101405236	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.025362;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,7:10,5:5,2
chrX	102420569	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.013211;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:14,4:10,6
chrX	102824103	.	C	CTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:4,3:8,1
chrX	107038536	.	G	GAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.30409;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,4:7,3:5,1
chrX	108444223	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.017848;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:5,4:3,4
chrX	108775705	.	ACAT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.022078;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:8,4:10,2
chrX	109041056	.	T	TATA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.13283;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:16,3:12,1
chrX	109057693	.	T	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.018356;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:8,3:5,4
chrX	110689536	.	C	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.24893;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:18,2:6,2
chrX	110689544	.	C	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.083717;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:15,3:7,4
chrX	111820197	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.036325;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:16,2:14,3
chrX	113914381	.	TGGGGCCTCCA	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0020037;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:34,14:16,9:18,5
chrX	115698647	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.016999;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:1,5:6,1
chrX	115885482	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.049123;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:0,0:5,3
chrX	116116510	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.024328;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:6,2:4,4
chrX	116284047	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,4:1,1:2,3
chrX	117233726	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.04058;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:16,3:10,2
chrX	117472419	.	CAA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.080632;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:5,3:7,3
chrX	118626065	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.05132;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,3:6,1
chrX	119823558	.	C	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,2:4,1:0,1
chrX	120582061	.	GAA	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.034533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,5:3,4:2,1
chrX	120694831	.	TTCTCTTTC	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.097251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:4,2:10,2
chrX	122374580	.	C	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0028662;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:7,3:10,5
chrX	122743892	.	CTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,4:5,3:2,1
chrX	123306392	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00091169;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:10,3:9,6
chrX	124028985	.	TTA	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.029938;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,11:9,7:8,4
chrX	124028993	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.028152;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:4,6:11,5
chrX	124179087	.	T	TACACACACACACACACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.089257;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:8,3:10,2
chrX	125697474	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0063951;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:23,4:8,5
chrX	126030636	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0038133;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:11,2:16,11
chrX	126477462	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=7.6729e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:11,5:6,6
chrX	126605126	.	C	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0049682;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:5,5:13,3
chrX	127192185	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.047124;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:10,2:5,2
chrX	127533529	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,2:5,2
chrX	128447366	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=2.2678e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,14:8,9:6,5
chrX	129058522	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00068429;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:10,9:13,2
chrX	129368973	.	G	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0047009;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:2,2:4,3
chrX	129606990	.	A	AGAAG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.074336;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,5:12,3:10,2
chrX	131500587	.	G	GAAAAGA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.32967;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,3:4,2:3,1
chrX	131861544	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00039513;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:15,3:11,8
chrX	134571038	.	T	TA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0029872;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:11,4:9,4
chrX	135523978	.	T	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0019773;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:10,3:14,4
chrX	136904766	.	T	TA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.017286;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,13:7,4:7,9
chrX	138341932	.	T	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.011374;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:1,3:4,7
chrX	139082520	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0035775;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:9,5:13,2
chrX	141695017	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.025802;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:12,3:11,5
chrX	141790862	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.036947;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:7,1:14,5
chrX	142118797	.	A	AAAAG	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.033189;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:8,5:9,4
chrX	142298163	.	C	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=3.3767e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:18,7:8,7
chrX	143689782	.	A	ATTACCAGTTAGATAACCAAACT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0034744;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:12,6:15,8
chrX	143689783	.	C	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.024998;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,14:13,6:15,8
chrX	144486319	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.019629;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:12,3:18,7
chrX	144516420	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0011981;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:15,7:16,5
chrX	144668547	.	TATGC	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.020668;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:3,3:8,1
chrX	145443745	.	C	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0074736;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:9,3:9,3
chrX	145550923	.	C	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0057104;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:11,5:10,4
chrX	145601392	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.029934;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:14,5:4,1
chrX	147036928	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.037648;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,7:6,6:3,1
chrX	148704244	.	TTA	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.031028;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:12,4:8,1
chrX	149424245	.	GCCCAGTAGCCCTACTGGGTGGCTAGA	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.031869;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:11,2:6,6
chrX	150327631	.	AAAG	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.060295;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:13,1:14,3
chrX	151806088	.	A	ATGTG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,8:4,5:5,3
chrX	154088031	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.003465;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:9,4:8,3
chrX	154941879	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0091605;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:7,2:9,4
chrX	155470241	.	T	TATAA	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.025403;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:39,15:23,11:16,4
chrY	11184593	.	C	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.20294;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:12,1:8,3
chrY	11185093	.	T	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.062963;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:4,3:8,2
chrY	11188522	.	A	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.039138;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:9,3:10,2
chrY	11221710	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.074416;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:39,6:14,3:25,3
chrY	11239989	.	G	A	0	PASS	DP=167;GPV=1;SPV=0.043031;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:71,17:54,13:17,4
chrY	11247437	.	T	C	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.024624;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:52,7:30,4:22,3
chrY	11267878	.	G	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0041457;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:38,9:13,5:25,4
chrY	11280293	.	A	T	0	PASS	DP=400;GPV=1;SPV=0.015554;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:218:179,39:80,23:99,16
chrY	56834173	.	C	T	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.043963;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:71,12:29,4:42,8
chrY	56851994	.	G	A	0	PASS	DP=275;GPV=1;SPV=0.043257;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:157:130,27:71,10:59,17
chrY	56853118	.	A	C	0	PASS	DP=271;GPV=1;SPV=0.013381;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:153:118,28:61,12:57,16
chrY	56864412	.	C	A	0	PASS	DP=533;GPV=1;SPV=0.017044;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:293:258,35:134,19:124,16
chrY	56870747	.	A	G	0	PASS	DP=258;GPV=1;SPV=0.03366;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:151:133,18:72,11:61,7
chrY	56875350	.	A	C	0	PASS	DP=581;GPV=1;SPV=0.025519;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:292:257,35:131,16:126,19
chrY	56875498	.	C	T	0	PASS	DP=426;GPV=1;SPV=0.0029475;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:232:201,31:107,12:94,19
chrY	56875990	.	G	C	0	PASS	DP=420;GPV=1;SPV=0.01275;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:219:191,28:88,15:103,13
chrY	56886877	.	C	T	0	PASS	DP=138;GPV=1;SPV=0.014715;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:62,11:26,6:36,5