annotate test-data/refBased_test_data/marker_genes.csv @ 0:4f6d716e5da2 draft

planemo upload for repository https://github.com/goeckslab/tools-st/tree/main/tools/bayesTME commit 26edd05a863adac97cb54a9fb2ae5613ce95df50

gene_name,rank_in_cell_type,cell_type
BRI3,0,1
SRSF3,1,1
IFITM3,2,1
LSM3,3,1
MYL6,4,1
AGR2,5,1
CPNE3,6,1
TOMM5,7,1
SNRPG,8,1
MORF4L2,9,1
APOE,10,1
TOMM7,11,1
RAD21,12,1
GFRA1,13,1
WBP1,14,1
CCT2,15,1
NAA20,16,1
NOP10,17,1
DHX30,18,1
HLA-DRA,19,1
KRT10,20,1
RARRES2,21,1
SRSF5,22,1
HMGA1,23,1
MT2A,24,1
POMP,25,1
TKT,26,1
TMED10,27,1
TSTD1,28,1
CNIH4,29,1
PSMD2,30,1
RABEP1,31,1
APEX1,32,1
TYROBP,33,1
BANF1,34,1
SNRPE,35,1
ACADSB,36,1
HSP90AB1,37,1
PRDX3,38,1
CSTB,39,1
CNIH4,0,2
ACADSB,1,2
TKT,2,2
HSP90AB1,3,2
RAD21,4,2
WBP1,5,2
CCT2,6,2
HMGA1,7,2
BANF1,8,2
HLA-DRA,9,2
TSTD1,10,2
PSMD2,11,2
POMP,12,2
BRI3,13,2
MT2A,14,2
MORF4L2,15,2
TOMM7,16,2
RARRES2,17,2
SNRPG,18,2
APEX1,19,2
AGR2,20,2
NAA20,21,2
NOP10,22,2
TMED10,23,2
TOMM5,24,2
KRT10,25,2
DHX30,26,2
TYROBP,27,2
PRDX3,28,2
SRSF3,29,2
SNRPE,30,2
IFITM3,31,2
RABEP1,32,2
GFRA1,33,2
LSM3,34,2
CPNE3,35,2
APOE,36,2
SRSF5,37,2
MYL6,38,2
CSTB,39,2
MT2A,0,3
WBP1,1,3
CSTB,2,3
SRSF5,3,3
NOP10,4,3
TMED10,5,3
SRSF3,6,3
DHX30,7,3
MYL6,8,3
TYROBP,9,3
TSTD1,10,3
APOE,11,3
CCT2,12,3
RAD21,13,3
CPNE3,14,3
NAA20,15,3
LSM3,16,3
ACADSB,17,3
RARRES2,18,3
RABEP1,19,3
TOMM5,20,3
SNRPE,21,3
TKT,22,3
IFITM3,23,3
PRDX3,24,3
HMGA1,25,3
HLA-DRA,26,3
POMP,27,3
HSP90AB1,28,3
KRT10,29,3
TOMM7,30,3
MORF4L2,31,3
BANF1,32,3
APEX1,33,3
AGR2,34,3
SNRPG,35,3
GFRA1,36,3
PSMD2,37,3
CNIH4,38,3
BRI3,39,3
RABEP1,0,4
PRDX3,1,4
HSP90AB1,2,4
SNRPE,3,4
TYROBP,4,4
SRSF5,5,4
RAD21,6,4
RARRES2,7,4
POMP,8,4
NAA20,9,4
TKT,10,4
MYL6,11,4
CCT2,12,4
GFRA1,13,4
SRSF3,14,4
ACADSB,15,4
NOP10,16,4
TOMM7,17,4
BANF1,18,4
HMGA1,19,4
APEX1,20,4
CSTB,21,4
TMED10,22,4
AGR2,23,4
TSTD1,24,4
HLA-DRA,25,4
CNIH4,26,4
TOMM5,27,4
MORF4L2,28,4
PSMD2,29,4
KRT10,30,4
IFITM3,31,4
LSM3,32,4
DHX30,33,4
MT2A,34,4
WBP1,35,4
CPNE3,36,4
SNRPG,37,4
APOE,38,4
BRI3,39,4
APEX1,0,5
CPNE3,1,5
CNIH4,2,5
CSTB,3,5
BANF1,4,5
HLA-DRA,5,5
TOMM5,6,5
MT2A,7,5
MYL6,8,5
KRT10,9,5
SNRPE,10,5
TMED10,11,5
POMP,12,5
AGR2,13,5
MORF4L2,14,5
LSM3,15,5
PRDX3,16,5
APOE,17,5
HSP90AB1,18,5
TYROBP,19,5
HMGA1,20,5
NOP10,21,5
DHX30,22,5
CCT2,23,5
SRSF3,24,5
SNRPG,25,5
PSMD2,26,5
TSTD1,27,5
GFRA1,28,5
RABEP1,29,5
WBP1,30,5
TOMM7,31,5
IFITM3,32,5
TKT,33,5
NAA20,34,5
ACADSB,35,5
RAD21,36,5
RARRES2,37,5
BRI3,38,5
SRSF5,39,5
PSMD2,0,6
GFRA1,1,6
DHX30,2,6
SNRPG,3,6
KRT10,4,6
IFITM3,5,6
APOE,6,6
SNRPE,7,6
LSM3,8,6
SRSF5,9,6
AGR2,10,6
ACADSB,11,6
TKT,12,6
RARRES2,13,6
HLA-DRA,14,6
HMGA1,15,6
TYROBP,16,6
PRDX3,17,6
NAA20,18,6
BRI3,19,6
TOMM7,20,6
TSTD1,21,6
BANF1,22,6
RABEP1,23,6
POMP,24,6
MORF4L2,25,6
CPNE3,26,6
APEX1,27,6
TOMM5,28,6
CSTB,29,6
TMED10,30,6
NOP10,31,6
RAD21,32,6
WBP1,33,6
MYL6,34,6
CCT2,35,6
HSP90AB1,36,6
SRSF3,37,6
CNIH4,38,6
MT2A,39,6